MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfitobacterium hafniense Y51 chromosome

Total Repeats: 874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007907	AATAT	2	10	8673	8682	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007907	CGTCA	2	10	10736	10745	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_007907	TTGTT	2	10	13670	13679	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007907	CTATT	2	10	15631	15640	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_007907	TCATA	2	10	26565	26574	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_007907	TTTTC	2	10	30743	30752	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_007907	CGGTG	2	10	45405	45414	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_007907	TTTCC	2	10	45759	45768	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_007907	GGGCA	2	10	46766	46775	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007907	AGTTT	2	10	50762	50771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007907	ATCAA	2	10	75283	75292	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_007907	GAACA	2	10	79540	79549	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007907	GAGCG	2	10	79648	79657	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_007907	ATTCA	2	10	83700	83709	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_007907	GGAGG	2	10	90052	90061	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007907	AAGAA	2	10	99112	99121	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007907	CAGGA	2	10	111169	111178	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_007907	TGGAC	2	10	114080	114089	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_007907	CGGAG	2	10	132681	132690	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_007907	CAAAG	2	10	135610	135619	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_007907	AAAAG	2	10	138924	138933	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007907	TATGA	2	10	170845	170854	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_007907	ATATA	2	10	172021	172030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007907	TCCTT	2	10	190596	190605	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_007907	TCCGC	2	10	193300	193309	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_007907	TGAAG	2	10	197940	197949	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_007907	ATAGT	2	10	198805	198814	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007907	AATTG	2	10	226505	226514	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007907	CCTTT	2	10	236573	236582	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_007907	TCGTG	2	10	238183	238192	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_007907	GAAGC	2	10	238369	238378	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_007907	GGGAG	2	10	239592	239601	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007907	AGAGG	2	10	240933	240942	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007907	TTGAA	2	10	240962	240971	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007907	GACAG	2	10	241129	241138	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_007907	AAAGA	2	10	244420	244429	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007907	ATAAG	2	10	244679	244688	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007907	TAGGA	2	10	244808	244817	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007907	GAAAA	2	10	249113	249122	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007907	TGCTT	2	10	249146	249155	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_007907	GCATG	2	10	264661	264670	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_007907	TTTTG	2	10	271140	271149	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007907	GAGCG	2	10	279111	279120	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
44	NC_007907	GAAAG	2	10	281794	281803	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007907	GCTTC	2	10	286932	286941	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_007907	TTGGT	2	10	289631	289640	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007907	TTTGC	2	10	290070	290079	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_007907	CTTTT	2	10	301162	301171	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_007907	ATTTG	2	10	307902	307911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007907	ATCCA	2	10	308047	308056	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_007907	ACAAA	2	10	328768	328777	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_007907	TCGTG	2	10	330110	330119	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_007907	GAAGC	2	10	330296	330305	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_007907	GGGAG	2	10	331444	331453	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
55	NC_007907	AGAGG	2	10	332785	332794	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007907	TTGAA	2	10	332814	332823	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007907	GACAG	2	10	332981	332990	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_007907	CTTTG	2	10	334119	334128	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_007907	AGTAT	2	10	334413	334422	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007907	ATTCC	2	10	335739	335748	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_007907	TCGTG	2	10	341738	341747	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_007907	GAAGC	2	10	341924	341933	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_007907	GGGAG	2	10	343147	343156	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
64	NC_007907	AGAGG	2	10	344488	344497	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007907	TTGAA	2	10	344517	344526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007907	GACAG	2	10	344684	344693	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007907	CTTTG	2	10	345823	345832	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_007907	ATTTG	2	10	345989	345998	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007907	TTATT	2	10	353786	353795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007907	TATAA	2	10	353880	353889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007907	CTTGC	2	10	371392	371401	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_007907	GAGTT	2	10	377708	377717	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007907	TGCTT	2	10	381172	381181	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_007907	AAAAT	2	10	387639	387648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007907	TACAT	2	10	399207	399216	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_007907	TGATA	2	10	405637	405646	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007907	GCTAT	2	10	420930	420939	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_007907	AGCAA	2	10	437770	437779	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_007907	CCCTC	2	10	443890	443899	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
80	NC_007907	ACCTC	2	10	445753	445762	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_007907	AAGAA	2	10	449995	450004	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007907	AAAGA	2	10	450379	450388	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007907	AAGGA	2	10	453709	453718	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007907	ATATT	2	10	468615	468624	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007907	CAACT	2	10	479397	479406	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_007907	CGCTG	2	10	522295	522304	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_007907	CAAAA	2	10	522395	522404	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_007907	GATCG	2	10	530930	530939	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007907	AATAA	2	10	559969	559978	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007907	AGATT	2	10	567633	567642	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007907	GGAGC	2	10	571657	571666	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_007907	ATCTT	2	10	573587	573596	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_007907	TTAAG	2	10	575437	575446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007907	TCCTT	2	10	576761	576770	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_007907	GAAAG	2	10	580178	580187	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007907	CTATG	2	10	624525	624534	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_007907	ATGAA	2	10	629039	629048	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007907	CTGTG	2	10	645969	645978	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_007907	ACCCC	2	10	654400	654409	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
100	NC_007907	GGGAA	2	10	656532	656541	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007907	GTTTT	2	10	685789	685798	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007907	AAGTA	2	10	685848	685857	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_007907	TGAGG	2	10	690290	690299	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_007907	CAAAA	2	10	693352	693361	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_007907	AGAGT	2	10	698731	698740	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007907	AGAGT	2	10	698814	698823	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_007907	CGATT	2	10	706795	706804	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_007907	TGATT	2	10	707902	707911	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007907	AAGAA	2	10	709343	709352	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007907	AAGCA	2	10	719443	719452	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_007907	ATTAA	2	10	722117	722126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_007907	CCAAT	2	10	722132	722141	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_007907	AGGGA	2	10	725114	725123	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007907	GAAAA	2	10	728608	728617	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_007907	CCGAA	2	10	736817	736826	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_007907	TTTGT	2	10	764704	764713	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007907	TATAA	2	10	764881	764890	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007907	GAGAG	2	10	775083	775092	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007907	TGGGG	2	10	776231	776240	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007907	ACAAA	2	10	778127	778136	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_007907	TCTAA	2	10	778594	778603	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_007907	GGTTT	2	10	822986	822995	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007907	TCAAT	2	10	828491	828500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_007907	ATTTA	2	10	829556	829565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007907	CAATA	2	10	837677	837686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_007907	ATTCA	2	10	842538	842547	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_007907	GCAAA	2	10	849231	849240	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007907	TTTAA	2	10	880298	880307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007907	GACAA	2	10	886865	886874	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_007907	TCCGT	2	10	888391	888400	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_007907	CCTTA	2	10	909148	909157	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_007907	TTAAG	2	10	911145	911154	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007907	AATGC	2	10	930022	930031	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_007907	CATTT	2	10	933259	933268	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_007907	ATTGT	2	10	944558	944567	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007907	AATAG	2	10	952934	952943	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_007907	AAATG	2	10	954542	954551	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_007907	TGCCT	2	10	978221	978230	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_007907	GAAAT	2	10	978715	978724	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_007907	GGACG	2	10	978788	978797	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_007907	TCATA	2	10	979745	979754	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_007907	TATAC	2	10	980369	980378	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_007907	AGAAA	2	10	986017	986026	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007907	AGAAA	2	10	992498	992507	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_007907	ATGCT	2	10	993686	993695	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_007907	GGGTA	2	10	998866	998875	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
147	NC_007907	GGGTT	2	10	999129	999138	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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