MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio alaskensis G20 chromosome

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007519	AACCGG	2	12	21799	21810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007519	TGCTGT	2	12	41357	41368	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_007519	TGTTTT	2	12	59825	59836	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007519	TATGGT	2	12	62787	62798	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007519	ACTGAC	2	12	70591	70602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_007519	TTGCAA	2	12	71699	71710	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_007519	TGCAGA	2	12	89402	89413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_007519	GTTCCG	2	12	100284	100295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_007519	TTACGG	2	12	117703	117714	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_007519	TGCGGT	2	12	143220	143231	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_007519	CGCCTG	2	12	185497	185508	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_007519	CCGCGT	2	12	196354	196365	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_007519	TTTTTA	2	12	229558	229569	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007519	TTGTTT	2	12	272141	272152	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007519	TGAAAA	2	12	273797	273808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007519	GGCAGC	2	12	287591	287602	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_007519	AAATGA	2	12	293649	293660	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007519	CCGTTC	37	222	337635	337856	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_007519	TTTTTG	2	12	361446	361457	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007519	TCTGTG	2	12	393308	393319	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_007519	GCGGGC	2	12	411396	411407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_007519	TTTCAT	2	12	447503	447514	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_007519	ATGTGC	2	12	469650	469661	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_007519	CCTGCA	2	12	492070	492081	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007519	TGCGGC	2	12	511209	511220	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_007519	GGCAGG	2	12	541341	541352	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_007519	CCAGCC	2	12	541438	541449	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_007519	GCCGGA	2	12	577996	578007	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_007519	TGACAA	2	12	580372	580383	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_007519	TGTCCC	2	12	591873	591884	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007519	CCGGTG	2	12	611513	611524	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_007519	TCCGGT	2	12	631067	631078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_007519	ATTTAT	2	12	639141	639152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007519	GGGTAT	2	12	644621	644632	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007519	GGATGC	2	12	666615	666626	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_007519	TTTTAT	2	12	675967	675978	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007519	ATTACC	2	12	678098	678109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_007519	TCCGCA	2	12	689539	689550	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_007519	CGCAGG	2	12	742025	742036	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_007519	TGGAGG	2	12	771728	771739	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007519	TTGAAA	2	12	798051	798062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007519	AACTGA	2	12	804697	804708	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_007519	CTTCCA	2	12	886164	886175	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_007519	GCCGGT	2	12	913177	913188	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_007519	GGCTCC	2	12	937555	937566	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007519	TCGGCT	2	12	981298	981309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_007519	TATTCA	2	12	1016529	1016540	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_007519	GGAGAG	2	12	1028171	1028182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007519	GGAGAG	2	12	1028533	1028544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007519	GCGCGG	2	12	1085011	1085022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_007519	GGACAG	2	12	1109245	1109256	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_007519	GCAGCC	2	12	1114336	1114347	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_007519	AAGAAT	2	12	1170096	1170107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007519	GTGCCG	2	12	1179133	1179144	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_007519	AGCGTT	2	12	1255214	1255225	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_007519	GTATCC	2	12	1295731	1295742	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_007519	ACTGAC	2	12	1310182	1310193	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_007519	TTGCAA	2	12	1311290	1311301	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_007519	GACGCC	2	12	1318237	1318248	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_007519	GAAAAA	2	12	1357570	1357581	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_007519	TTTTCC	2	12	1364834	1364845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_007519	ACAGAG	2	12	1381692	1381703	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_007519	CTGAAA	2	12	1382765	1382776	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_007519	ATACCC	2	12	1383352	1383363	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_007519	TGCCGG	2	12	1414523	1414534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_007519	TTTCCA	2	12	1414676	1414687	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_007519	GCGCGG	2	12	1432929	1432940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_007519	CCATAA	2	12	1432985	1432996	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_007519	ACGGCG	2	12	1501874	1501885	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_007519	TGCCGT	2	12	1523669	1523680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_007519	GCGGAT	2	12	1530006	1530017	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_007519	ACTTTT	2	12	1572549	1572560	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_007519	CAGGGG	2	12	1594484	1594495	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_007519	GCAGGC	2	12	1691864	1691875	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_007519	TCAAAC	2	12	1700138	1700149	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007519	TGTGTT	2	12	1716247	1716258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007519	GGGGAG	2	12	1765790	1765801	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007519	CCGTCA	2	