MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 8058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013223	T	8	8	172360	172367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013223	G	6	6	172436	172441	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
503	NC_013223	T	6	6	172450	172455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013223	TG	3	6	172480	172485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013223	A	7	7	172506	172512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013223	T	6	6	172517	172522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013223	TGT	2	6	172575	172580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013223	CAA	2	6	172586	172591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_013223	AGG	2	6	172593	172598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013223	CGG	2	6	173149	173154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_013223	GGT	2	6	173161	173166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013223	TG	3	6	173524	173529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013223	GGA	2	6	173806	173811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013223	CAT	2	6	175188	175193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_013223	GTGCG	2	10	176021	176030	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
516	NC_013223	GCAG	2	8	176062	176069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
517	NC_013223	CGC	2	6	176106	176111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_013223	GCG	2	6	176135	176140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_013223	TCT	2	6	177177	177182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_013223	CGC	2	6	177255	177260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_013223	CGG	2	6	177264	177269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_013223	GCC	2	6	177315	177320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_013223	TCC	2	6	178658	178663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_013223	GCC	2	6	179492	179497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_013223	CGA	2	6	180750	180755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013223	TTG	2	6	180770	180775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013223	A	7	7	180904	180910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013223	CGG	2	6	181186	181191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_013223	CTA	2	6	181205	181210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_013223	TAAC	2	8	181213	181220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
531	NC_013223	CG	3	6	181238	181243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
532	NC_013223	GC	3	6	181253	181258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
533	NC_013223	T	7	7	181279	181285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013223	TCT	2	6	181717	181722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_013223	A	6	6	181766	181771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013223	GTA	2	6	181778	181783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013223	AAG	3	9	181795	181803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013223	GCT	2	6	181942	181947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_013223	GGGAC	2	10	181951	181960	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
540	NC_013223	CCCT	2	8	182374	182381	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
541	NC_013223	ATT	2	6	182397	182402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013223	TCC	2	6	186872	186877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_013223	T	6	6	189286	189291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013223	CTT	2	6	189311	189316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_013223	CAT	2	6	189355	189360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_013223	TTG	2	6	189398	189403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013223	T	6	6	189426	189431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013223	G	6	6	194785	194790	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013223	CGT	2	6	194814	194819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_013223	GAG	2	6	194866	194871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013223	GTC	2	6	195041	195046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_013223	ATC	2	6	195047	195052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_013223	T	7	7	195087	195093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013223	GAAG	2	8	195202	195209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013223	GGC	2	6	195253	195258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_013223	ACGGG	2	10	195481	195490	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
557	NC_013223	CCG	2	6	196907	196912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_013223	GGT	2	6	196933	196938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013223	CCT	2	6	196965	196970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_013223	TCC	2	6	196978	196983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_013223	CCTG	2	8	197004	197011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
562	NC_013223	GC	3	6	197110	197115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
563	NC_013223	AAG	2	6	198212	198217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013223	CCT	2	6	198442	198447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_013223	CA	3	6	198507	198512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_013223	CTCG	2	8	198672	198679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
567	NC_013223	TCT	2	6	198789	198794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_013223	TTG	2	6	198900	198905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013223	CA	3	6	198995	199000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_013223	GA	3	6	199610	199615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013223	GGA	2	6	200428	200433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013223	GGA	2	6	201453	201458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013223	GCG	2	6	202278	202283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_013223	TGG	2	6	202317	202322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013223	CCTGG	2	10	202385	202394	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
576	NC_013223	GTG	2	6	202405	202410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013223	CGT	2	6	202444	202449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_013223	GTG	2	6	202518	202523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013223	CTT	2	6	202524	202529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_013223	GTG	2	6	202577	202582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013223	CGT	2	6	202616	202621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_013223	GTG	2	6	202689	202694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013223	CCTGG	2	10	202728	202737	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
584	NC_013223	CCTG	2	8	202768	202775	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
585	NC_013223	GCG	2	6	203400	203405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_013223	GGGC	2	8	203409	203416	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
587	NC_013223	CT	3	6	203442	203447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
588	NC_013223	T	6	6	205791	205796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013223	CGG	2	6	205812	205817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_013223	CAG	2	6	205917	205922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_013223	CGG	2	6	205937	205942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_013223	GTT	2	6	207132	207137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_013223	TTG	2	6	207180	207185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013223	AT	3	6	208718	208723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013223	CGTT	2	8	208757	208764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
596	NC_013223	CT	3	6	208844	208849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_013223	CAGTC	2	10	208926	208935	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
598	NC_013223	CGC	2	6	208993	208998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_013223	AGG	2	6	209001	209006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013223	TGTGAT	2	12	211360	211371	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013223	GA	3	6	211403	211408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013223	TCT	2	6	211410	211415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_013223	T	6	6	211417	211422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013223	A	7	7	211472	211478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013223	GCT	2	6	211482	211487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_013223	CCG	2	6	211597	211602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_013223	GA	4	8	211614	211621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013223	AGG	2	6	211692	211697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013223	CCGGG	2	10	213132	213141	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
610	NC_013223	CCCGG	2	10	213157	213166	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
611	NC_013223	GT	3	6	213658	213663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013223	AGTG	2	8	213667	213674	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013223	T	6	6	213690	213695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013223	CGG	2	6	214934	214939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_013223	CT	3	6	214950	214955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_013223	CGG	2	6	217953	217958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_013223	G	6	6	217989	217994	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013223	GCC	2	6	218072	218077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_013223	TAC	2	6	219811	219816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_013223	GTGCT	2	10	219956	219965	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
621	NC_013223	TCC	2	6	222433	222438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_013223	TG	3	6	222443	222448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
623	NC_013223	A	6	6	222462	222467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013223	TGC	2	6	222483	222488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_013223	GCAG	2	8	222566	222573	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
626	NC_013223	GTTTT	2	10	222576	222585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
627	NC_013223	GTAT	2	8	222586	222593	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
628	NC_013223	A	7	7	222600	222606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_013223	ATC	2	6	222657	222662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_013223	C	6	6	222736	222741	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
631	NC_013223	GGT	2	6	222795	222800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013223	TGCA	2	8	222878	222885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_013223	AGG	2	6	222997	223002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013223	CAA	2	6	225379	225384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_013223	G	6	6	225386	225391	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
636	NC_013223	GGA	2	6	225409	225414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_013223	CTT	2	6	225423	225428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_013223	GTG	2	6	225713	225718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_013223	GTG	2	6	225852	225857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
640	NC_013223	CAG	2	6	225931	225936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_013223	ACC	2	6	225975	225980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_013223	T	7	7	226022	226028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_013223	GTG	2	6	226030	226035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
644	NC_013223	CAG	2	6	226109	226114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_013223	ACC	2	6	226153	226158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
646	NC_013223	T	7	7	226200	226206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
647	NC_013223	GTG	2	6	226208	226213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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661	NC_013223	CTG	2	6	232156	232161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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675	NC_013223	A	6	6	240708	240713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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703	NC_013223	G	6	6	251973	251978	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
704	NC_013223	G	6	6	251985	251990	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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706	NC_013223	A	6	6	252008	252013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
707	NC_013223	A	6	6	252065	252070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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773	NC_013223	G	6	6	296183	296188	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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775	NC_013223	TGAC	2	8	296430	296437	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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778	NC_013223	CTTT	2	8	302225	302232	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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