MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 chromosome 2

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001264	CAGG	2	8	325	332	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_001264	CAGG	2	8	467	474	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_001264	CCCA	2	8	4681	4688	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_001264	GCCT	2	8	8696	8703	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_001264	TGGT	2	8	8743	8750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001264	TGGT	2	8	8752	8759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001264	CTTT	2	8	16473	16480	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_001264	CAGA	2	8	22652	22659	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_001264	TCTG	2	8	26301	26308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_001264	TGAG	2	8	26317	26324	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001264	GCCC	2	8	27613	27620	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_001264	CATG	2	8	34742	34749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_001264	AGGC	2	8	34759	34766	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_001264	AATT	2	8	40342	40349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001264	TCTA	2	8	63660	63667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_001264	TTAG	2	8	64432	64439	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001264	CGGG	2	8	65511	65518	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_001264	GTTT	2	8	65551	65558	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001264	TCTT	2	8	65559	65566	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_001264	CTCC	2	8	71472	71479	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_001264	GCTG	2	8	79185	79192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_001264	CGAA	2	8	79333	79340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_001264	AGGG	2	8	80530	80537	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001264	GACC	2	8	86657	86664	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_001264	GCTC	2	8	88185	88192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_001264	CCCG	2	8	88633	88640	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_001264	GCGG	2	8	94450	94457	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_001264	CGCC	2	8	94741	94748	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_001264	CAGC	2	8	95113	95120	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_001264	CGCC	2	8	95207	95214	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_001264	GACT	2	8	113386	113393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_001264	ACGC	2	8	134865	134872	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_001264	GGGC	2	8	146697	146704	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_001264	GCCC	2	8	146723	146730	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_001264	GGCG	2	8	155061	155068	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_001264	GCTG	2	8	164361	164368	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_001264	TCCC	2	8	170493	170500	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_001264	CGCC	2	8	173034	173041	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_001264	TGCC	2	8	178195	178202	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_001264	TCAG	2	8	178208	178215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_001264	CTCC	2	8	178289	178296	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
42	NC_001264	GCCA	2	8	186296	186303	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_001264	TTCG	2	8	193850	193857	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_001264	GAGC	2	8	193955	193962	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_001264	GTTT	2	8	194272	194279	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001264	TTTA	2	8	201525	201532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_001264	TGCG	2	8	207755	207762	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_001264	GGCT	2	8	213753	213760	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_001264	GCCC	2	8	215649	215656	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_001264	GAGG	2	8	219596	219603	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001264	AGCG	2	8	219913	219920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_001264	TCCC	2	8	223506	223513	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_001264	CGAC	2	8	229073	229080	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_001264	TCGC	2	8	229177	229184	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_001264	GGAG	3	12	229343	229354	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_001264	GAGG	2	8	234748	234755	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_001264	GAAA	2	8	243839	243846	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_001264	CAAA	2	8	254032	254039	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_001264	TGAC	2	8	262650	262657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_001264	GTCA	2	8	262682	262689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_001264	CAAA	2	8	262693	262700	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_001264	GTCT	2	8	270174	270181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_001264	AACG	2	8	271710	271717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_001264	TGGT	2	8	271720	271727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001264	GCCA	2	8	271758	271765	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_001264	GGCA	2	8	275845	275852	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_001264	GGGA	2	8	279525	279532	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001264	CTTT	3	12	282836	282847	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_001264	CGGT	2	8	290676	290683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_001264	ATTT	2	8	290700	290707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001264	GTCT	2	8	292146	292153	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_001264	TTTC	2	8	301317	301324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_001264	CGGT	2	8	301364	301371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_001264	GCGT	2	8	307630	307637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_001264	TGCT	2	8	315201	315208	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_001264	GCCC	2	8	316102	316109	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_001264	CGCC	2	8	316682	316689	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
78	NC_001264	TTCA	2	8	323564	323571	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_001264	GCGA	2	8	349596	349603	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_001264	GTCC	2	8	358627	358634	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_001264	GTCC	2	8	361843	361850	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_001264	GCTC	2	8	377537	377544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_001264	TCCT	2	8	381039	381046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_001264	GAGG	2	8	384954	384961	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001264	CGCC	2	8	395305	395312	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_001264	CGGG	2	8	395445	395452	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_001264	CGCA	2	8	401372	401379	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_001264	CCGA	2	8	404069	404076	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_001264	CTCA	2	8	404149	404156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_001264	CAGG	3	12	410777	410788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_001264	ACTG	2	8	410840	410847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_001264	GAGC	2	8	410979	410986	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_001264	GCAG	2	8	411006	411013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_001264	GAGC	2	8	412289	412296	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.