MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005863	CG	3	6	176	181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005863	GC	3	6	347	352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_005863	CG	3	6	621	626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_005863	TA	3	6	5441	5446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005863	AC	3	6	5913	5918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_005863	GC	3	6	6353	6358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_005863	CA	3	6	20085	20090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_005863	CG	3	6	20149	20154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_005863	GT	3	6	20320	20325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005863	CG	3	6	22063	22068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_005863	CT	3	6	22163	22168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_005863	GC	3	6	32936	32941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_005863	GC	3	6	33149	33154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_005863	GC	3	6	34374	34379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_005863	GT	3	6	35641	35646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005863	GA	3	6	50477	50482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005863	CG	4	8	58308	58315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_005863	CG	3	6	68540	68545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_005863	CG	3	6	68632	68637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_005863	CG	4	8	80817	80824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_005863	CG	3	6	85293	85298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_005863	GC	3	6	90752	90757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_005863	GT	5	10	94053	94062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005863	GC	3	6	109459	109464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_005863	AC	3	6	110943	110948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_005863	GC	3	6	116117	116122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_005863	CG	3	6	116126	116131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_005863	CA	3	6	122126	122131	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_005863	GA	3	6	122478	122483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005863	GC	3	6	123447	123452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_005863	GC	3	6	130445	130450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_005863	CG	3	6	130596	130601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_005863	GC	3	6	132210	132215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_005863	GA	3	6	132229	132234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005863	GC	3	6	132252	132257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_005863	CG	3	6	140025	140030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_005863	GC	3	6	142503	142508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_005863	GC	3	6	142990	142995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_005863	TG	3	6	144769	144774	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005863	AC	3	6	144877	144882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_005863	AC	3	6	145091	145096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_005863	AC	3	6	145265	145270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_005863	GC	3	6	149196	149201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_005863	GC	3	6	149217	149222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_005863	GT	3	6	153540	153545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005863	GA	3	6	153713	153718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005863	GC	3	6	154258	154263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_005863	AC	3	6	157610	157615	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_005863	AG	3	6	159132	159137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005863	GC	3	6	159295	159300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_005863	CG	3	6	162270	162275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_005863	GC	3	6	165302	165307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_005863	CA	3	6	175815	175820	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_005863	CA	3	6	176197	176202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_005863	CG	3	6	177689	177694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_005863	AT	3	6	183897	183902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005863	AG	3	6	186819	186824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005863	TG	3	6	187188	187193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005863	TG	3	6	191877	191882	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005863	CG	3	6	192096	192101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_005863	AC	3	6	202045	202050	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_005863	TG	3	6	202115	202120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.