MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 8058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013223	T	6	6	392020	392025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_013223	GAG	2	6	392046	392051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_013223	T	6	6	392178	392183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_013223	GGT	2	6	392193	392198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_013223	ACCCC	2	10	392234	392243	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1006	NC_013223	CCCCT	2	10	392246	392255	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1007	NC_013223	AGGGG	2	10	392261	392270	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_013223	AG	3	6	392275	392280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_013223	GCT	2	6	392282	392287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_013223	AGCCGA	2	12	392355	392366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_013223	GGT	2	6	394999	395004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_013223	A	8	8	395020	395027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013223	A	7	7	395283	395289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_013223	CGC	2	6	395469	395474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1015	NC_013223	CGA	2	6	398810	398815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_013223	GGC	2	6	398817	398822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_013223	A	6	6	398847	398852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_013223	CCCG	3	12	398877	398888	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1019	NC_013223	CGC	2	6	399011	399016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_013223	A	6	6	399067	399072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013223	GCA	2	6	399084	399089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_013223	CCCG	3	12	399097	399108	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1023	NC_013223	CGC	2	6	399231	399236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1024	NC_013223	A	6	6	399287	399292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_013223	CCCG	2	8	399317	399324	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1026	NC_013223	CGTC	2	8	399348	399355	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1027	NC_013223	TCAG	2	8	399372	399379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_013223	TG	3	6	399386	399391	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_013223	CGC	2	6	401893	401898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_013223	GC	3	6	401902	401907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_013223	AC	3	6	401945	401950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_013223	G	6	6	403582	403587	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013223	CTCG	2	8	403622	403629	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_013223	GAT	2	6	403697	403702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_013223	CTG	2	6	403705	403710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_013223	GCTC	2	8	403739	403746	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_013223	ACCGA	2	10	403791	403800	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1038	NC_013223	AGA	2	6	403813	403818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_013223	CTCG	2	8	403852	403859	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1040	NC_013223	GAT	2	6	403927	403932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_013223	CTG	2	6	403935	403940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_013223	GCC	2	6	407377	407382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_013223	CAG	2	6	407447	407452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_013223	GTC	2	6	407849	407854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_013223	TCC	2	6	407880	407885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_013223	GCA	2	6	407890	407895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013223	TACG	2	8	407929	407936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_013223	T	6	6	407952	407957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_013223	GTC	3	9	407958	407966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_013223	GGAA	2	8	407994	408001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_013223	TGTC	2	8	410019	410026	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1052	NC_013223	GCG	3	9	410045	410053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_013223	CGGC	2	8	410107	410114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_013223	GAA	2	6	410212	410217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_013223	CCG	2	6	410275	410280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_013223	GAA	2	6	410902	410907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_013223	AGG	2	6	410929	410934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_013223	TCG	2	6	412087	412092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_013223	T	6	6	412154	412159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_013223	T	7	7	412162	412168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_013223	GTT	2	6	412176	412181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013223	CTT	2	6	412200	412205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_013223	A	7	7	412243	412249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_013223	T	6	6	412272	412277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_013223	A	6	6	412337	412342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_013223	AGGACA	2	12	412384	412395	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1067	NC_013223	GAG	2	6	412406	412411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_013223	TGG	2	6	412455	412460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_013223	CCT	2	6	414078	414083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_013223	GTT	2	6	414092	414097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_013223	CCT	2	6	414100	414105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_013223	GTTC	2	8	414183	414190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_013223	C	6	6	414195	414200	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1074	NC_013223	GTT	2	6	414256	414261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_013223	CG	3	6	414274	414279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_013223	GTG	2	6	414297	414302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_013223	A	6	6	414382	414387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_013223	TG	3	6	416608	416613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013223	ATCGGG	2	12	416628	416639	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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1081	NC_013223	GAC	2	6	416788	416793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_013223	AAG	2	6	418684	418689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_013223	GGA	2	6	418690	418695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_013223	GGAA	2	8	418815	418822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_013223	GCG	2	6	419598	419603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_013223	CAG	2	6	419673	419678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1088	NC_013223	CCCT	2	8	419767	419774	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1089	NC_013223	TTC	2	6	419784	419789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_013223	CAGA	2	8	420339	420346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_013223	GGA	2	6	420539	420544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_013223	CGG	2	6	420571	420576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_013223	TCC	2	6	420587	420592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_013223	A	6	6	420600	420605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013223	TTGTT	2	10	420608	420617	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_013223	GTTGT	2	10	421393	421402	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_013223	T	6	6	421467	421472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_013223	CAA	2	6	421552	421557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_013223	AAG	2	6	421573	421578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_013223	GAA	2	6	421610	421615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_013223	GT	3	6	422235	422240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_013223	GGC	2	6	423277	423282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_013223	G	6	6	423358	423363	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_013223	T	6	6	423608	423613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_013223	CA	3	6	423680	423685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_013223	CA	3	6	423753	423758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_013223	ACC	2	6	423764	423769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_013223	AGG	2	6	423771	423776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_013223	A	6	6	425065	425070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013223	C	6	6	425084	425089	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1112	NC_013223	CCCT	2	8	427228	427235	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1113	NC_013223	TGG	2	6	427245	427250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_013223	TTC	2	6	427255	427260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_013223	A	6	6	427342	427347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_013223	GAG	2	6	427371	427376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013223	GATA	2	8	427436	427443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_013223	G	6	6	427470	427475	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_013223	ACG	2	6	427601	427606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_013223	AAT	2	6	427632	427637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013223	ATC	2	6	427690	427695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_013223	CCA	2	6	427719	427724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_013223	TC	3	6	427729	427734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1124	NC_013223	CAGG	3	12	427799	427810	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_013223	T	7	7	427862	427868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_013223	C	6	6	428867	428872	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1127	NC_013223	GTC	2	6	428916	428921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_013223	GAG	2	6	428940	428945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013223	C	6	6	428948	428953	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1130	NC_013223	TGT	2	6	431338	431343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_013223	CTC	2	6	432323	432328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_013223	GGC	2	6	432445	432450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_013223	ATGG	2	8	432499	432506	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_013223	GGT	2	6	432530	432535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_013223	TTC	2	6	433618	433623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_013223	CTT	2	6	433630	433635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_013223	ACC	2	6	433694	433699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1138	NC_013223	CCT	2	6	433707	433712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1139	NC_013223	AGG	2	6	433718	433723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1141	NC_013223	CCT	2	6	433830	433835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1142	NC_013223	AGG	2	6	433841	433846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_013223	GGT	2	6	433854	433859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_013223	GAT	2	6	433863	433868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1163	NC_013223	GGT	2	6	442185	442190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1164	NC_013223	GCG	2	6	442191	442196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1252	NC_013223	GATTT	2	10	470063	470072	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_013223	T	7	7	472524	472530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_013223	GCG	2	6	472534	472539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1259	NC_013223	GAA	2	6	472687	472692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1261	NC_013223	GTG	2	6	472840	472845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_013223	TCA	2	6	472853	472858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_013223	TA	3	6	472924	472929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_013223	GAC	2	6	472930	472935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1266	NC_013223	GCC	2	6	472957	472962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1270	NC_013223	CGG	2	6	473098	473103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1271	NC_013223	GTTGG	2	10	473154	473163	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_013223	AGG	2	6	473171	473176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1274	NC_013223	TGAT	2	8	473227	473234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_013223	TTA	2	6	499721	499726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_013223	T	6	6	499753	499758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_013223	TTG	2	6	518802	518807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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