MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Dehalococcoides sp. CBDB1 chromosome

Total Repeats: 2840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_007356	GCT	2	6	228957	228962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_007356	GTA	2	6	228993	228998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_007356	GAA	2	6	229004	229009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_007356	CTTA	2	8	229018	229025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_007356	TAC	2	6	229052	229057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_007356	TAT	2	6	229732	229737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_007356	ATA	2	6	229805	229810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_007356	TTA	2	6	229855	229860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_007356	AAT	2	6	229918	229923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_007356	AT	3	6	230109	230114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_007356	CCT	2	6	230115	230120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_007356	ATT	2	6	230179	230184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_007356	CCT	2	6	230234	230239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_007356	AGAT	2	8	230998	231005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_007356	TA	3	6	231041	231046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_007356	TGG	2	6	231199	231204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_007356	CCT	3	9	231229	231237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_007356	AGG	2	6	231243	231248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_007356	CAAG	2	8	236277	236284	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
520	NC_007356	TAT	2	6	238940	238945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_007356	AC	3	6	242804	242809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_007356	GCG	2	6	242829	242834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_007356	TAA	2	6	243321	243326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_007356	TAT	2	6	243327	243332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_007356	AAC	2	6	243395	243400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_007356	T	6	6	243418	243423	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_007356	TA	3	6	243447	243452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_007356	T	6	6	243494	243499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_007356	TA	4	8	246497	246504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_007356	TC	3	6	247267	247272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_007356	GTT	2	6	247291	247296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_007356	AT	3	6	247340	247345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_007356	AT	3	6	247350	247355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_007356	GA	3	6	247426	247431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_007356	AAG	2	6	247438	247443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_007356	GGAG	2	8	248985	248992	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
537	NC_007356	ATCT	2	8	251497	251504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
538	NC_007356	CAGC	2	8	252188	252195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
539	NC_007356	TTG	2	6	252243	252248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_007356	GAT	2	6	252285	252290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_007356	GATA	2	8	252293	252300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_007356	AGG	2	6	252367	252372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_007356	ATTAG	2	10	254790	254799	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
544	NC_007356	T	7	7	254840	254846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_007356	ATA	2	6	254854	254859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_007356	TAT	2	6	254860	254865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_007356	GTG	2	6	254886	254891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_007356	A	7	7	257801	257807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_007356	AGA	2	6	257889	257894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_007356	CT	3	6	257898	257903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_007356	AAT	2	6	257923	257928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_007356	CCT	2	6	259731	259736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_007356	CCT	2	6	259788	259793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_007356	AAT	2	6	259799	259804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_007356	TAA	2	6	259827	259832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_007356	AAG	2	6	259904	259909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_007356	GA	3	6	259915	259920	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_007356	TTA	2	6	259926	259931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_007356	AGA	2	6	259949	259954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_007356	TGC	2	6	259963	259968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_007356	CTG	2	6	261208	261213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_007356	ATC	2	6	261631	261636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_007356	ATT	2	6	262420	262425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_007356	CCCGG	2	10	262456	262465	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
565	NC_007356	A	6	6	262494	262499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_007356	CCA	2	6	262538	262543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_007356	GCC	2	6	262926	262931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_007356	GGA	2	6	262945	262950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_007356	CTC	2	6	262960	262965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_007356	G	7	7	262991	262997	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
571	NC_007356	TAGA	2	8	263197	263204	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_007356	TCA	2	6	263208	263213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_007356	ATTT	2	8	263267	263274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_007356	ACC	2	6	263281	263286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_007356	GGT	2	6	263296	263301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_007356	AT	5	10	264039	264048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_007356	ATA	2	6	264128	264133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_007356	CTC	2	6	264262	264267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_007356	GGT	2	6	264269	264274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_007356	TGC	2	6	264276	264281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_007356	TCAAA	2	10	264520	264529	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
582	NC_007356	AGT	2	6	264582	264587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_007356	AGGC	2	8	265787	265794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
584	NC_007356	GGAC	2	8	265801	265808	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
585	NC_007356	T	6	6	269413	269418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_007356	TAT	2	6	269433	269438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_007356	GGA	2	6	269445	269450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
588	NC_007356	TA	3	6	270128	270133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_007356	ATC	2	6	271916	271921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_007356	AAG	2	6	271927	271932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_007356	AG	3	6	273023	273028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_007356	AGG	2	6	276735	276740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_007356	A	6	6	278063	278068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_007356	TTA	2	6	278582	278587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_007356	TAT	2	6	278599	278604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_007356	TAGT	2	8	279357	279364	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
597	NC_007356	ATG	2	6	279392	279397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_007356	AT	3	6	279481	279486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_007356	CTA	2	6	284098	284103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_007356	ATT	2	6	284137	284142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_007356	TAA	2	6	284158	284163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_007356	GGA	2	6	284222	284227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_007356	AGC	2	6	284729	284734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_007356	CCG	2	6	284746	284751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_007356	CATT	2	8	284781	284788	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_007356	TGA	2	6	284791	284796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_007356	TAA	2	6	285609	285614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_007356	A	6	6	285613	285618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_007356	AGTCA	2	10	286852	286861	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
610	NC_007356	TAT	2	6	286880	286885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_007356	AG	3	6	286909	286914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_007356	TTTG	2	8	286930	286937	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_007356	TAT	2	6	286990	286995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_007356	TGGG	2	8	287003	287010	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
615	NC_007356	AAT	2	6	287055	287060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_007356	AGG	2	6	289810	289815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_007356	GAG	2	6	290799	290804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_007356	CGGG	2	8	291042	291049	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
619	NC_007356	CAAA	2	8	291080	291087	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
620	NC_007356	A	6	6	291085	291090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_007356	TAA	2	6	292970	292975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_007356	GTG	2	6	293792	293797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_007356	A	6	6	293883	293888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_007356	GGA	2	6	293958	293963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_007356	T	6	6	297617	297622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_007356	A	6	6	297797	297802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_007356	TAAA	2	8	297861	297868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_007356	AT	4	8	302053	302060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_007356	ACA	2	6	302062	302067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_007356	CTT	2	6	302070	302075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_007356	TGTTT	2	10	302083	302092	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
632	NC_007356	TAT	2	6	304655	304660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_007356	AGG	2	6	304681	304686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_007356	TCT	2	6	305198	305203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_007356	T	6	6	305523	305528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_007356	TA	3	6	305543	305548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_007356	TCTG	2	8	307670	307677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
638	NC_007356	AT	3	6	310540	310545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_007356	ATT	2	6	312072	312077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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641	NC_007356	A	6	6	312133	312138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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