MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Dichelobacter nodosus VCS1703A chromosome

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009446	GATCA	2	10	117	126	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_009446	TGTTA	2	10	11979	11988	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009446	AAAAG	2	10	31221	31230	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009446	GTTTT	2	10	38515	38524	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009446	CCGCG	2	10	42469	42478	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_009446	TTTGG	2	10	59818	59827	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009446	AAATG	2	10	60484	60493	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009446	GAATT	2	10	60621	60630	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009446	TAAAA	2	10	60795	60804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009446	ATTAA	2	10	67473	67482	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009446	ATAAA	2	10	84983	84992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009446	TTCAT	2	10	85902	85911	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009446	CGGCG	2	10	93478	93487	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_009446	TGATT	6	30	101054	101083	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009446	TGAAA	2	10	130769	130778	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009446	TTTAA	2	10	137744	137753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009446	GAATC	2	10	143167	143176	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_009446	ATAAA	2	10	149489	149498	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009446	AAAGT	2	10	171152	171161	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009446	CGGTT	2	10	181489	181498	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_009446	GGTCG	2	10	207363	207372	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_009446	AAAAT	2	10	231949	231958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009446	TAAAA	2	10	232170	232179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009446	TTTGT	2	10	243501	243510	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009446	CAAAA	2	10	255648	255657	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_009446	AATAA	2	10	259614	259623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009446	AACAT	2	10	273926	273935	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009446	AATCC	2	10	274228	274237	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_009446	AATTA	2	10	290471	290480	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009446	AATGT	2	10	292999	293008	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009446	AAATA	2	10	296182	296191	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009446	GAAAA	2	10	319121	319130	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009446	TTTAT	2	10	327866	327875	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009446	TACAA	2	10	331441	331450	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009446	GTTGA	2	10	345555	345564	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009446	TTATT	2	10	386113	386122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009446	CAAAA	2	10	387723	387732	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_009446	AAAAT	2	10	413580	413589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009446	ATTAA	2	10	422834	422843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009446	GTATT	2	10	428902	428911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009446	ATAAA	2	10	432359	432368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009446	ATGAT	2	10	442356	442365	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009446	TAAAA	2	10	445106	445115	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009446	TTATT	2	10	455471	455480	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009446	AAAAC	2	10	467157	467166	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_009446	AGAAA	2	10	470107	470116	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009446	ATTTT	2	10	482287	482296	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009446	ATTCT	2	10	486487	486496	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_009446	GTAGT	2	10	486866	486875	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009446	TAAGA	2	10	491913	491922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009446	CGCAT	2	10	499778	499787	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_009446	TTCAT	2	10	500676	500685	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_009446	TAAAA	2	10	501153	501162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009446	TTTAA	2	10	501183	501192	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009446	GTTTG	2	10	533714	533723	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009446	AATAA	2	10	533851	533860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009446	CAAAT	2	10	534139	534148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_009446	ATCAC	2	10	560080	560089	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_009446	CACAA	2	10	567105	567114	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_009446	ATTTT	2	10	596805	596814	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009446	AATAA	2	10	608414	608423	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_009446	AATTT	2	10	651995	652004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009446	AAAAT	2	10	660798	660807	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009446	TTTCT	2	10	705879	705888	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_009446	ACTCA	2	10	708463	708472	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_009446	ATGAA	2	10	745661	745670	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009446	GCAGG	2	10	754600	754609	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009446	CATGC	2	10	784453	784462	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_009446	ACGCC	2	10	792795	792804	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_009446	TTTTA	2	10	795649	795658	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009446	TTTTG	2	10	815445	815454	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009446	TTTTA	2	10	820779	820788	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009446	AGCGC	2	10	825347	825356	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009446	TGCCT	2	10	825612	825621	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_009446	TTTCA	2	10	827940	827949	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_009446	TTGCT	2	10	846969	846978	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009446	ATAAA	2	10	891182	891191	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009446	TTTTG	2	10	915489	915498	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009446	TAATA	2	10	922608	922617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009446	ATCTT	2	10	924346	924355	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009446	GCAAT	2	10	924415	924424	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009446	CCTAT	2	10	925010	925019	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_009446	TGCCT	2	10	925741	925750	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_009446	CTTCT	2	10	927475	927484	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_009446	CACGA	2	10	928075	928084	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
86	NC_009446	TATTT	2	10	929200	929209	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009446	ATTTT	2	10	951341	951350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009446	CCTTT	2	10	968548	968557	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_009446	CGTTT	2	10	970967	970976	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_009446	AAAAT	2	10	988391	988400	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009446	CCGCG	2	10	1015007	1015016	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_009446	TTTTA	2	10	1033458	1033467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009446	AAAGA	2	10	1036463	1036472	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009446	AAATA	2	10	1076730	1076739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009446	AATTA	2	10	1077817	1077826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009446	AAGAA	2	10	1078690	1078699	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009446	AAAGC	2	10	1116758	1116767	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009446	TCAAA	2	10	1141068	1141077	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_009446	GATAG	2	10	1141106	1141115	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009446	ATAAA	2	10	1157642	1157651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009446	TAGCA	2	10	1185727	1185736	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_009446	AAAAT	2	10	1201941	1201950	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009446	CCGCC	2	10	1221677	1221686	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
104	NC_009446	TATTT	2	10	1230449	1230458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009446	AAAAC	2	10	1234683	1234692	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_009446	AACAA	2	10	1242690	1242699	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_009446	TAGCA	2	10	1246700	1246709	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009446	TTTTG	2	10	1264289	1264298	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009446	ATCTT	2	10	1272772	1272781	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009446	GCAAT	2	10	1272841	1272850	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_009446	CCTAT	2	10	1273436	1273445	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_009446	TGCCT	2	10	1274167	1274176	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_009446	CTTCT	2	10	1275901	1275910	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_009446	CACGA	2	10	1276501	1276510	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_009446	TATTT	2	10	1277626	1277635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009446	AATGA	2	10	1304005	1304014	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009446	AATTT	2	10	1327389	1327398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009446	TGGTT	2	10	1329332	1329341	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009446	ATCTT	2	10	1332742	1332751	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_009446	GCAAT	2	10	1332811	1332820	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_009446	CCTAT	2	10	1333406	1333415	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_009446	TGCCT	2	10	1334137	1334146	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_009446	CTTCT	2	10	1335871	1335880	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_009446	CACGA	2	10	1336471	1336480	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_009446	TATTT	2	10	1337596	1337605	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009446	ATTTA	2	10	1355561	1355570	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009446	TCTTA	2	10	1357883	1357892	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_009446	TTAAT	2	10	1371178	1371187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009446	TTCAC	2	10	1371354	1371363	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
130	NC_009446	TCAAA	2	10	1374130	1374139	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_009446	TTTTC	2	10	1380528	1380537	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.