MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Dichelobacter nodosus VCS1703A chromosome

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009446	CTACGA	2	12	1636	1647	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009446	ATTTTT	2	12	14818	14829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009446	TAAAAT	2	12	14993	15004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009446	GAATTA	2	12	40677	40688	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009446	AATCGT	2	12	93014	93025	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_009446	TATTGA	2	12	113926	113937	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009446	ATTTTT	2	12	168636	168647	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009446	AAAACA	2	12	170931	170942	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_009446	AGCCGA	2	12	203437	203448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009446	GTTGGC	2	12	203552	203563	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_009446	AGAAAA	2	12	208326	208337	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009446	CACCGT	2	12	234099	234110	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009446	GCTCAT	2	12	296003	296014	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009446	AAAATC	2	12	421713	421724	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_009446	TGCAAA	2	12	422022	422033	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_009446	GTTAGT	2	12	435487	435498	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009446	TTATTT	2	12	457554	457565	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009446	ATTGAA	2	12	463764	463775	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009446	ATAATG	2	12	486978	486989	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009446	TAAAAA	2	12	566945	566956	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009446	TTTTTC	2	12	622786	622797	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_009446	CATTAT	2	12	769056	769067	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_009446	ATTTTA	2	12	836539	836550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009446	TATGGT	2	12	855018	855029	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009446	AATCAA	2	12	885161	885172	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_009446	TCGCTT	2	12	926460	926471	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009446	ATTTTT	2	12	929438	929449	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009446	TATTTT	2	12	929468	929479	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009446	ACCGCT	2	12	995371	995382	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_009446	TCGCTG	2	12	1036785	1036796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009446	GCTCAT	2	12	1076551	1076562	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009446	AAAATG	2	12	1185762	1185773	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009446	CCGGAG	2	12	1242891	1242902	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_009446	TAAAAT	2	12	1264353	1264364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009446	TCGCTT	2	12	1274886	1274897	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009446	ATTTTT	2	12	1277864	1277875	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009446	TCGCTT	2	12	1334856	1334867	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009446	AAAAAT	2	12	1360114	1360125	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.