MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005863	TGCC	2	8	189	196	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005863	GCTG	2	8	384	391	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_005863	CCCG	2	8	567	574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_005863	CAGG	2	8	5185	5192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_005863	AGAT	2	8	5451	5458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005863	AGAA	2	8	5459	5466	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005863	TCTA	2	8	5470	5477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_005863	GGCT	2	8	5856	5863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_005863	CCGG	2	8	6052	6059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_005863	GGGC	2	8	6461	6468	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_005863	GGCA	2	8	8838	8845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_005863	CGTC	2	8	8868	8875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_005863	GGCG	2	8	13666	13673	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_005863	CCGT	2	8	13787	13794	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_005863	CTGT	2	8	13796	13803	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_005863	CCTT	2	8	13851	13858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_005863	GTCT	2	8	13870	13877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_005863	CCCG	2	8	14004	14011	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_005863	CCGT	2	8	14031	14038	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_005863	TCCG	2	8	14253	14260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_005863	TCCG	2	8	14274	14281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_005863	GGGC	2	8	14742	14749	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_005863	GTGC	2	8	20155	20162	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_005863	GCAG	2	8	21867	21874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_005863	CGGG	2	8	21938	21945	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_005863	TCGT	2	8	21979	21986	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_005863	TTTG	2	8	22746	22753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005863	TGAT	2	8	25258	25265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005863	GGGT	2	8	26605	26612	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005863	TGCA	2	8	34218	34225	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_005863	GCAG	2	8	34333	34340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_005863	GCGG	2	8	34572	34579	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_005863	GGCC	2	8	34679	34686	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_005863	AGGC	2	8	36904	36911	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_005863	GGCG	2	8	36919	36926	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_005863	CCGT	2	8	41126	41133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_005863	CGGA	2	8	50414	50421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_005863	GCAC	2	8	50538	50545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_005863	GACA	2	8	64841	64848	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_005863	TCGT	3	12	64973	64984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_005863	CGGA	2	8	74380	74387	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_005863	CCCG	3	12	80167	80178	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_005863	CGCC	2	8	80211	80218	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_005863	GCGT	2	8	80225	80232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_005863	CGCC	2	8	80489	80496	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_005863	GGAG	2	8	85054	85061	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005863	CGGG	2	8	86797	86804	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_005863	AGAT	2	8	86922	86929	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005863	GCAA	2	8	87035	87042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_005863	GTGC	2	8	90337	90344	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_005863	GTCT	2	8	90601	90608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_005863	TGTA	2	8	90717	90724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005863	GCGG	2	8	97778	97785	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_005863	CAGC	2	8	97798	97805	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_005863	TTCA	2	8	105131	105138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_005863	ATTT	2	8	111008	111015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005863	GCCC	2	8	111305	111312	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_005863	GGCG	2	8	121145	121152	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_005863	CCTG	2	8	122304	122311	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_005863	GCAC	2	8	122397	122404	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_005863	GGCA	2	8	122418	122425	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_005863	GCAT	2	8	125803	125810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_005863	CGCA	2	8	128289	128296	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_005863	CTGT	2	8	128478	128485	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_005863	GACA	2	8	130588	130595	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_005863	TGGC	2	8	133489	133496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_005863	GGCG	2	8	140079	140086	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_005863	CTGC	2	8	140301	140308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_005863	TGCC	2	8	142476	142483	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_005863	CGGG	2	8	142959	142966	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_005863	ATCT	2	8	144684	144691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_005863	CGCC	2	8	144731	144738	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_005863	CGCC	2	8	149280	149287	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_005863	CCCG	2	8	153559	153566	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_005863	GCCA	2	8	154236	154243	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_005863	GGAC	2	8	154507	154514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_005863	GGAA	2	8	154549	154556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005863	CGCA	2	8	154673	154680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_005863	CGAG	2	8	154954	154961	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_005863	CGCC	2	8	157373	157380	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_005863	CACG	2	8	164670	164677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_005863	CGCA	2	8	165282	165289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_005863	ACGC	2	8	168177	168184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_005863	AATC	2	8	176081	176088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_005863	CGAC	2	8	176596	176603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_005863	CGGG	2	8	177581	177588	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_005863	GCCT	2	8	184217	184224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_005863	CGCC	2	8	186477	186484	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_005863	GCCC	2	8	187196	187203	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
90	NC_005863	TGGC	2	8	191908	191915	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_005863	ACGG	2	8	192112	192119	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_005863	AGAC	2	8	192271	192278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_005863	CCGA	2	8	192311	192318	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_005863	CGGG	2	8	198445	198452	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_005863	TCCC	2	8	199672	199679	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
96	NC_005863	AGCC	2	8	201867	201874	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_005863	CCCT	2	8	202026	202033	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.