MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio salexigens DSM 2638 chromosome

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012881	GATTAT	2	12	32850	32861	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012881	ATTTTT	2	12	55942	55953	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012881	AGGGTT	2	12	95247	95258	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012881	GATAAG	2	12	103635	103646	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012881	GGGGAA	2	12	113136	113147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012881	TTCCCC	2	12	113162	113173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_012881	TGAAAT	2	12	116793	116804	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012881	AATATA	2	12	141396	141407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012881	TAAACT	2	12	148302	148313	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012881	GTGCAT	2	12	155871	155882	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012881	TAGTTT	2	12	192057	192068	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012881	TTTATG	2	12	196030	196041	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012881	TTTATT	2	12	224158	224169	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012881	ACTTCC	2	12	300419	300430	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012881	TTTTTG	2	12	340052	340063	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012881	TTTGTG	2	12	397079	397090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012881	ATGCCT	2	12	435425	435436	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012881	AAAATC	2	12	491620	491631	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012881	ATTGAA	2	12	492805	492816	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012881	GAAATA	2	12	492837	492848	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012881	TCTCAA	2	12	674418	674429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012881	GGGGAA	2	12	715612	715623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012881	TTTCCC	2	12	715637	715648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012881	TTGTTT	2	12	722055	722066	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012881	AAGCTG	2	12	727055	727066	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012881	TAAGTA	2	12	729825	729836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012881	AAAAGT	2	12	739297	739308	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012881	GAAAAA	2	12	828821	828832	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012881	TGTTCT	2	12	841828	841839	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012881	AATAAA	2	12	861523	861534	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012881	AAATGG	2	12	890979	890990	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012881	ATTGAT	2	12	897851	897862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012881	TGCAAA	2	12	1019940	1019951	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012881	AATTTA	2	12	1047145	1047156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012881	ATGAGT	2	12	1091114	1091125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012881	AGATAA	2	12	1134751	1134762	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012881	GCTCAA	2	12	1171986	1171997	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012881	ATCCGC	2	12	1179592	1179603	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012881	ATTCTT	2	12	1179731	1179742	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_012881	GTTTAA	2	12	1209394	1209405	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012881	ATTTTT	2	12	1279385	1279396	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012881	AGAAAA	2	12	1348963	1348974	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012881	TTTTGT	2	12	1354815	1354826	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012881	GGCAAT	2	12	1369023	1369034	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012881	TCCGTT	2	12	1387360	1387371	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012881	AAAAAT	2	12	1390032	1390043	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012881	GGTGTT	2	12	1390071	1390082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012881	GGGAAA	2	12	1392634	1392645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012881	ATTTAG	2	12	1424456	1424467	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012881	TCCGGC	2	12	1429579	1429590	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012881	AAGATT	2	12	1430099	1430110	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012881	CGTCAC	2	12	1489910	1489921	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012881	AAAATA	2	12	1548469	1548480	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012881	TTTTGA	2	12	1604251	1604262	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012881	GGAGTT	2	12	1664899	1664910	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012881	TATTCA	2	12	1717028	1717039	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012881	ACTATT	2	12	1719854	1719865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012881	GTTTAT	2	12	1745752	1745763	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012881	TACTTA	2	12	1746872	1746883	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012881	TTTATT	2	12	1754337	1754348	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012881	TCCGGC	2	12	1764277	1764288	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012881	GTCGTG	2	12	1935485	1935496	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012881	GTTTTG	2	12	1938578	1938589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012881	CTTTTT	2	12	1951407	1951418	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012881	TTTATG	2	12	1983110	1983121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012881	ACAATA	2	12	2020206	2020217	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012881	AAAGAT	2	12	2023711	2023722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012881	TTTAAC	2	12	2023757	2023768	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012881	GTCCGG	2	12	2025456	2025467	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012881	CGTAAT	2	12	2062005	2062016	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012881	CAGTTG	2	