MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Dyadobacter fermentans DSM 18053 chromosome

Total Repeats: 584

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013037	GATAA	2	10	1846	1855	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013037	AACAT	2	10	39940	39949	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013037	TACAA	2	10	72056	72065	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013037	AGGAA	2	10	72305	72314	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013037	ATGAT	2	10	72540	72549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013037	GAATT	2	10	78036	78045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013037	ACCAA	2	10	79668	79677	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_013037	TTGAC	2	10	79736	79745	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013037	ATAAA	2	10	83202	83211	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013037	ATTAC	2	10	96427	96436	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013037	TTTTG	2	10	96501	96510	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013037	TTCTT	2	10	117695	117704	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013037	CGGTT	2	10	125908	125917	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013037	TTGGT	2	10	127400	127409	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013037	TGTAC	2	10	158148	158157	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013037	TGATG	2	10	176405	176414	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013037	TAATT	2	10	176543	176552	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013037	GGCAG	2	10	201989	201998	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013037	GGCCG	2	10	224152	224161	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_013037	TTGAA	2	10	229671	229680	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013037	TTTAG	2	10	231221	231230	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013037	AGAAA	2	10	231290	231299	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013037	TGATC	2	10	231308	231317	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013037	TCAAC	2	10	241031	241040	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013037	TGTTT	2	10	253859	253868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013037	CGCTT	2	10	255794	255803	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_013037	AGTTT	2	10	265027	265036	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013037	CATTT	2	10	272111	272120	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013037	AATAA	2	10	290119	290128	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013037	CATTG	2	10	313652	313661	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013037	GAAGC	2	10	322247	322256	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013037	CAAAT	2	10	329238	329247	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013037	GTAAA	2	10	334191	334200	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013037	TCATT	2	10	345046	345055	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_013037	TGAAG	2	10	406181	406190	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013037	AAAAT	2	10	407554	407563	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013037	GCAAT	2	10	416940	416949	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013037	GAATT	2	10	422002	422011	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013037	GAATT	2	10	426226	426235	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013037	CGGAA	2	10	428213	428222	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013037	ATGCT	2	10	464427	464436	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013037	ACAAA	2	10	500097	500106	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013037	ATCGT	2	10	524974	524983	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013037	ATGAC	2	10	531397	531406	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013037	CCATT	2	10	553634	553643	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_013037	CCGAA	2	10	567928	567937	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_013037	TCAGG	2	10	569367	569376	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013037	TGGAG	2	10	583789	583798	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013037	TCAGA	2	10	585876	585885	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013037	ATTAC	2	10	587597	587606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013037	TGAAT	2	10	587746	587755	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013037	TACAT	2	10	587885	587894	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013037	CTATA	2	10	595017	595026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013037	TGCTT	2	10	596095	596104	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013037	AAAGC	2	10	606946	606955	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013037	TTTAA	2	10	610979	610988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013037	TCGGA	2	10	624756	624765	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013037	AGCAA	2	10	637803	637812	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013037	AAATC	2	10	668246	668255	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013037	CCTTC	2	10	671246	671255	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
61	NC_013037	TTCCC	2	10	679718	679727	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_013037	ATTTG	2	10	690144	690153	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013037	AAATT	2	10	701264	701273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013037	TAAAA	2	10	701339	701348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013037	CATTG	2	10	718777	718786	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013037	CAGGG	2	10	724645	724654	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013037	TTTCA	2	10	724768	724777	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013037	TGTTT	2	10	755041	755050	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013037	AGGGT	2	10	844311	844320	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013037	AATAA	2	10	846213	846222	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013037	ATTTA	2	10	884816	884825	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013037	ATTTT	2	10	900808	900817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013037	GGCCG	2	10	909464	909473	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_013037	ATACA	2	10	952433	952442	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013037	TTTAA	2	10	964426	964435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013037	TTACC	2	10	972249	972258	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_013037	TCGTT	2	10	981950	981959	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013037	ATGTC	2	10	981987	981996	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_013037	CCGGG	2	10	989801	989810	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
