MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007356	AG	3	6	61	66	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007356	GT	3	6	210	215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_007356	AT	3	6	5839	5844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_007356	TA	4	8	11373	11380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_007356	TC	3	6	18458	18463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_007356	AT	3	6	19495	19500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_007356	AT	3	6	20314	20319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007356	AT	3	6	28674	28679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007356	GT	3	6	28714	28719	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007356	AT	4	8	29833	29840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_007356	AT	3	6	32446	32451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007356	AT	4	8	37203	37210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007356	TA	3	6	41859	41864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_007356	AG	3	6	47587	47592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_007356	GA	3	6	48689	48694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_007356	GA	3	6	49341	49346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_007356	GT	3	6	50466	50471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_007356	GT	3	6	50624	50629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_007356	TC	3	6	58917	58922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_007356	AT	3	6	64932	64937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_007356	AG	3	6	68994	68999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_007356	TC	3	6	69897	69902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_007356	TA	4	8	69924	69931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_007356	TC	3	6	69937	69942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_007356	TC	3	6	74111	74116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_007356	AC	3	6	75058	75063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_007356	TG	3	6	75118	75123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_007356	TA	3	6	77278	77283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_007356	TC	3	6	78827	78832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_007356	TC	3	6	82269	82274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_007356	TA	3	6	90471	90476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007356	GA	3	6	107825	107830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007356	TA	3	6	107859	107864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_007356	TA	3	6	107894	107899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007356	CA	3	6	108008	108013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_007356	AT	3	6	108394	108399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_007356	TA	3	6	117210	117215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007356	AT	3	6	117314	117319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007356	AT	3	6	122163	122168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007356	AT	3	6	126568	126573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007356	AT	4	8	139754	139761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_007356	TA	3	6	139819	139824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_007356	AG	3	6	145879	145884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007356	GT	3	6	146531	146536	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007356	CT	3	6	152449	152454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_007356	TA	3	6	156149	156154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_007356	AT	3	6	156176	156181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_007356	TG	3	6	156232	156237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_007356	TA	3	6	161981	161986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_007356	GC	3	6	170265	170270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_007356	GT	3	6	175466	175471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_007356	AT	3	6	186447	186452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_007356	TA	3	6	192081	192086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_007356	TC	3	6	195433	195438	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_007356	GA	3	6	205160	205165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007356	AT	3	6	210223	210228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_007356	GT	3	6	215694	215699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_007356	AT	3	6	230109	230114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007356	TA	3	6	231041	231046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_007356	AC	3	6	242804	242809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_007356	TA	3	6	243447	243452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_007356	TA	4	8	246497	246504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_007356	TC	3	6	247267	247272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_007356	AT	3	6	247340	247345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_007356	AT	3	6	247350	247355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_007356	GA	3	6	247426	247431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_007356	CT	3	6	257898	257903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_007356	GA	3	6	259915	259920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_007356	AT	5	10	264039	264048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007356	TA	3	6	270128	270133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007356	AG	3	6	273023	273028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007356	AT	3	6	279481	279486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007356	AG	3	6	286909	286914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007356	AT	4	8	302053	302060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007356	TA	3	6	305543	305548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007356	AT	3	6	310540	310545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_007356	AG	3	6	314237	314242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_007356	TA	3	6	322173	322178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_007356	TA	3	6	323479	323484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_007356	AT	3	6	327996	328001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_007356	AT	3	6	343891	343896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007356	TA	3	6	353872	353877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007356	TA	4	8	361308	361315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_007356	GA	3	6	371117	371122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_007356	TA	4	8	382648	382655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007356	TA	3	6	383215	383220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_007356	AT	3	6	442337	442342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_007356	AT	3	6	443057	443062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_007356	AT	3	6	443173	443178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_007356	CT	3	6	452694	452699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_007356	TA	3	6	473634	473639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_007356	TA	4	8	475902	475909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007356	TA	5	10	475922	475931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_007356	AT	3	6	485717	485722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007356	AT	3	6	487254	487259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007356	AT	3	6	489439	489444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_007356	TG	4	8	489523	489530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_007356	TA	3	6	489540	489545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_007356	AT	3	6	502184	502189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_007356	AT	3	6	502271	502276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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108	NC_007356	AG	4	8	519991	519998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007356	AT	4	8	527354	527361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007356	TA	3	6	532925	532930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_007356	AC	3	6	557076	557081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_007356	TA	3	6	557558	557563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007356	AT	3	6	557586	557591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007356	TC	3	6	559052	559057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_007356	GC	3	6	565208	565213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_007356	GT	3	6	565307	565312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_007356	AT	3	6	568410	568415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_007356	TA	3	6	569310	569315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_007356	GT	3	6	569363	569368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_007356	TA	3	6	569406	569411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007356	TA	3	6	569425	569430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007356	AT	3	6	571080	571085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007356	AT	3	6	571106	571111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007356	TA	3	6	571193	571198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007356	TC	3	6	575872	575877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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130	NC_007356	AT	3	6	588763	588768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_007356	AT	3	6	596356	596361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_007356	TA	4	8	597832	597839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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135	NC_007356	AT	3	6	598016	598021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_007356	TA	3	6	598099	598104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_007356	CA	3	6	635222	635227	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.