12	2095604	2095615	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012881	ATAAAA	2	12	2192167	2192178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012881	ATACGA	2	12	2201464	2201475	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012881	TATATC	2	12	2221334	2221345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012881	AAAGAT	2	12	2280751	2280762	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012881	GAATTG	2	12	2283341	2283352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012881	AGCAAC	2	12	2315691	2315702	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012881	AATTTT	2	12	2316859	2316870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012881	GCCAGA	2	12	2328017	2328028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012881	AACAAT	2	12	2342886	2342897	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_012881	AACAAT	2	12	2344317	2344328	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012881	ATTTTA	2	12	2420087	2420098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012881	ACGGAA	2	12	2460061	2460072	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_012881	TCAGAT	2	12	2481426	2481437	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_012881	GACAAA	2	12	2481624	2481635	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_012881	AGCTAT	2	12	2508905	2508916	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012881	ATTCAC	2	12	2573981	2573992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012881	CTGTTC	2	12	2601198	2601209	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012881	AATCTG	2	12	2601210	2601221	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012881	AATTTA	2	12	2619632	2619643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012881	AAAACA	2	12	2662955	2662966	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_012881	ACAACT	2	12	2687149	2687160	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012881	ATATAA	2	12	2687165	2687176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012881	CTTTTT	2	12	2729902	2729913	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_012881	CTTTTT	2	12	2765800	2765811	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012881	ATTTTC	2	12	2787345	2787356	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_012881	AGCTTC	2	12	2820061	2820072	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012881	TACGTA	2	12	2820124	2820135	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012881	GACCGT	2	12	2820654	2820665	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012881	CACTTA	2	12	2830065	2830076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012881	AAGGAT	2	12	2886197	2886208	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012881	TATATT	2	12	2905655	2905666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012881	TCAGTT	2	12	2957266	2957277	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012881	ATAAAA	2	12	2976326	2976337	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012881	ATCACA	2	12	3028048	3028059	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012881	ATTTTC	2	12	3043209	3043220	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_012881	AGCGAA	2	12	3061680	3061691	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_012881	AAAAAG	2	12	3101583	3101594	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012881	ATTAAA	2	12	3118676	3118687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012881	ACCGGA	2	12	3131317	3131328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012881	TATACC	2	12	3164906	3164917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012881	CCCGCT	2	12	3173346	3173357	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_012881	TTATAT	2	12	3253019	3253030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012881	AAAAAT	2	12	3335576	3335587	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012881	TCTGAA	2	12	3350691	3350702	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_012881	AAAACA	2	12	3366410	3366421	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_012881	GGAATT	2	12	3429664	3429675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012881	CCTTTT	2	12	3480645	3480656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012881	CAAAAA	2	12	3486220	3486231	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_012881	CTTTAT	2	12	3499519	3499530	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_012881	TAAATT	2	12	3524741	3524752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012881	AAAACA	2	12	3529234	3529245	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_012881	ATCTGT	2	12	3579342	3579353	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_012881	CTTTTT	2	12	3618742	3618753	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_012881	CATTAA	2	12	3757982	3757993	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_012881	TTGATA	2	12	3774124	3774135	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012881	AATTCA	2	12	3779149	3779160	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_012881	TATTTT	2	12	3785212	3785223	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012881	TACTGC	2	12	3903347	3903358	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012881	AGCTGA	2	12	3907474	3907485	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_012881	CTGATC	2	12	3907515	3907526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012881	CGGCAT	2	12	3908134	3908145	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012881	ATGTGG	2	12	3958996	3959007	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012881	AGAAAA	2	12	3984505	3984516	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012881	GACAAA	2	12	3987501	3987512	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_012881	ACCAAA	2	12	4136836	4136847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012881	CACAGA	2	12	4188362	4188373	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_012881	TGTTTA	2	12	4190208	4190219	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012881	GGGGAA	2	12	4263433	4263444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012881	TTTTAA	2	12	4263466	4263477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012881	TCATAT	2	12	4276607	4276618	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.