MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Deinococcus radiodurans R1 plasmid MP1

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000958	GT	3	6	2564	2569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000958	CT	3	6	2712	2717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_000958	GT	4	8	7498	7505	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_000958	AT	3	6	15169	15174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_000958	CT	3	6	15454	15459	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_000958	TC	3	6	19246	19251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_000958	CG	3	6	19468	19473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_000958	GC	3	6	19924	19929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_000958	AG	4	8	31028	31035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000958	GA	3	6	33405	33410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_000958	GC	3	6	38463	38468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_000958	AG	3	6	39084	39089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000958	CT	3	6	39163	39168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_000958	GC	3	6	39188	39193	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_000958	GA	3	6	39581	39586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000958	GC	3	6	42123	42128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_000958	GC	3	6	62117	62122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_000958	CT	3	6	64437	64442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_000958	TG	3	6	64583	64588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_000958	TC	3	6	66395	66400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_000958	CG	3	6	66617	66622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_000958	GC	3	6	67073	67078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_000958	GA	3	6	77160	77165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_000958	CT	3	6	82576	82581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_000958	CA	3	6	82606	82611	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_000958	GA	3	6	91125	91130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_000958	GC	3	6	92114	92119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_000958	CG	3	6	92739	92744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_000958	CG	3	6	92830	92835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_000958	CG	3	6	93017	93022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_000958	CG	3	6	93203	93208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_000958	GC	3	6	96511	96516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_000958	CG	3	6	100513	100518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_000958	GC	3	6	100631	100636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_000958	GC	3	6	100980	100985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_000958	CG	3	6	101472	101477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_000958	AG	3	6	104246	104251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_000958	TC	3	6	113092	113097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_000958	CG	4	8	120976	120983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_000958	CT	3	6	133950	133955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_000958	TG	3	6	134096	134101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000958	AG	3	6	136490	136495	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000958	GT	3	6	142015	142020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000958	TC	3	6	142046	142051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_000958	CG	3	6	153697	153702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_000958	GA	3	6	153919	153924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_000958	CT	3	6	157152	157157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_000958	GC	3	6	168882	168887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_000958	CG	3	6	168915	168920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_000958	AG	3	6	175949	175954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000958	AC	3	6	176030	176035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.