MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 chromosome 1

Total Repeats: 429

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001263	AG	3	6	10299	10304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001263	GA	3	6	12932	12937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001263	TC	3	6	25236	25241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_001263	TG	3	6	41831	41836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_001263	AG	3	6	57023	57028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001263	GC	3	6	65579	65584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_001263	AG	3	6	82501	82506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001263	AG	3	6	83051	83056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_001263	AT	3	6	84361	84366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_001263	TG	3	6	84715	84720	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_001263	AC	3	6	86023	86028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_001263	AC	3	6	86192	86197	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_001263	GC	3	6	90169	90174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_001263	GA	4	8	95503	95510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001263	TC	3	6	106597	106602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_001263	AG	3	6	110843	110848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_001263	AG	3	6	110858	110863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001263	CG	3	6	113063	113068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_001263	GA	3	6	113139	113144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_001263	AG	3	6	118203	118208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_001263	TG	3	6	124544	124549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_001263	AG	3	6	125362	125367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_001263	GC	3	6	132220	132225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_001263	AG	3	6	138945	138950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_001263	CG	3	6	146075	146080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_001263	CT	4	8	150645	150652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_001263	AG	3	6	159061	159066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_001263	GC	4	8	162801	162808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_001263	TG	3	6	166185	166190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001263	GC	3	6	191030	191035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_001263	AG	3	6	194110	194115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001263	AG	3	6	202839	202844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001263	CG	3	6	209209	209214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_001263	GC	3	6	214820	214825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_001263	AG	3	6	215662	215667	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_001263	CT	3	6	215674	215679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_001263	CA	3	6	230978	230983	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_001263	CT	3	6	234827	234832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_001263	GC	3	6	236746	236751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_001263	GC	3	6	248314	248319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_001263	AG	3	6	250148	250153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001263	CG	3	6	250753	250758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_001263	GC	3	6	251994	251999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_001263	GA	3	6	252000	252005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_001263	CG	3	6	253701	253706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_001263	GC	3	6	253734	253739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_001263	CT	3	6	256592	256597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_001263	CT	3	6	256612	256617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_001263	GA	3	6	263522	263527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_001263	GC	3	6	264827	264832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_001263	AG	3	6	267560	267565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_001263	TG	3	6	268592	268597	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_001263	GC	4	8	268832	268839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_001263	GA	3	6	273745	273750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_001263	CT	3	6	273847	273852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_001263	CT	3	6	275064	275069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_001263	GC	3	6	282023	282028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_001263	CT	3	6	285748	285753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_001263	CT	3	6	294634	294639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_001263	TC	3	6	299645	299650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_001263	GT	3	6	302458	302463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_001263	AG	3	6	310999	311004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001263	CT	3	6	323317	323322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_001263	GC	3	6	330843	330848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_001263	CG	3	6	334330	334335	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_001263	CT	3	6	337818	337823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_001263	GA	3	6	339333	339338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_001263	GC	3	6	345271	345276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_001263	AT	3	6	346264	346269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_001263	AG	3	6	355625	355630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_001263	CT	3	6	355826	355831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_001263	CT	3	6	357175	357180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_001263	AG	3	6	359848	359853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_001263	CG	3	6	360451	360456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_001263	GC	3	6	362635	362640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_001263	TG	3	6	362731	362736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_001263	GA	3	6	362740	362745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_001263	AG	3	6	398989	398994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_001263	CG	4	8	410323	410330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_001263	CG	3	6	415409	415414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_001263	AG	3	6	417619	417624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001263	GC	3	6	428287	428292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_001263	CA	3	6	428384	428389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_001263	CG	3	6	430630	430635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_001263	CG	3	6	432419	432424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_001263	CT	3	6	445578	445583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_001263	CT	3	6	445625	445630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_001263	AG	4	8	454649	454656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001263	CT	3	6	454682	454687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_001263	AG	3	6	458703	458708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_001263	TC	3	6	463932	463937	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_001263	CT	3	6	463940	463945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_001263	GA	3	6	464700	464705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_001263	AC	3	6	464847	464852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_001263	TC	3	6	489147	489152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_001263	TC	3	6	498408	498413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_001263	CG	3	6	508947	508952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_001263	CT	4	8	526771	526778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_001263	CT	3	6	526806	526811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_001263	CT	3	6	526819	526824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_001263	CT	3	6	526884	526889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_001263	GT	3	6	526908	526913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_001263	CT	3	6	526920	526925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_001263	AC	3	6	528631	528636	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_001263	GC	3	6	540762	540767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_001263	GC	3	6	549337	549342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_001263	GA	4	8	551567	551574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_001263	GA	3	6	560622	560627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_001263	CG	3	6	567740	567745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_001263	TG	3	6	567806	567811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_001263	TC	3	6	571922	571927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_001263	CG	3	6	576727	576732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_001263	GT	3	6	580154	580159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_001263	CT	3	6	585591	585596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_001263	GA	3	6	611801	611806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_001263	CA	3	6	612234	612239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_001263	AT	3	6	617649	617654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_001263	TG	3	6	624812	624817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_001263	CT	3	6	624833	624838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_001263	CG	3	6	636831	636836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_001263	AG	3	6	648529	648534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_001263	CT	3	6	648583	648588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_001263	CT	3	6	648591	648596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_001263	CG	3	6	665798	665803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_001263	GA	3	6	669442	669447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_001263	TC	3	6	670680	670685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_001263	CT	3	6	676689	676694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_001263	TG	3	6	683789	683794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_001263	GT	3	6	709871	709876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_001263	TG	3	6	744276	744281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_001263	TC	3	6	744762	744767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_001263	CG	3	6	751759	751764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_001263	AC	3	6	763091	763096	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_001263	AG	3	6	765362	765367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_001263	CT	3	6	798888	798893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_001263	AG	3	6	804047	804052	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_001263	AG	3	6	804120	804125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_001263	CT	3	6	809039	809044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_001263	GA	3	6	817508	817513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_001263	GC	3	6	818884	818889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_001263	TC	4	8	826407	826414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_001263	AG	3	6	828392	828397	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_001263	GC	3	6	839684	839689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_001263	CT	3	6	840017	840022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_001263	CT	3	6	845138	845143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_001263	GC	3	6	895469	895474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_001263	CG	3	6	895544	895549	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_001263	TG	3	6	897044	897049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_001263	AG	3	6	900971	900976	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_001263	CA	3	6	904747	904752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_001263	TG	3	6	914317	914322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_001263	GA	3	6	936747	936752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_001263	AG	3	6	940362	940367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.