MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfurococcus kamchatkensis 1221n chromosome

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011766	TAAAAA	2	12	30744	30755	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011766	TATGTT	2	12	42223	42234	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011766	TTCCTG	2	12	56044	56055	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011766	GTCACC	2	12	82541	82552	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011766	ATGGTA	2	12	98691	98702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011766	ACCAAC	2	12	104617	104628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011766	AAAAAC	2	12	121659	121670	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011766	TTTTTA	2	12	146475	146486	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011766	AAGTTA	2	12	152117	152128	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011766	GGGTAG	2	12	193565	193576	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011766	AATAAA	2	12	227935	227946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011766	TAGTTT	2	12	305374	305385	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011766	AAGGAC	2	12	401828	401839	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011766	CCTCGT	2	12	415224	415235	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011766	TAAAAA	2	12	427248	427259	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011766	TTGTTT	2	12	477202	477213	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011766	AAGAAA	2	12	517316	517327	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011766	TGTTTA	2	12	519931	519942	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011766	GCACCA	2	12	530751	530762	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_011766	ATTAAG	2	12	556316	556327	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011766	ATTAAT	2	12	556402	556413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011766	TTCCTA	2	12	663433	663444	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011766	ATCAAC	2	12	752136	752147	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011766	GAGCCC	2	12	769759	769770	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011766	TTTTAT	2	12	895447	895458	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011766	GGTTTA	2	12	904825	904836	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011766	CCTATT	2	12	912274	912285	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011766	CCTACG	2	12	960568	960579	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011766	CTCCCC	2	12	961626	961637	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
30	NC_011766	AAAACA	2	12	986673	986684	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011766	TGTTTA	2	12	989042	989053	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011766	GTTTCT	2	12	1120799	1120810	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_011766	AAGGAC	2	12	1159853	1159864	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011766	AAAAGT	2	12	1201330	1201341	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011766	TTTAAC	2	12	1206289	1206300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011766	GCCCTC	2	12	1211774	1211785	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011766	AACATA	3	18	1245113	1245130	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_011766	TTTCCA	2	12	1258967	1258978	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011766	AATTAT	2	12	1323074	1323085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.