80	NC_013037	AAGCT	2	10	990879	990888	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013037	GGAAA	2	10	992064	992073	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013037	TCAAA	2	10	993615	993624	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_013037	AAGGA	2	10	1027630	1027639	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013037	TTTTA	2	10	1037370	1037379	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013037	CTGTT	2	10	1048507	1048516	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013037	TAAAA	2	10	1055207	1055216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013037	ACGAT	2	10	1055623	1055632	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013037	TATAA	2	10	1057911	1057920	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013037	GTCTG	2	10	1071424	1071433	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_013037	AGACA	2	10	1091787	1091796	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013037	GGCGA	2	10	1093124	1093133	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013037	GATCA	2	10	1093510	1093519	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013037	CGAAT	2	10	1107199	1107208	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013037	TTTCT	2	10	1109341	1109350	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013037	TTGCC	2	10	1109651	1109660	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_013037	TTGTT	2	10	1116985	1116994	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013037	GATGT	2	10	1127229	1127238	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013037	TTTCG	2	10	1132055	1132064	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013037	GAAGG	2	10	1150611	1150620	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013037	GCAGT	2	10	1194650	1194659	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013037	GCGAA	2	10	1234747	1234756	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013037	ATTAT	2	10	1235008	1235017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013037	ATACT	2	10	1277664	1277673	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013037	TCTGT	2	10	1304745	1304754	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013037	GTTTC	2	10	1376503	1376512	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013037	TTAAC	2	10	1385646	1385655	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013037	TAATT	2	10	1388112	1388121	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013037	TTGTT	2	10	1402336	1402345	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013037	CCAAA	2	10	1412712	1412721	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_013037	AAATT	2	10	1452090	1452099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013037	ATCAT	2	10	1455355	1455364	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_013037	ACTTA	2	10	1455365	1455374	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013037	ACCAT	2	10	1471629	1471638	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_013037	ATTTA	2	10	1473661	1473670	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013037	TCCTT	2	10	1478150	1478159	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_013037	AGAAA	2	10	1479597	1479606	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013037	CATTC	2	10	1496171	1496180	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_013037	AGCGG	2	10	1503868	1503877	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_013037	CGCGG	2	10	1503947	1503956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
120	NC_013037	TAAAA	2	10	1542849	1542858	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013037	TCTAA	2	10	1567690	1567699	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_013037	AATGA	2	10	1592477	1592486	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013037	TATTT	2	10	1597638	1597647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013037	TAAAC	2	10	1606643	1606652	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_013037	TCAAT	2	10	1607308	1607317	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013037	ATCAA	2	10	1632383	1632392	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013037	TAAAA	2	10	1633536	1633545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013037	TAACT	2	10	1634934	1634943	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_013037	AAAAT	2	10	1653859	1653868	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013037	ACAGT	2	10	1679716	1679725	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013037	TGTAT	2	10	1680936	1680945	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013037	TCAAA	2	10	1715314	1715323	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013037	ATGCC	2	10	1720686	1720695	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_013037	TCGCG	2	10	1722199	1722208	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_013037	CTTAA	2	10	1743614	1743623	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_013037	TGCAT	2	10	1743645	1743654	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013037	TTTAA	2	10	1760570	1760579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013037	TCCAC	2	10	1782620	1782629	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_013037	TAGAT	2	10	1782684	1782693	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013037	GCAAT	2	10	1785429	1785438	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_013037	TTTGC	2	10	1785550	1785559	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_013037	TTCCA	2	10	1785651	1785660	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_013037	CCTGG	2	10	1792140	1792149	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_013037	TAAAA	2	10	1803469	1803478	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_013037	CAATC	2	10	1825240	1825249	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
154	NC_013037	GCCCG	2	10	1831196	1831205	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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279	NC_013037	ATTTT	2	10	3472616	3472625	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_013037	GTTAT	2	10	3514289	3514298	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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