MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Dehalococcoides ethenogenes 195

Total Repeats: 126

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002936	ATTTC	2	10	5811	5820	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_002936	TATCT	2	10	41924	41933	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_002936	GTGAA	2	10	48494	48503	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002936	TCCCG	2	10	50802	50811	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_002936	ATTTT	2	10	64329	64338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002936	GCAGC	2	10	64618	64627	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_002936	GTAAA	2	10	74536	74545	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002936	GTTTT	2	10	75181	75190	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002936	ACCCT	2	10	79797	79806	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_002936	AATAC	2	10	81459	81468	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_002936	TCCTT	2	10	81482	81491	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_002936	TAACG	2	10	88753	88762	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_002936	TAGCT	2	10	115142	115151	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_002936	ACTTC	2	10	116752	116761	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_002936	AAAAC	2	10	128363	128372	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_002936	CGGGT	2	10	136850	136859	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_002936	GCATC	2	10	155711	155720	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_002936	CGGCC	2	10	155827	155836	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_002936	GTTTC	2	10	155842	155851	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_002936	AGATC	2	10	158188	158197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_002936	CGCTG	2	10	159059	159068	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_002936	TAAAA	2	10	159863	159872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002936	AATTT	2	10	169392	169401	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002936	GGGCA	2	10	178481	178490	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_002936	ATATG	2	10	190979	190988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002936	CCAAG	2	10	209212	209221	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_002936	AACTA	2	10	212354	212363	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_002936	TTGGG	2	10	212721	212730	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002936	CAAAT	2	10	226101	226110	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_002936	GGCAG	2	10	247272	247281	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_002936	ACATA	2	10	264324	264333	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_002936	GGCAG	2	10	269630	269639	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_002936	AATTT	2	10	289778	289787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002936	AAATA	2	10	301883	301892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002936	GTAAA	2	10	327433	327442	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002936	TTTAG	2	10	334323	334332	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002936	CCCGG	2	10	342461	342470	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
38	NC_002936	AGTCA	2	10	366837	366846	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_002936	TTGAC	2	10	413406	413415	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_002936	ATAGC	2	10	442049	442058	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_002936	CCGGG	2	10	521118	521127	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_002936	AGGAA	2	10	535082	535091	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002936	GCAAA	2	10	567934	567943	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_002936	TTTTA	2	10	584824	584833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002936	GAATA	2	10	591168	591177	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002936	GGCAG	2	10	600743	600752	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_002936	GCAGG	2	10	631755	631764	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_002936	TTTAC	2	10	678092	678101	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_002936	CTCCC	2	10	689192	689201	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
50	NC_002936	GCTTT	2	10	690903	690912	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_002936	GATTT	2	10	698460	698469	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002936	TAAAT	2	10	736061	736070	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002936	TTATA	2	10	750194	750203	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002936	TTATA	2	10	779126	779135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002936	AGATT	2	10	787924	787933	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002936	ATGTA	2	10	797099	797108	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002936	CAAAT	2	10	805306	805315	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_002936	GTTTT	2	10	805549	805558	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_002936	GGCAG	2	10	817042	817051	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_002936	TATAA	2	10	844153	844162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002936	ATATC	2	10	844224	844233	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_002936	TCTAC	2	10	857004	857013	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_002936	GGCAT	2	10	875475	875484	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_002936	AATTT	2	10	877549	877558	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002936	ACTTT	2	10	878236	878245	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_002936	CCTGT	2	10	886144	886153	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_002936	TTTCA	2	10	927838	927847	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_002936	AATAT	2	10	928171	928180	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002936	TGACG	2	10	928533	928542	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_002936	GGGAC	2	10	945180	945189	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_002936	GAGTT	2	10	968411	968420	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002936	AATTA	2	10	1030216	1030225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002936	TATTT	2	10	1040909	1040918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002936	ACGGT	2	10	1048721	1048730	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_002936	ATCTT	2	10	1064410	1064419	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_002936	TCAAA	2	10	1070341	1070350	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_002936	CAAAC	2	10	1075188	1075197	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_002936	AACTA	2	10	1075240	1075249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_002936	TTTAT	2	10	1081063	1081072	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002936	ATCCT	2	10	1081198	1081207	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_002936	TACCT	2	10	1081440	1081449	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_002936	AACGC	2	10	1106059	1106068	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_002936	CTGAA	2	10	1127938	1127947	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_002936	CCTTA	2	10	1131876	1131885	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_002936	AAACC	2	10	1131981	1131990	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_002936	GGTAA	2	10	1132567	1132576	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002936	GAAAA	2	10	1132668	1132677	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002936	GCACC	2	10	1136439	1136448	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_002936	TGCCC	2	10	1140902	1140911	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_002936	TATAA	2	10	1160445	1160454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002936	GAAAA	2	10	1179850	1179859	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002936	TTGCC	2	10	1186198	1186207	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_002936	AGAAT	2	10	1188378	1188387	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002936	ACGGC	2	10	1188609	1188618	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_002936	ATTAT	2	10	1190537	1190546	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002936	TAAAT	2	10	1190575	1190584	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002936	ACTAT	2	10	1197608	1197617	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_002936	AGACT	2	10	1201405	1201414	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_002936	TTGCT	2	10	1203122	1203131	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_002936	ACTAC	2	10	1254816	1254825	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_002936	CAAGG	2	10	1260554	1260563	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_002936	TTTAT	2	10	1265923	1265932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002936	CAGGG	2	10	1276542	1276551	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
104	NC_002936	TTATT	2	10	1297895	1297904	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002936	AATCT	2	10	1308532	1308541	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_002936	CATGA	2	10	1325716	1325725	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_002936	GCTAT	2	10	1326787	1326796	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_002936	GCAGG	2	10	1335546	1335555	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_002936	TAGGG	2	10	1338401	1338410	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002936	ACAAG	2	10	1356641	1356650	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_002936	TGGCT	2	10	1362152	1362161	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_002936	AACTC	2	10	1363732	1363741	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_002936	AGGGC	2	10	1371007	1371016	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_002936	TATTC	2	10	1386321	1386330	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_002936	TTTCC	2	10	1388168	1388177	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_002936	AAAGT	2	10	1388307	1388316	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002936	TATTT	2	10	1391816	1391825	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002936	AGGCA	2	10	1395148	1395157	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_002936	GCAGG	2	10	1411863	1411872	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_002936	CTTTT	2	10	1423705	1423714	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_002936	AATAC	2	10	1423744	1423753	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_002936	CTATA	2	10	1428556	1428565	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_002936	ATAAA	2	10	1431148	1431157	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002936	TATTT	2	10	1432323	1432332	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002936	AGAGG	2	10	1435032	1435041	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002936	GGGGC	2	10	1466259	1466268	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.