MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfobacterium autotrophicum HRM2 plasmid pHRM2a

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012109	CTT	2	6	17	22	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012109	TAT	2	6	43	48	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012109	CAT	2	6	78	83	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012109	TTG	2	6	128	133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012109	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012109	TCG	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012109	AAT	2	6	2770	2775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012109	TCC	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_012109	ATA	2	6	3142	3147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012109	ATG	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012109	CAT	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012109	TAA	2	6	4216	4221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012109	GAC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012109	GGT	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012109	AGA	2	6	4714	4719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012109	CAA	3	9	4734	4742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012109	AAT	2	6	4777	4782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012109	TTC	2	6	5029	5034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012109	GGA	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012109	TGC	2	6	5331	5336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012109	CTT	2	6	5384	5389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012109	TTG	2	6	5410	5415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012109	ATA	2	6	5440	5445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012109	AAT	2	6	5749	5754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012109	AGG	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012109	ATC	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012109	ATA	2	6	6173	6178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012109	ATA	2	6	6403	6408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012109	ATT	3	9	6783	6791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012109	TTC	2	6	8896	8901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012109	ATT	2	6	8909	8914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012109	TAT	2	6	9048	9053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012109	GGT	2	6	10089	10094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012109	TAG	2	6	10100	10105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012109	GGA	2	6	10293	10298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012109	ATG	2	6	15554	15559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012109	ATT	2	6	15595	15600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012109	CTT	2	6	15677	15682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012109	CCT	2	6	15761	15766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_012109	ATT	2	6	15791	15796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012109	TAT	2	6	16072	16077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012109	TTG	2	6	16265	16270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012109	ATC	2	6	16271	16276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012109	AAT	2	6	16289	16294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012109	ATG	2	6	16356	16361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012109	TGT	2	6	16382	16387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012109	CGA	2	6	16504	16509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012109	TAT	2	6	16539	16544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012109	TTC	2	6	20768	20773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012109	ATG	2	6	20901	20906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012109	TGT	2	6	20927	20932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012109	ATT	2	6	21115	21120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012109	TAC	2	6	21148	21153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012109	ATT	2	6	21215	21220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012109	CAA	2	6	21224	21229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012109	TTG	2	6	24195	24200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012109	CAA	2	6	24202	24207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012109	GTT	2	6	24248	24253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012109	GTT	2	6	24260	24265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012109	AAG	2	6	24278	24283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012109	GTT	2	6	24293	24298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012109	TAT	3	9	25599	25607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012109	CTT	2	6	26644	26649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012109	TAA	2	6	26665	26670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012109	TCT	2	6	26793	26798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012109	GAC	2	6	27050	27055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012109	GGT	2	6	27094	27099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012109	CAT	2	6	27891	27896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012109	TCA	2	6	27906	27911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012109	CTT	3	9	31943	31951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012109	TTC	2	6	32193	32198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012109	CAA	2	6	32211	32216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012109	AAT	2	6	34148	34153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012109	AAT	2	6	34302	34307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012109	ATG	2	6	34974	34979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012109	AGG	2	6	35113	35118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012109	AAT	2	6	35172	35177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012109	TGT	2	6	35217	35222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012109	GGA	2	6	35268	35273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012109	CTT	2	6	42205	42210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012109	TAT	2	6	42213	42218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012109	AGA	2	6	42929	42934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012109	TTC	2	6	43852	43857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012109	ACT	2	6	44013	44018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012109	AAT	2	6	44082	44087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012109	CCT	2	6	44681	44686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_012109	ATA	2	6	44688	44693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012109	TTG	2	6	45432	45437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012109	AAG	2	6	45450	45455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012109	AAT	2	6	45529	45534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012109	TTG	2	6	46306	46311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012109	TTG	2	6	46515	46520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012109	CCT	2	6	47421	47426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_012109	CGC	2	6	47485	47490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_012109	TTC	2	6	47554	47559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012109	CTG	2	6	47634	47639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012109	CAT	2	6	47805	47810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012109	TTG	2	6	47815	47820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012109	CAA	2	6	47907	47912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012109	ATT	2	6	47954	47959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012109	AGA	2	6	48676	48681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012109	TTC	2	6	49599	49604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_012109	AGT	2	6	49649	49654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012109	ACT	2	6	49760	49765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012109	AAT	2	6	49829	49834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012109	CCT	2	6	50428	50433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_012109	ATA	2	6	50435	50440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012109	TTG	2	6	51179	51184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012109	AAG	2	6	51197	51202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012109	AAT	2	6	51276	51281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012109	TTG	2	6	52053	52058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012109	TTG	2	6	52262	52267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012109	CCT	2	6	53168	53173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_012109	CGC	2	6	53232	53237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_012109	CGC	2	6	54875	54880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012109	CAG	2	6	54881	54886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012109	ACA	2	6	56524	56529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012109	AGG	2	6	57298	57303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012109	ATC	2	6	58457	58462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012109	CAT	2	6	58561	58566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012109	TGC	2	6	58589	58594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012109	AAT	2	6	58778	58783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012109	ATT	2	6	58874	58879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012109	TCA	2	6	60125	60130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012109	CGC	2	6	60150	60155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_012109	GCG	2	6	60171	60176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012109	TTG	2	6	61222	61227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012109	TTG	2	6	61420	61425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012109	TCT	2	6	61636	61641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012109	AAG	2	6	61642	61647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012109	ATT	2	6	61721	61726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012109	ATT	2	6	62402	62407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012109	TTG	2	6	62451	62456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012109	GCG	2	6	62626	62631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012109	TTG	2	6	64543	64548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012109	TTG	2	6	64741	64746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012109	CGC	2	6	64905	64910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_012109	TTG	2	6	64950	64955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012109	TGG	2	6	65909	65914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012109	CAA	2	6	65945	65950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_012109	TGT	2	6	66175	66180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012109	TCA	2	6	66258	66263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_012109	ATT	2	6	66272	66277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012109	GAT	2	6	66290	66295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012109	CAA	2	6	66296	66301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012109	ATC	2	6	66452	66457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_012109	ATA	2	6	66489	66494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012109	TTC	2	6	67350	67355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_012109	AGC	2	6	67537	67542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.