MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfomicrobium baculatum DSM 4028

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013173	TGATAT	2	12	8497	8508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013173	GCTTTC	2	12	75120	75131	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013173	ATCATG	2	12	93542	93553	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013173	CATGTC	2	12	267313	267324	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013173	GAAAAA	2	12	354764	354775	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013173	CAAATT	2	12	358348	358359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013173	GTAAAA	2	12	364659	364670	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013173	CCCCCT	2	12	373373	373384	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
9	NC_013173	GGGCAA	2	12	463201	463212	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013173	AGCGTC	2	12	474465	474476	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013173	TGGCGT	2	12	511136	511147	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013173	CGGCAA	2	12	530412	530423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013173	CAAAAA	2	12	632074	632085	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013173	GGACAG	2	12	694442	694453	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013173	TCTTTT	2	12	747997	748008	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013173	TTCATA	2	12	751156	751167	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013173	CGGTCT	2	12	796184	796195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013173	TTGAAA	2	12	798772	798783	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013173	CGGTGC	2	12	799140	799151	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013173	AAAAGG	2	12	801392	801403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013173	TATAAA	2	12	807068	807079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013173	AACCAT	2	12	813728	813739	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013173	TGATTG	2	12	813838	813849	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013173	GTCCGA	2	12	830098	830109	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_013173	AGCGGG	2	12	855298	855309	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013173	TGAGGC	2	12	858406	858417	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013173	GATGTG	2	12	886565	886576	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013173	GAATGT	2	12	928707	928718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013173	TCAAAG	2	12	960445	960456	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013173	TGAAAT	2	12	965241	965252	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013173	GTTCGG	2	12	966587	966598	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013173	TATTAG	2	12	980164	980175	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013173	CTTTTT	2	12	981137	981148	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013173	TGGACA	2	12	989431	989442	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013173	GGGCCG	2	12	1009562	1009573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013173	CGTGTC	2	12	1046435	1046446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013173	TTTTCT	2	12	1046551	1046562	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013173	GGAAAT	2	12	1089884	1089895	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013173	TATGAA	2	12	1108063	1108074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013173	AGGCTA	2	12	1111515	1111526	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013173	GCCGGA	2	12	1155820	1155831	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013173	CTCCGG	2	12	1155956	1155967	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013173	GCCCTG	2	12	1197245	1197256	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013173	CCCTGC	2	12	1207807	1207818	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013173	TTTTTC	2	12	1240414	1240425	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013173	CGACTC	2	12	1295420	1295431	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013173	GATGAG	2	12	1364386	1364397	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013173	TAAAGA	2	12	1364833	1364844	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013173	TGATCG	2	12	1366589	1366600	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013173	ATGGCG	2	12	1436155	1436166	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013173	CTTTTT	2	12	1478937	1478948	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013173	GCACCG	2	12	1535197	1535208	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013173	ATTTAA	2	12	1536018	1536029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013173	AGGGGG	2	12	1577587	1577598	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013173	TAAAAT	2	12	1615928	1615939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013173	CCTCCC	2	12	1662199	1662210	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
57	NC_013173	TCGCAT	2	12	1725192	1725203	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013173	CTGAAT	2	12	1736127	1736138	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013173	AATTCG	2	12	1749620	1749631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013173	AGGGGG	2	12	1755439	1755450	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013173	GAGCCT	2	12	1760000	1760011	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013173	GCATCA	2	12	1929497	1929508	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013173	AATAAA	2	12	1943715	1943726	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013173	GTGCCA	2	12	1961900	1961911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013173	AAAAGG	2	12	1971967	1971978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013173	ATGGGC	2	12	2009204	2009215	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013173	GACAAC	2	12	2075177	2075188	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013173	AAAAAT	2	12	2137932	2137943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013173	CATATT	2	12	2155843	2155854	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013173	ATACGT	2	12	2166234	2166245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013173	TCTGAA	2	12	2189945	2189956	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013173	TGAATT	2	12	2197738	2197749	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013173	GACCGG	2	12	2221583	2221594	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013173	AATTAA	2	12	2229042	2229053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013173	CTCGGG	2	12	2233199	2233210	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013173	GCCCTG	2	12	2234008	2234019	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013173	TTTTGA	2	12	2246989	2247000	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013173	AAGCGC	2	12	2287558	2287569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013173	GCTTGA	2	12	2331340	2331351	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013173	CCGCCC	2	12	2332893	2332904	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
81	NC_013173	CTCCGT	2	12	2362992	2363003	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013173	ATTCGC	2	12	2370207	2370218	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013173	ATATGG	2	12	2400153	2400164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013173	AAAAAT	2	12	2403128	2403139	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013173	GCATCC	2	12	2438496	2438507	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013173	AAATTT	2	12	2500934	2500945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013173	TTAAAA	2	12	2503571	2503582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013173	TGATCA	2	12	2521343	2521354	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013173	TTTTCC	2	12	2602132	2602143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013173	ACACCC	2	12	2617773	2617784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013173	CTTTGC	2	12	2681049	2681060	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013173	CCCGCG	2	12	2694813	2694824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013173	TCAGAT	2	12	2714538	2714549	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013173	TGGGCG	2	12	2729174	2729185	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013173	AGGGGG	2	12	2798841	2798852	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013173	GCTCCG	2	12	2868410	2868421	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013173	GGCTTG	2	12	2891185	2891196	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013173	CCCCCT	2	12	2899892	2899903	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
99	NC_013173	GACGAG	2	12	2922409	2922420	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013173	TGTTTT	2	12	2995780	2995791	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013173	AAAGAT	2	12	3023335	3023346	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013173	AAAGAT	2	12	3027582	3027593	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013173	GAGCAG	2	12	3061276	3061287	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013173	AAAGGC	2	12	3101315	3101326	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013173	GCCTTT	2	12	3101340	3101351	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013173	CATGGC	2	12	3292674	3292685	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013173	TTTGAC	2	12	3345301	3345312	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013173	AAGACC	2	12	3397279	3397290	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013173	GAAAAG	2	12	3576431	3576442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013173	GATAGT	2	12	3577440	3577451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013173	TTTATT	2	12	3584254	3584265	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013173	ATGCGG	2	12	3602707	3602718	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013173	AATATA	2	12	3618958	3618969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013173	AGATCG	2	12	3638238	3638249	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_013173	CTTTTC	2	12	3672433	3672444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013173	ATCAAC	2	12	3681618	3681629	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013173	TTTGTT	2	12	3719828	3719839	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013173	GTTCAG	2	12	3775236	3775247	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_013173	GGGGTC	2	12	3781264	3781275	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_013173	TTGATT	2	12	3837213	3837224	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013173	GTCCGT	2	12	3860146	3860157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.