MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus geothermalis DSM 11300 plasmid pDGEO01

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008010	CTCCA	2	10	10	19	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_008010	TTGGT	2	10	2469	2478	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008010	CGAGC	2	10	8638	8647	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_008010	TCGTG	2	10	9929	9938	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008010	AATTG	2	10	12635	12644	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008010	GCGAA	2	10	22249	22258	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008010	GTGCG	2	10	57747	57756	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008010	TCACG	2	10	69623	69632	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_008010	GCGGG	2	10	81082	81091	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008010	CGGAC	2	10	89879	89888	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_008010	TGGGG	2	10	109621	109630	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008010	CCGAC	2	10	146481	146490	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_008010	AGTGG	2	10	150406	150415	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008010	CAACG	2	10	153147	153156	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008010	CAACC	2	10	167571	167580	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_008010	GGTCC	2	10	185945	185954	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008010	CCCGC	2	10	188267	188276	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
18	NC_008010	AGGGG	2	10	201845	201854	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008010	GTGAA	2	10	205725	205734	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008010	TTGGT	2	10	214329	214338	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008010	GGGGT	2	10	218222	218231	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008010	AGTCA	2	10	220003	220012	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008010	TTTCC	2	10	221383	221392	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_008010	AGGTC	2	10	221639	221648	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_008010	TGCCT	2	10	222371	222380	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_008010	CCGGA	2	10	227278	227287	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_008010	CCGTT	2	10	229955	229964	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_008010	TGGGA	2	10	230810	230819	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008010	GCCCC	2	10	238204	238213	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
30	NC_008010	CGGGA	2	10	249160	249169	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008010	CTTTT	2	10	258859	258868	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008010	GGGGC	2	10	315143	315152	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008010	CAGGA	2	10	345380	345389	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008010	ACACC	2	10	361122	361131	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
35	NC_008010	CCCCG	2	10	376940	376949	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
36	NC_008010	TCGCT	2	10	402717	402726	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_008010	GCCGC	3	15	404104	404118	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_008010	ACGCC	2	10	406608	406617	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_008010	AAACG	2	10	429115	429124	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008010	TTCCT	2	10	440717	440726	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_008010	GGCGT	2	10	460744	460753	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008010	CCCCG	2	10	475599	475608	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
43	NC_008010	CTACG	2	10	479836	479845	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_008010	GGAGA	2	10	479880	479889	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008010	CGGCG	2	10	487267	487276	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008010	TCACC	2	10	487339	487348	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_008010	AGTTC	2	10	487656	487665	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008010	CTGCC	2	10	501115	501124	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_008010	CGGAA	2	10	509542	509551	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_008010	CGCTG	2	10	517763	517772	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_008010	CCCTG	2	10	550400	550409	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
52	NC_008010	GCCCG	2	10	553541	553550	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_008010	CCTCC	2	10	556161	556170	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.