12	1785335	1785346	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_007519	TAATTG	2	12	1791045	1791056	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007519	TTTCCT	2	12	1800317	1800328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007519	CTGTGG	2	12	1816424	1816435	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_007519	AAAAAT	2	12	1840290	1840301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007519	AAAATA	2	12	1885028	1885039	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007519	TCCGGC	2	12	2012385	2012396	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_007519	TCTGCA	2	12	2012675	2012686	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_007519	CTTTTT	2	12	2044715	2044726	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_007519	AACGGC	2	12	2104632	2104643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_007519	TCAGAA	2	12	2108948	2108959	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_007519	AAACTA	2	12	2165439	2165450	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_007519	TCTGCC	2	12	2180542	2180553	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_007519	AATCAA	2	12	2198005	2198016	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_007519	AACCGG	2	12	2296723	2296734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_007519	CAACCG	2	12	2312675	2312686	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_007519	CCGTAC	2	12	2321134	2321145	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_007519	CAACCC	2	12	2377702	2377713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_007519	GCCTCG	2	12	2420723	2420734	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
97	NC_007519	GAAAAA	3	18	2426145	2426162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007519	GCACCG	2	12	2477642	2477653	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_007519	ACGATT	2	12	2498767	2498778	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_007519	GCACAC	2	12	2537830	2537841	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_007519	ACCGGC	2	12	2557728	2557739	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_007519	CTGCCG	2	12	2571650	2571661	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_007519	TTGCAA	2	12	2607331	2607342	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_007519	GTCAGT	2	12	2608439	2608450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_007519	GAAGCA	2	12	2629089	2629100	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_007519	CTGCAG	2	12	2629214	2629225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007519	CTTTTT	2	12	2657363	2657374	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_007519	TGCCTG	2	12	2692421	2692432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_007519	TTCCGG	2	12	2753189	2753200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_007519	CTTACA	2	12	2780772	2780783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007519	CAATTA	2	12	2794860	2794871	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_007519	CGGCAC	2	12	2804476	2804487	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_007519	ACAGCC	2	12	2816927	2816938	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_007519	TGCGCA	2	12	2838110	2838121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007519	CAAAAA	2	12	2845041	2845052	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_007519	GAAAAA	2	12	2849534	2849545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007519	CTCTAT	2	12	2886777	2886788	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_007519	CAGAAA	2	12	2918793	2918804	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_007519	CTGCCG	2	12	2938232	2938243	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_007519	CGGCAA	2	12	2945665	2945676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007519	CCTGTC	2	12	2945836	2945847	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_007519	TTTCAG	2	12	2983250	2983261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_007519	CCCCCG	2	12	3003332	3003343	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
124	NC_007519	GAGCAT	2	12	3017496	3017507	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_007519	CCCCTT	2	12	3030585	3030596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_007519	CCCCCG	2	12	3030708	3030719	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
127	NC_007519	GCCGCA	2	12	3052590	3052601	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_007519	AGGCAG	2	12	3092474	3092485	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_007519	CCGGCA	2	12	3117371	3117382	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_007519	ACAGAA	2	12	3133773	3133784	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_007519	GCACCG	2	12	3219575	3219586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
132	NC_007519	GTGCGT	2	12	3268066	3268077	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_007519	CGCAAC	2	12	3290709	3290720	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_007519	AAGCCC	2	12	3324352	3324363	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
135	NC_007519	ACGACC	2	12	3325991	3326002	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_007519	ACCATA	2	12	3333494	3333505	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_007519	GCCGCG	2	12	3431189	3431200	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_007519	GTGCGG	2	12	3456817	3456828	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_007519	ATACAC	2	12	3496847	3496858	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_007519	GGCACA	2	12	3511573	3511584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007519	AAAAAT	2	12	3518784	3518795	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_007519	TTGCAA	2	12	3536903	3536914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_007519	GTCAGT	2	12	3538011	3538022	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_007519	TGCCGC	2	12	3570092	3570103	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
145	NC_007519	CTGCCG	2	12	3570159	3570170	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
146	NC_007519	ATCCGG	2	12	3570225	3570236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_007519	CTCCAA	2	12	3570732	3570743	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_007519	CGGCTG	2	12	3600618	3600629	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_007519	GCTGCG	3	18	3614246	3614263	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_007519	CCAGCC	2	12	3664215	3664226	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_007519	CTGCCG	2	12	3665301	3665312	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
152	NC_007519	ATTTTC	2	12	3689688	3689699	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_007519	AAGGCG	2	12	3701001	3701012	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_007519	AAGGCG	2	12	3703562	3703573	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.