MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough chromosome

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002937	GCGGAA	2	12	9539	9550	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_002937	TCCGTG	2	12	11009	11020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002937	GGGTCG	2	12	33832	33843	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_002937	GCGAAG	2	12	105743	105754	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_002937	CGGTGC	2	12	129527	129538	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_002937	CCGCAA	2	12	168201	168212	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002937	TCAGCC	2	12	226152	226163	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002937	ATGGCA	2	12	227408	227419	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_002937	AAGGCC	2	12	232683	232694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_002937	TTGAAG	2	12	264341	264352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002937	CCTTCT	2	12	267521	267532	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_002937	GCGAAG	2	12	294739	294750	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_002937	CGGGAG	2	12	322320	322331	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_002937	TTCGCC	2	12	328563	328574	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_002937	TCGACG	2	12	345627	345638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_002937	CTTTGT	2	12	353012	353023	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_002937	GCGGGC	2	12	353311	353322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002937	CGCTGG	2	12	362057	362068	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_002937	GCGTGC	2	12	362167	362178	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_002937	CGGTTG	2	12	396086	396097	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_002937	AGCAAC	2	12	409277	409288	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_002937	GTGGCG	2	12	433777	433788	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_002937	GGTTGA	2	12	445846	445857	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002937	CATGCG	2	12	454628	454639	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_002937	GACGAG	2	12	479000	479011	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_002937	CGGGTT	2	12	499440	499451	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_002937	CTTTTT	2	12	532780	532791	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_002937	ATGAAA	2	12	684202	684213	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002937	TTGTCA	3	18	697136	697153	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_002937	CGGCAG	2	12	713650	713661	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_002937	GCCCTC	2	12	731220	731231	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_002937	TGATAT	2	12	745570	745581	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002937	CCTGTC	2	12	771536	771547	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_002937	TGCGGG	2	12	788828	788839	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_002937	CCTCTT	2	12	791392	791403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_002937	CTGCCG	2	12	869725	869736	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_002937	GGAGAG	2	12	878980	878991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002937	CGGTTG	2	12	886113	886124	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_002937	GGAAGA	2	12	906647	906658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002937	AGGATT	2	12	927063	927074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002937	TTTCAC	2	12	935656	935667	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_002937	GCAGGG	2	12	975380	975391	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_002937	ACGCCC	2	12	975469	975480	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_002937	GGCCGT	2	12	1027666	1027677	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_002937	GCCGCT	2	12	1058737	1058748	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_002937	CGGGGT	2	12	1058881	1058892	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_002937	GGGGCG	2	12	1059564	1059575	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_002937	TGCCCC	2	12	1126444	1126455	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_002937	CGTTCT	2	12	1205364	1205375	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_002937	GCCAGC	2	12	1352367	1352378	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_002937	GGGGAG	2	12	1360533	1360544	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002937	GAGCAG	2	12	1478582	1478593	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_002937	TTGGTT	2	12	1501127	1501138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002937	GGCAAG	2	12	1532564	1532575	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_002937	TCGCGT	2	12	1584103	1584114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_002937	GTCGGA	2	12	1648020	1648031	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_002937	GTGGAC	2	12	1693099	1693110	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_002937	AAAAAG	2	12	1755745	1755756	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002937	GGCAGC	2	12	1768907	1768918	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_002937	TACGAT	2	12	1804646	1804657	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_002937	CGCGTG	2	12	1805853	1805864	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_002937	ACGCAG	2	12	1807523	1807534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_002937	CGTTGC	2	12	1810193	1810204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_002937	GCAAAG	2	12	1812049	1812060	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_002937	TGGCAT	2	12	1848684	1848695	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_002937	CCCTTT	2	12	1892238	1892249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_002937	TTCAGG	2	12	1897034	1897045	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_002937	GAACCC	2	12	1897671	1897682	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_002937	GAATCC	2	12	1969605	1969616	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_002937	TGCGGT	2	12	2060277	2060288	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_002937	CAGCAT	2	12	2088405	2088416	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_002937	ATCTAA	2	12	2111070	2111081	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_002937	CAAAAA	2	12	2129110	2129121	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_002937	TGAAGC	2	12	2166266	2166277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_002937	CACCGT	2	12	2179492	2179503	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_002937	CTGAAG	2	12	2207974	2207985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_002937	GGGGCC	2	12	2228853	2228864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_002937	TGCGCC	2	12	2240462	2240473	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_002937	TGGCGA	2	12	2245623	2245634	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_002937	CAGTTG	2	12	2283826	2283837	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_002937	GCTCAT	2	12	2295594	2295605	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_002937	CTCACC	2	12	2369910	2369921	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_002937	CGGCGT	2	12	2430245	2430256	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_002937	GCAGGC	2	12	2459366	2459377	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_002937	CTTTTT	2	12	2475054	2475065	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_002937	GTTGCG	2	12	2509914	2509925	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_002937	ACGCGC	2	12	2515333	2515344	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_002937	GCCTGC	2	12	2524532	2524543	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_002937	CCGGAC	2	12	2544458	2544469	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_002937	CCACGG	2	12	2551518	2551529	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002937	GCTGCG	2	12	2555028	2555039	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_002937	GGAAGG	2	12	2597247	2597258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002937	CTTCGC	2	12	2697901	2697912	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002937	TCGCCA	2	12	2719746	2719757	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_002937	CAAGGA	2	12	2758451	2758462	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_002937	CGCCAT	2	12	2857977	2857988	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_002937	GGACGG	2	12	2858499	2858510	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_002937	GCCTGC	2	12	2876229	2876240	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_002937	TAACCG	2	12	2881656	2881667	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_002937	TCGACA	2	12	2892440	2892451	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_002937	CCTGCG	2	12	2905641	2905652	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_002937	CATCGC	2	12	2912209	2912220	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_002937	CCGACG	2	12	3002639	3002650	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_002937	CCCGCG	2	12	3033193	3033204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_002937	CCCGCG	2	12	3033359	3033370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_002937	TCCCAG	2	12	3056100	3056111	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_002937	CCAGCC	2	12	3056740	3056751	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_002937	CTTTTC	2	12	3061957	3061968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_002937	CAAGGA	2	12	3154339	3154350	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_002937	CAAGCG	2	12	3168164	3168175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_002937	AAAACG	2	12	3224217	3224228	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_002937	CTTCGC	2	12	3252295	3252306	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_002937	TGCCCG	2	12	3300662	3300673	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
114	NC_002937	CGGCAC	2	12	3333593	3333604	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_002937	CAAGGC	2	12	3364883	3364894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_002937	CAGTTC	2	12	3409376	3409387	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_002937	ACGGCT	2	12	3422625	3422636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_002937	GACATC	2	12	3434796	3434807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_002937	TGACGC	2	12	3456422	3456433	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002937	CGTGCC	2	12	3469356	3469367	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_002937	GCCGTG	2	12	3481835	3481846	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_002937	CACACG	2	12	3495258	3495269	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_002937	CGCAAC	2	12	3501244	3501255	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_002937	CACGAA	2	12	3502254	3502265	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_002937	GTTTCC	2	12	3544730	3544741	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.