MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Dyadobacter fermentans DSM 18053 chromosome

Total Repeats: 184

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013037	GTTAGT	2	12	31547	31558	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013037	CCATTT	2	12	53663	53674	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013037	GGGATT	2	12	95051	95062	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013037	TCAAAT	2	12	143309	143320	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013037	TATTTA	2	12	186681	186692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013037	CTATTA	2	12	225426	225437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013037	GAAAAC	2	12	230035	230046	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013037	ATTTGT	2	12	265059	265070	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013037	TACATT	2	12	267117	267128	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013037	TAAGTA	2	12	338960	338971	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013037	GGAATG	2	12	365733	365744	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013037	ATTAAT	2	12	400398	400409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013037	AAAAAT	2	12	432842	432853	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013037	ACAATA	2	12	504076	504087	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013037	TGGTTT	2	12	544977	544988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013037	GCTGGT	2	12	549136	549147	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013037	AAACTT	2	12	592193	592204	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013037	ATGAAA	2	12	631994	632005	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013037	CTAATA	2	12	701864	701875	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013037	ATTATC	2	12	726063	726074	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013037	GTTTTA	2	12	735766	735777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013037	CCCGCA	2	12	866321	866332	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013037	ACGCAA	2	12	870197	870208	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013037	GTAACA	2	12	927890	927901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013037	GTACCG	2	12	951051	951062	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013037	GCTTTG	2	12	1007620	1007631	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013037	TATGGA	2	12	1013724	1013735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013037	CGCGTG	2	12	1024004	1024015	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013037	TAAGTC	2	12	1024192	1024203	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013037	CGCAAG	2	12	1026725	1026736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013037	AAATCC	2	12	1027315	1027326	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013037	CCCCAT	2	12	1077852	1077863	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013037	AAAGGC	2	12	1089789	1089800	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013037	TGCGAG	2	12	1107434	1107445	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_013037	GGAATG	2	12	1150510	1150521	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013037	AAAGCA	2	12	1287536	1287547	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013037	CTTTTT	2	12	1389524	1389535	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013037	TCAAAT	2	12	1543152	1543163	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013037	CCCTTA	2	12	1554038	1554049	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013037	TCAACA	2	12	1567609	1567620	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013037	AAAAAG	2	12	1672926	1672937	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013037	GGTTTA	2	12	1712107	1712118	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013037	CCTGCG	2	12	1722018	1722029	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013037	AGGGTT	2	12	1737878	1737889	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013037	GAAGGT	2	12	1839265	1839276	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013037	CAATCT	2	12	1846611	1846622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013037	AAAAAC	2	12	1922365	1922376	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013037	TTAAAA	2	12	1926933	1926944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013037	TCGGGC	2	12	1953838	1953849	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013037	CATTCA	2	12	2063121	2063132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013037	TTCATC	2	12	2076177	2076188	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013037	ACATTT	2	12	2162006	2162017	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013037	GTTTAA	2	12	2171406	2171417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013037	AGTAAC	2	12	2175105	2175116	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013037	TTGCAT	2	12	2185274	2185285	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013037	TAAACC	2	12	2236410	2236421	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013037	TAAAAC	2	12	2259367	2259378	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013037	TAAAAA	2	12	2275659	2275670	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013037	CACCGA	2	12	2304563	2304574	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013037	TTCTTG	2	12	2309140	2309151	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013037	AACGAT	2	12	2348630	2348641	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013037	TCACCA	2	12	2362151	2362162	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013037	ATCCCA	2	12	2365634	2365645	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_013037	TAATTG	2	12	2367537	2367548	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013037	TGGGCA	2	12	2371042	2371053	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013037	CTCAAA	2	12	2397761	2397772	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013037	ATTTTT	2	12	2474966	2474977	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013037	ATCCTA	2	12	2490104	2490115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013037	AAAAGC	2	12	2499435	2499446	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013037	TGCTTT	2	12	2499468	2499479	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_013037	AATGGA	2	12	2513886	2513897	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013037	GTTTTT	2	12	2546164	2546175	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013037	GCATTT	2	12	2787715	2787726	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_013037	GTATTT	2	12	2800239	2800250	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013037	TTTCAA	2	12	2811154	2811165	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013037	CGCACT	2	12	2857500	2857511	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013037	ATTCAC	2	12	2864363	2864374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013037	AGCTAC	2	12	2893866	2893877	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013037	CTTTAA	2	12	2906708	2906719	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013037	TGAAAT	2	12	2913269	2913280	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013037	ACGCCA	2	12	2914584	2914595	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013037	CATTCC	2	12	2930266	2930277	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013037	CAAAAG	2	12	2933210	2933221	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013037	AAATTA	2	12	2984612	2984623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013037	AAACCC	2	12	3005373	3005384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013037	TAACAT	2	12	3065800	3065811	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_013037	AGGCAT	2	12	3108226	3108237	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013037	AAACTA	2	12	3130734	3130745	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_013037	AAGTTA	2	12	3145027	3145038	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013037	CTTCCG	2	12	3166500	3166511	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013037	GCAATG	2	12	3246060	3246071	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013037	CGCAGG	2	12	3254494	3254505	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_013037	ATATTT	2	12	3301217	3301228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013037	TAACCA	2	12	3305988	3305999	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_013037	GTCGGT	2	12	3320726	3320737	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013037	AAAAAT	2	12	3455714	3455725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013037	GCATTT	2	12	3483393	3483404	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013037	AAAACA	2	12	3483967	3483978	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_013037	ATTTGC	2	12	3540694	3540705	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013037	TTTACA	2	12	3624177	3624188	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_013037	AAAGAT	2	12	3676301	3676312	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013037	GATATT	2	12	3734352	3734363	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013037	AAACCA	2	12	3774018	3774029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013037	AAGACA	2	12	3778040	3778051	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013037	ATTTTA	2	12	3792798	3792809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013037	CTCCGT	2	12	3804994	3805005	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_013037	CCTCTT	2	12	3827784	3827795	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013037	GTTTCC	2	12	3863363	3863374	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013037	TTGATT	2	12	3871507	3871518	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013037	AAAGCC	2	12	3874344	3874355	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013037	AAAGCC	2	12	3874357	3874368	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013037	CCGACA	4	24	3874374	3874397	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013037	CCGACA	3	18	3874406	3874423	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013037	TTTTGA	2	12	3877225	3877236	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013037	TGCTTT	2	12	4000686	4000697	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013037	TCGCTT	2	12	4003057	4003068	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013037	AAAGGT	2	12	4041758	4041769	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013037	TTAAAA	2	12	4233561	4233572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013037	CCTACA	2	12	4410515	4410526	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013037	AATTTA	2	12	4555951	4555962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013037	TAAACA	2	12	4580755	4580766	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_013037	AAGCGA	2	12	4614015	4614026	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013037	AAAGCA	2	12	4616385	4616396	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013037	TTTATC	2	12	4640801	4640812	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_013037	AAGCGA	2	12	4641741	4641752	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_013037	AAAAGC	2	12	4644111	4644122	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_013037	AAAAGC	2	12	4644371	4644382	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_013037	GTTTTT	2	12	4654621	4654632	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013037	AGCAAA	2	12	4695516	4695527	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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131	NC_013037	CAATAT	2	12	4746583	4746594	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.