MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Dickeya dadantii Ech703 chromosome

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012880	ATTTTT	2	12	21741	21752	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012880	TCGACG	2	12	38217	38228	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012880	ATGCTG	2	12	72680	72691	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012880	TGTTTG	2	12	93273	93284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012880	ATATTG	2	12	145714	145725	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012880	TTTTTA	2	12	171079	171090	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012880	CAGTGA	2	12	204441	204452	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012880	CCGGCA	2	12	214748	214759	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012880	TCATTA	2	12	215126	215137	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012880	CAATAA	2	12	249401	249412	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012880	ATATGT	2	12	279971	279982	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012880	AATGAT	2	12	284494	284505	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012880	GCAATG	2	12	286498	286509	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012880	TATTTT	2	12	287478	287489	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012880	GGCAAA	2	12	482292	482303	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012880	GCCGAT	2	12	486984	486995	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012880	GGATCA	2	12	569491	569502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012880	GCATTG	2	12	580463	580474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012880	CTTGAG	2	12	587552	587563	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012880	CTGGCC	2	12	609858	609869	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_012880	GAGAAA	2	12	672285	672296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012880	GTTCCG	2	12	686970	686981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012880	CGACCA	2	12	700950	700961	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012880	ATTTTT	2	12	720845	720856	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012880	TGTGTC	2	12	784972	784983	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_012880	AAAACC	2	12	794800	794811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012880	CACTTC	2	12	878309	878320	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012880	TCGTTT	2	12	938867	938878	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012880	TGCCGA	2	12	1012734	1012745	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012880	AGTAGG	2	12	1047907	1047918	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012880	CCAATA	2	12	1075362	1075373	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012880	GATCTG	2	12	1097967	1097978	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012880	CATTTT	2	12	1135188	1135199	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012880	CGTAAG	2	12	1147399	1147410	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012880	CGGGAG	2	12	1148515	1148526	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_012880	GCTCAT	2	12	1161595	1161606	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012880	CGGTTT	2	12	1173952	1173963	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012880	CACCAT	2	12	1209854	1209865	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012880	AAAAAT	2	12	1218837	1218848	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012880	ATCGAA	2	12	1241836	1241847	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012880	TTTTGT	2	12	1242070	1242081	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012880	GCGCCA	2	12	1511099	1511110	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012880	GTTTTG	2	12	1520231	1520242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012880	CGCTGC	2	12	1526718	1526729	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012880	ACTGCG	2	12	1562733	1562744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012880	GCCCTG	2	12	1566403	1566414	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012880	ATTTTA	2	12	1599190	1599201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012880	GGTGTT	2	12	1624475	1624486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012880	ACGTTC	2	12	1715751	1715762	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012880	GTAAGT	2	12	1722935	1722946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012880	TTAACA	2	12	1723569	1723580	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_012880	GTATAT	2	12	1726747	1726758	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012880	CTGTTT	2	12	1738734	1738745	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012880	GTCGGC	2	12	1756636	1756647	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012880	GATAAG	2	12	1865264	1865275	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012880	TTCTGT	2	12	1886615	1886626	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012880	TAAATA	2	12	1962230	1962241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012880	TCGTTG	2	12	1962399	1962410	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_012880	CAACCA	8	48	1974083	1974130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_012880	AACGCA	2	12	2005743	2005754	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012880	GTTAAT	2	12	2010316	2010327	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012880	TGTGGT	2	12	2069440	2069451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012880	AAATGC	2	12	2116567	2116578	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012880	GAATGT	2	12	2117778	2117789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012880	GTGACG	2	12	2163353	2163364	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012880	GACGGG	2	12	2171833	2171844	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012880	AGTTCG	2	12	2211752	2211763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012880	CATAAA	2	12	2322945	2322956	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012880	CGGTTC	2	12	2323112	2323123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012880	ATGCGC	2	12	2401302	2401313	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012880	AGATCA	2	12	2418524	2418535	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012880	TCAGGC	2	12	2446245	2446256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012880	ATCAGC	2	12	2468899	2468910	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012880	TTAAGG	2	12	2474560	2474571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012880	AAAACG	2	12	2475663	2475674	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_012880	ATAAAA	2	12	2519227	2519238	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012880	GTTTTT	2	12	2574572	2574583	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012880	TTTATG	2	12	2605491	2605502	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012880	TTCATG	2	12	2608954	2608965	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_012880	CGACGG	2	12	2620761	2620772	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012880	TGGCTT	2	12	2665364	2665375	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012880	GCAGAA	2	12	2692013	2692024	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_012880	GCATCC	2	12	2711863	2711874	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012880	TTTTCG	2	12	2743982	2743993	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_012880	ACGCCA	2	12	2818239	2818250	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012880	ATAAAA	2	12	2827236	2827247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012880	CGGAAA	2	12	2846811	2846822	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_012880	TATCAA	2	12	2859042	2859053	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012880	ATAACG	2	12	2877758	2877769	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012880	AAAGAA	2	12	2899857	2899868	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012880	TTTTAT	2	12	2939132	2939143	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012880	CAATAA	2	12	2943301	2943312	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_012880	CGCCCC	2	12	2982317	2982328	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
94	NC_012880	TGGTGT	2	12	2995962	2995973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012880	AGAAAA	2	12	3016377	3016388	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012880	ATAAAA	2	12	3055720	3055731	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012880	CGGCGA	3	18	3065965	3065982	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012880	ATTTTA	2	12	3118777	3118788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012880	TACCGC	2	12	3122147	3122158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012880	CTTTTT	2	12	3171691	3171702	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_012880	TGATCG	2	12	3174879	3174890	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_012880	GGTGAG	5	30	3188215	3188244	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012880	CTGCCG	2	12	3205800	3205811	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_012880	GAAAAA	2	12	3208183	3208194	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012880	TGAAAA	2	12	3249056	3249067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012880	TTTTCA	2	12	3265006	3265017	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_012880	TGCTGT	2	12	3352832	3352843	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_012880	CAACAC	2	12	3374987	3374998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_012880	GCTCTG	2	12	3384482	3384493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012880	CCGCCC	2	12	3400593	3400604	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
111	NC_012880	AAAGTC	2	12	3430315	3430326	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_012880	TCAGGC	2	12	3460792	3460803	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012880	GCGCCA	2	12	3460804	3460815	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012880	AAAAGG	2	12	3527306	3527317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012880	CCAAAC	2	12	3531175	3531186	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012880	CAATAA	2	12	3534166	3534177	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_012880	ACGTGC	2	12	3610118	3610129	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012880	TTAATG	2	12	3639114	3639125	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012880	GATATT	2	12	3648949	3648960	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012880	TCCCGC	2	12	3670339	3670350	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_012880	ATAACG	2	12	3695456	3695467	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_012880	AATGAT	2	12	3768909	3768920	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012880	AAGAAA	2	12	3769175	3769186	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012880	TATTGA	2	12	3852662	3852673	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012880	AATAAA	2	12	3879061	3879072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012880	TAAAAA	2	12	3879109	3879120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012880	TTATCA	2	12	3889198	3889209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_012880	TCTTTC	2	12	3891023	3891034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012880	AAACAA	2	12	3929395	3929406	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_012880	ACCAAC	2	12	3942334	3942345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_012880	ATAAAA	2	12	3957674	3957685	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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133	NC_012880	GGTAAA	2	12	3972129	3972140	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012880	GGAATC	2	12	3972173	3972184	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.