MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Dichelobacter nodosus VCS1703A chromosome

Total Repeats: 381

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009446	TTTC	2	8	57	64	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009446	TATT	2	8	7909	7916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009446	AATG	2	8	7958	7965	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009446	CGAA	2	8	9459	9466	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009446	CGAT	2	8	14831	14838	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009446	TGTC	2	8	18729	18736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009446	GCCC	2	8	18824	18831	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_009446	ATTT	2	8	38704	38711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009446	TATT	2	8	38750	38757	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009446	ATTG	2	8	38769	38776	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009446	ATTT	2	8	38808	38815	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009446	TAAA	2	8	38941	38948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009446	TAAA	2	8	40856	40863	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009446	TGCG	2	8	43485	43492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_009446	AAGA	2	8	46893	46900	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009446	AATC	2	8	50436	50443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_009446	AAGA	2	8	60209	60216	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009446	GAAA	2	8	60402	60409	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009446	GTTT	2	8	60642	60649	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009446	GTTT	2	8	61421	61428	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009446	CAAA	2	8	71975	71982	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009446	TAAT	2	8	72794	72801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009446	ATGA	2	8	79635	79642	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009446	CGTT	2	8	80381	80388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009446	TTTC	2	8	92375	92382	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009446	CCAA	2	8	92405	92412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009446	TTTA	2	8	92766	92773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009446	ATTC	2	8	92792	92799	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_009446	AAGG	2	8	92938	92945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009446	ATTG	2	8	93453	93460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009446	CATA	2	8	94238	94245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_009446	CTTT	2	8	94318	94325	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_009446	ATTG	2	8	94502	94509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009446	TGAT	2	8	94803	94810	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009446	AAAG	2	8	94861	94868	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009446	TGAT	2	8	95429	95436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009446	AATG	2	8	109399	109406	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009446	GTTT	2	8	111047	111054	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009446	TAAA	2	8	111123	111130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009446	CAAT	2	8	114061	114068	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009446	GCGG	2	8	116682	116689	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009446	TAAG	2	8	117627	117634	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009446	CTTG	2	8	123065	123072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_009446	ATTT	2	8	135875	135882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009446	TATT	2	8	138819	138826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009446	ATTT	2	8	138886	138893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_009446	GATT	2	8	138945	138952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009446	GATT	2	8	142923	142930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009446	TTTA	2	8	146892	146899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009446	AAAT	2	8	146928	146935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009446	CTTT	2	8	147011	147018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_009446	TTAT	2	8	148524	148531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009446	GCAT	2	8	149479	149486	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009446	TTAT	2	8	149499	149506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009446	AATT	2	8	149566	149573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009446	CGAT	2	8	161238	161245	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009446	GCTT	2	8	161420	161427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_009446	TGCT	2	8	168651	168658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_009446	TGAT	2	8	173564	173571	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009446	CAAA	2	8	179102	179109	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_009446	CGGT	2	8	179460	179467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009446	AATT	2	8	179515	179522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009446	CCTG	2	8	206714	206721	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009446	CCTT	2	8	207241	207248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009446	ATCA	2	8	208160	208167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_009446	TCTT	2	8	213279	213286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_009446	CAAA	2	8	213378	213385	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_009446	TTCA	2	8	213394	213401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_009446	TGAA	2	8	213435	213442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009446	AATA	2	8	225652	225659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009446	ACAA	2	8	225765	225772	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009446	AATG	2	8	231550	231557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009446	GTTT	2	8	231754	231761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009446	CGTG	2	8	232005	232012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_009446	GCTG	2	8	232218	232225	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_009446	AATA	2	8	232234	232241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009446	CTTT	2	8	233984	233991	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009446	TGAA	2	8	245476	245483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009446	ATCA	2	8	250121	250128	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_009446	TTAG	2	8	251565	251572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009446	ATTG	2	8	252236	252243	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009446	TGGT	2	8	273617	273624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009446	GCAC	2	8	273725	273732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_009446	TTAG	2	8	286204	286211	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009446	GTTT	2	8	286626	286633	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009446	ATTT	2	8	287539	287546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009446	GAGC	2	8	287757	287764	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_009446	CTTT	2	8	288583	288590	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009446	TCAA	2	8	290116	290123	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_009446	TTTA	2	8	290715	290722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009446	ATTA	2	8	290730	290737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009446	TGAT	2	8	293069	293076	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009446	CTTT	2	8	293770	293777	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009446	ATTT	2	8	294425	294432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009446	AACC	2	8	294511	294518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009446	AGAA	2	8	294658	294665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009446	TCAA	2	8	297430	297437	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009446	TTCA	2	8	297624	297631	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009446	ACAT	2	8	297850	297857	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_009446	CTGT	2	8	299973	299980	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_009446	CACT	2	8	308746	308753	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009446	TAAA	2	8	317802	317809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009446	AGCC	2	8	327666	327673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_009446	CGTG	2	8	327744	327751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_009446	AAAC	2	8	327889	327896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_009446	TGCC	2	8	329122	329129	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_009446	AATC	2	8	329284	329291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_009446	ATCA	2	8	331565	331572	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_009446	TTAT	2	8	337983	337990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009446	TTTA	2	8	338053	338060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009446	AAGG	2	8	339053	339060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009446	AAAG	2	8	339158	339165	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009446	TTAT	2	8	343997	344004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009446	ATTT	2	8	345511	345518	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009446	TAAA	2	8	345647	345654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009446	TTGC	2	8	350530	350537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_009446	GGCG	2	8	368511	368518	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_009446	GAAA	2	8	368548	368555	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009446	AAGG	2	8	386078	386085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009446	GTTT	2	8	401257	401264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009446	GCAA	2	8	413554	413561	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009446	CAAG	2	8	421790	421797	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009446	CAAA	2	8	422482	422489	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_009446	AAAG	2	8	422912	422919	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009446	AAGC	2	8	423336	423343	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_009446	ACCA	2	8	428997	429004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_009446	GCTT	2	8	429672	429679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_009446	ATCG	2	8	432396	432403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009446	TAAA	2	8	435119	435126	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009446	ATTT	2	8	435421	435428	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009446	ATCA	2	8	438037	438044	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009446	TGAT	2	8	445907	445914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009446	TGAT	2	8	450198	450205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009446	CCTG	2	8	452749	452756	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009446	CCTG	2	8	452878	452885	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_009446	ATCA	2	8	453063	453070	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_009446	TTTA	2	8	453358	453365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009446	GCTT	2	8	457015	457022	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009446	CTTT	2	8	459580	459587	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_009446	AAAT	2	8	459613	459620	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009446	CAAA	2	8	486468	486475	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_009446	GCTT	2	8	486557	486564	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_009446	TTAA	2	8	486914	486921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009446	CAGA	2	8	487480	487487	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_009446	TAGA	2	8	487562	487569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009446	TTTA	2	8	487844	487851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009446	AACA	2	8	499502	499509	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_009446	TTAT	2	8	500823	500830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009446	TTTA	2	8	506018	506025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009446	ATTG	2	8	522114	522121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_009446	ATTT	2	8	530097	530104	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.