MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Dictyoglomus thermophilum H-6-12

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011297	TTATAT	2	12	3590	3601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011297	ATTGTA	2	12	5672	5683	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011297	AATGTA	2	12	10726	10737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011297	TAAATT	2	12	33723	33734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011297	TTAAAT	2	12	33739	33750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011297	TAATTA	2	12	34123	34134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011297	TTTTTC	2	12	36691	36702	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011297	ATTTTT	2	12	58041	58052	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011297	TTCATC	2	12	71113	71124	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011297	AAAAAG	2	12	71922	71933	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011297	CCAAAA	2	12	72294	72305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011297	ATTTTT	2	12	129029	129040	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011297	GCTTCT	2	12	156756	156767	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011297	GTTTCT	2	12	178676	178687	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011297	GAATTT	2	12	209804	209815	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011297	AGATTT	2	12	215631	215642	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011297	TAAAAA	2	12	217642	217653	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011297	ATTTTT	2	12	227123	227134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011297	ACTCTA	2	12	242030	242041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011297	TTAGAA	2	12	246057	246068	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011297	AATTTA	2	12	259519	259530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011297	GAGGGG	2	12	323812	323823	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011297	TTTGTT	2	12	343028	343039	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011297	TAGAAG	2	12	344947	344958	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011297	TTTGAA	2	12	345245	345256	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011297	AAAATT	2	12	356477	356488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011297	ATTTTT	2	12	420348	420359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011297	CTATTT	2	12	428398	428409	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011297	GTAAGA	2	12	438911	438922	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011297	TTAATT	2	12	517420	517431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011297	TTATTT	2	12	526952	526963	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011297	TTTAAA	2	12	571815	571826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011297	AATTAT	2	12	617106	617117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011297	TATTTT	2	12	643548	643559	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011297	TAGATG	2	12	693089	693100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011297	AAATTA	2	12	706021	706032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011297	AGATAA	2	12	707271	707282	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011297	TAAATT	2	12	753012	753023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011297	CTTCGG	2	12	758160	758171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011297	ATCTAA	2	12	817098	817109	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011297	TTTTTA	2	12	1055840	1055851	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011297	ACTCTG	2	12	1111370	1111381	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011297	TAATTT	2	12	1112927	1112938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011297	CCTTAC	2	12	1210307	1210318	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_011297	TAAAGA	2	12	1341439	1341450	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011297	TATTGA	2	12	1381831	1381842	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011297	AAAAAT	2	12	1400177	1400188	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011297	TAAAAA	2	12	1428313	1428324	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011297	ATTTTA	2	12	1470358	1470369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011297	CTAAAA	2	12	1487717	1487728	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011297	AAATTT	2	12	1506337	1506348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011297	AAGTTA	2	12	1528783	1528794	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011297	TAAAAA	2	12	1528808	1528819	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011297	AAATTT	2	12	1542913	1542924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011297	TAAAAA	2	12	1542931	1542942	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011297	ATTGTA	2	12	1545552	1545563	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011297	AAAACC	2	12	1579069	1579080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011297	TATGGT	2	12	1603675	1603686	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011297	AAGTAA	2	12	1646551	1646562	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011297	AATTTT	2	12	1654597	1654608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011297	TAAAGA	2	12	1791341	1791352	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011297	ATTATA	2	12	1798289	1798300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011297	CAAATC	2	12	1834464	1834475	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011297	AAATAA	2	12	1876048	1876059	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011297	AAAAAG	2	12	1939981	1939992	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.