MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 8058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013223	GCG	2	6	1236197	1236202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_013223	CAG	2	6	1241808	1241813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_013223	GCC	2	6	1241844	1241849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_013223	GAC	2	6	1241868	1241873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_013223	A	6	6	1241899	1241904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_013223	TTC	2	6	1241919	1241924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_013223	TTC	2	6	1241953	1241958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_013223	TCG	2	6	1241992	1241997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_013223	GTC	2	6	1242014	1242019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_013223	A	6	6	1242046	1242051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_013223	T	7	7	1242082	1242088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_013223	GCAC	2	8	1243250	1243257	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3513	NC_013223	GC	3	6	1243274	1243279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_013223	CAG	2	6	1243321	1243326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_013223	T	7	7	1247950	1247956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_013223	A	6	6	1248955	1248960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_013223	GA	3	6	1248964	1248969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_013223	TC	3	6	1248979	1248984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3519	NC_013223	T	6	6	1248988	1248993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_013223	AGC	2	6	1249009	1249014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_013223	TAT	2	6	1250287	1250292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_013223	G	6	6	1250938	1250943	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013223	GT	3	6	1251040	1251045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_013223	GCT	2	6	1251128	1251133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_013223	ACGA	2	8	1251150	1251157	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_013223	AGC	2	6	1253338	1253343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_013223	GAA	2	6	1253408	1253413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013223	CGG	2	6	1253427	1253432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_013223	CGA	2	6	1255001	1255006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_013223	TGA	2	6	1255697	1255702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_013223	A	6	6	1255702	1255707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_013223	GGC	2	6	1255924	1255929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_013223	GCT	2	6	1255975	1255980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_013223	GGT	2	6	1255981	1255986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_013223	T	6	6	1256029	1256034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_013223	GC	3	6	1256041	1256046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3537	NC_013223	GTG	2	6	1257990	1257995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013223	G	6	6	1262080	1262085	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013223	GGCC	2	8	1262139	1262146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3540	NC_013223	GGCC	2	8	1262158	1262165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3541	NC_013223	GGT	2	6	1265346	1265351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_013223	CGC	2	6	1265404	1265409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_013223	G	6	6	1265411	1265416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_013223	GCA	2	6	1265439	1265444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_013223	GGC	2	6	1267034	1267039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_013223	GAA	2	6	1267062	1267067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_013223	GCC	2	6	1267176	1267181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_013223	GAGC	2	8	1267231	1267238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_013223	ACA	2	6	1268489	1268494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_013223	GTG	2	6	1269671	1269676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013223	TGCGC	2	10	1269683	1269692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3552	NC_013223	CCT	2	6	1270620	1270625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_013223	CTG	2	6	1271686	1271691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_013223	CAT	2	6	1271696	1271701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_013223	GGGAAG	2	12	1272578	1272589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_013223	TTTG	2	8	1272713	1272720	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013223	ACA	2	6	1272741	1272746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_013223	CA	3	6	1272754	1272759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_013223	A	6	6	1274630	1274635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_013223	T	6	6	1274662	1274667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_013223	GC	3	6	1274668	1274673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_013223	GGC	2	6	1276165	1276170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_013223	GGA	2	6	1276209	1276214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013223	GTC	2	6	1277221	1277226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_013223	GTG	2	6	1281787	1281792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_013223	TG	3	6	1281868	1281873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_013223	CCG	2	6	1283537	1283542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_013223	TGC	2	6	1283562	1283567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_013223	GGT	2	6	1283593	1283598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_013223	CT	3	6	1284348	1284353	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3571	NC_013223	CTC	2	6	1285166	1285171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_013223	AATC	2	8	1285242	1285249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3573	NC_013223	GA	3	6	1285273	1285278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_013223	ACC	2	6	1285288	1285293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_013223	GGA	2	6	1285339	1285344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_013223	AGG	2	6	1285357	1285362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_013223	ACG	2	6	1285957	1285962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_013223	C	7	7	1287891	1287897	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3579	NC_013223	GGTC	2	8	1287902	1287909	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3580	NC_013223	GATC	2	8	1287964	1287971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_013223	TGG	2	6	1287982	1287987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_013223	CGCC	2	8	1287991	1287998	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3583	NC_013223	AAG	2	6	1288003	1288008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_013223	GGCA	2	8	1288547	1288554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3585	NC_013223	CG	3	6	1288580	1288585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_013223	TACG	2	8	1288588	1288595	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3587	NC_013223	GCT	3	9	1288746	1288754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_013223	GTC	2	6	1288768	1288773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_013223	GCCC	2	8	1290327	1290334	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3590	NC_013223	T	6	6	1290336	1290341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_013223	AGGCG	2	10	1290436	1290445	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3592	NC_013223	T	6	6	1290486	1290491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_013223	CGGT	2	8	1295767	1295774	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3594	NC_013223	GT	3	6	1295826	1295831	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_013223	CCGG	2	8	1297089	1297096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3596	NC_013223	CG	3	6	1297102	1297107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3597	NC_013223	CGGA	2	8	1297138	1297145	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_013223	GGC	2	6	1297176	1297181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_013223	GTT	2	6	1297228	1297233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_013223	AACG	2	8	1297271	1297278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3601	NC_013223	AGG	2	6	1297312	1297317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_013223	AAGGC	2	10	1298256	1298265	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3603	NC_013223	CT	3	6	1299395	1299400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_013223	T	6	6	1299487	1299492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_013223	CTGGCC	2	12	1299558	1299569	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3606	NC_013223	GTC	2	6	1299577	1299582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_013223	TCGGC	2	10	1299593	1299602	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3608	NC_013223	TGT	2	6	1299628	1299633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_013223	CGGCTC	2	12	1301911	1301922	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_013223	A	7	7	1302034	1302040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_013223	A	7	7	1302979	1302985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_013223	ACA	2	6	1303041	1303046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_013223	GCT	2	6	1303054	1303059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_013223	GCC	2	6	1303094	1303099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_013223	ATC	3	9	1303112	1303120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_013223	GAGG	2	8	1303137	1303144	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_013223	ACG	2	6	1303232	1303237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_013223	T	8	8	1303291	1303298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_013223	GTC	2	6	1303299	1303304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_013223	GAC	2	6	1303377	1303382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_013223	TG	3	6	1303435	1303440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_013223	TCC	2	6	1303471	1303476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_013223	GGGCG	2	10	1303484	1303493	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3624	NC_013223	GCG	2	6	1303525	1303530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_013223	CGG	2	6	1303546	1303551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_013223	GCCG	2	8	1303585	1303592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_013223	ATCC	2	8	1304516	1304523	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_013223	CCA	2	6	1305459	1305464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3629	NC_013223	AAAC	2	8	1305922	1305929	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_013223	CT	3	6	1305958	1305963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3631	NC_013223	GGC	2	6	1305968	1305973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3632	NC_013223	CAG	2	6	1305981	1305986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_013223	GGGTT	2	10	1311302	1311311	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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3751	NC_013223	T	8	8	1362715	1362722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3752	NC_013223	CTT	2	6	1362739	1362744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3754	NC_013223	GAAT	2	8	1364756	1364763	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3760	NC_013223	CTG	2	6	1364885	1364890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3762	NC_013223	TG	3	6	1365901	1365906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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