MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Dictyoglomus thermophilum H-6-12

Total Repeats: 436

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011297	AGTA	2	8	1629	1636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011297	CAAA	2	8	1776	1783	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011297	TTAA	2	8	2062	2069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011297	AAAC	2	8	5620	5627	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011297	TAAT	2	8	9727	9734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011297	TTAA	2	8	10757	10764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011297	AGTA	2	8	21856	21863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011297	CTAA	2	8	27008	27015	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_011297	GTTT	2	8	27142	27149	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011297	CCTA	2	8	28298	28305	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011297	GTTA	2	8	33759	33766	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011297	GGGA	2	8	33801	33808	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011297	TGAA	2	8	38880	38887	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011297	CAAA	2	8	42588	42595	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011297	AAAT	2	8	46279	46286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011297	TTGT	2	8	46509	46516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011297	GAAT	2	8	46618	46625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011297	TTTG	2	8	46776	46783	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011297	TTTG	2	8	47040	47047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011297	AAGA	2	8	47163	47170	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011297	TTGT	2	8	47377	47384	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011297	AATC	2	8	47422	47429	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011297	TTGT	2	8	47911	47918	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011297	TTGT	2	8	48045	48052	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011297	ATTC	2	8	48701	48708	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011297	ACGT	2	8	49232	49239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011297	TTTG	2	8	49310	49317	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011297	TTTG	2	8	49444	49451	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011297	TTGT	2	8	50238	50245	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011297	TAGG	2	8	51964	51971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011297	AAAT	2	8	61736	61743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011297	ATTT	2	8	64189	64196	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011297	TTTA	2	8	69970	69977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011297	AAAT	2	8	71768	71775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011297	GAAA	2	8	72029	72036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011297	AATC	2	8	72046	72053	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_011297	CTTT	2	8	72701	72708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011297	ACAT	2	8	87595	87602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011297	AAAG	2	8	96219	96226	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011297	GAAA	2	8	96345	96352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011297	AAGA	2	8	96901	96908	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011297	TTAT	2	8	96942	96949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011297	AGGT	2	8	97250	97257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011297	AGAA	2	8	97300	97307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011297	AAGA	2	8	97539	97546	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011297	ATTT	2	8	97614	97621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011297	TATT	2	8	97634	97641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011297	AAAG	2	8	109395	109402	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011297	GGAA	2	8	111831	111838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011297	TTTA	2	8	134622	134629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011297	TTAT	2	8	136458	136465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011297	CAAA	2	8	143020	143027	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_011297	TATT	2	8	143723	143730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011297	ATTA	2	8	145698	145705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011297	CCTA	2	8	145823	145830	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_011297	ATTT	2	8	154354	154361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011297	TAAA	2	8	155869	155876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011297	TGGA	2	8	158454	158461	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011297	TTTA	2	8	168304	168311	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011297	GAAG	2	8	179147	179154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011297	AATT	2	8	179215	179222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011297	AAGT	2	8	179338	179345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011297	GAAT	2	8	179531	179538	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011297	GGAT	2	8	179653	179660	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011297	TTTG	2	8	179754	179761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011297	TTGT	2	8	179887	179894	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011297	TTTG	2	8	180295	180302	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011297	TTTG	2	8	180830	180837	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011297	TCTT	2	8	181000	181007	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011297	GAAG	2	8	181069	181076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011297	TTGT	2	8	181166	181173	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011297	TTTG	2	8	181630	181637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011297	TTAT	2	8	182065	182072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011297	TTCT	2	8	182080	182087	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011297	AGAA	2	8	182269	182276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011297	AGAA	2	8	182282	182289	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011297	TTGT	2	8	182560	182567	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011297	TTGT	2	8	182758	182765	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011297	CCCT	2	8	191994	192001	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_011297	ATTT	2	8	192012	192019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011297	ATTT	2	8	194056	194063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011297	GAAA	2	8	197686	197693	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011297	TAAT	2	8	197778	197785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011297	CTTT	2	8	206358	206365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_011297	ATAA	2	8	208356	208363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011297	TTCT	2	8	209503	209510	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_011297	TCTA	2	8	209578	209585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011297	AAGT	2	8	210943	210950	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011297	TTGG	2	8	211030	211037	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011297	AGTA	2	8	211081	211088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011297	ATCT	2	8	213840	213847	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_011297	GTAA	2	8	214383	214390	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011297	CCTA	2	8	214425	214432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011297	TAAA	2	8	217622	217629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011297	TTCT	2	8	219187	219194	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011297	AGGG	2	8	219199	219206	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011297	TAAT	2	8	219766	219773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011297	GAAG	2	8	230957	230964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011297	TCAA	2	8	231132	231139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011297	CATC	2	8	237380	237387	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011297	AAAT	2	8	237741	237748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011297	TAAA	2	8	238161	238168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011297	GGTA	2	8	245661	245668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011297	TAAA	2	8	245994	246001	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011297	ATAA	2	8	246093	246100	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011297	TTCC	2	8	246191	246198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_011297	AGAT	2	8	246457	246464	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011297	AAAG	2	8	247433	247440	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011297	GAAT	2	8	249222	249229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011297	TGTT	2	8	259675	259682	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011297	TTTC	2	8	259853	259860	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011297	TTTC	2	8	259895	259902	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011297	TGTT	2	8	260013	260020	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011297	TAAT	2	8	260111	260118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011297	TTTG	2	8	260248	260255	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011297	TGTT	2	8	260270	260277	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011297	CAAA	2	8	260342	260349	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011297	TAAG	2	8	271473	271480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011297	TTAA	2	8	278685	278692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011297	AAGG	2	8	279328	279335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011297	CTTT	2	8	280666	280673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011297	ATTT	2	8	280690	280697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011297	AAAG	2	8	285799	285806	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011297	AGGG	2	8	285867	285874	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011297	AAAG	2	8	294667	294674	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011297	AAGG	2	8	297922	297929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011297	GGGA	2	8	320698	320705	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011297	TCCC	2	8	323828	323835	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
129	NC_011297	GAGG	2	8	328171	328178	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011297	GATT	2	8	334702	334709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011297	TTTA	2	8	342695	342702	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011297	TTAG	2	8	342775	342782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011297	TACA	2	8	345264	345271	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_011297	CTTT	2	8	349223	349230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011297	TAAA	2	8	349271	349278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011297	TTAA	2	8	360878	360885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011297	AATA	2	8	362216	362223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011297	GGGT	2	8	362232	362239	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011297	TCCC	2	8	370311	370318	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_011297	AGGG	2	8	380452	380459	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011297	TGAA	2	8	382207	382214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011297	TACT	2	8	384744	384751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011297	TTTA	2	8	384769	384776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011297	TTAA	2	8	385139	385146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011297	TATT	2	8	385871	385878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011297	AATT	2	8	385898	385905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011297	AATT	2	8	385952	385959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011297	ATTT	2	8	400598	400605	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011297	ATAA	2	8	418315	418322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011297	TTAT	2	8	420277	420284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011297	AGAA	2	8	426777	426784	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011297	AACT	2	8	428335	428342	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_011297	AAAG	2	8	429419	429426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.