MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 62686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022579	CTT	2	6	240575	240580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593844
4002	NC_022579	TGC	2	6	240598	240603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593844
4003	NC_022579	GAA	2	6	240647	240652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593844
4004	NC_022579	CTAA	2	8	240662	240669	50 %	25 %	0 %	25 %	551593844
4005	NC_022579	TTC	2	6	240786	240791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593844
4006	NC_022579	GTTGG	2	10	240820	240829	0 %	40 %	60 %	0 %	551593844
4007	NC_022579	G	6	6	240922	240927	0 %	0 %	100 %	0 %	551593844
4008	NC_022579	GCC	2	6	240962	240967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593844
4009	NC_022579	TTG	2	6	240993	240998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593844
4010	NC_022579	GAA	2	6	241069	241074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593844
4011	NC_022579	T	6	6	241117	241122	0 %	100 %	0 %	0 %	551593844
4012	NC_022579	GAT	2	6	241133	241138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593844
4013	NC_022579	GAGGAA	2	12	241139	241150	50 %	0 %	50 %	0 %	551593844
4014	NC_022579	A	7	7	241170	241176	100 %	0 %	0 %	0 %	551593844
4015	NC_022579	A	6	6	241184	241189	100 %	0 %	0 %	0 %	551593844
4016	NC_022579	GTT	2	6	241196	241201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593844
4017	NC_022579	TGA	2	6	241213	241218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593844
4018	NC_022579	TGC	2	6	241285	241290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593844
4019	NC_022579	GAC	2	6	241331	241336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593844
4020	NC_022579	ATA	2	6	241359	241364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593844
4021	NC_022579	T	7	7	241411	241417	0 %	100 %	0 %	0 %	551593844
4022	NC_022579	GAA	2	6	241421	241426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593844
4023	NC_022579	CAA	2	6	241471	241476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593844
4024	NC_022579	CAG	2	6	241499	241504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593844
4025	NC_022579	GCT	2	6	241541	241546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593844
4026	NC_022579	TCC	2	6	241548	241553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593844
4027	NC_022579	AAC	2	6	241562	241567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593844
4028	NC_022579	ATG	2	6	241599	241604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593845
4029	NC_022579	GTT	2	6	241758	241763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593845
4030	NC_022579	AAC	2	6	241933	241938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593845
4031	NC_022579	CTG	2	6	241995	242000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593846
4032	NC_022579	CCT	2	6	242446	242451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593847
4033	NC_022579	TGC	2	6	242475	242480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593847
4034	NC_022579	A	6	6	242528	242533	100 %	0 %	0 %	0 %	551593847
4035	NC_022579	GAA	2	6	242635	242640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593847
4036	NC_022579	T	6	6	242652	242657	0 %	100 %	0 %	0 %	551593847
4037	NC_022579	ATG	2	6	242678	242683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593847
4038	NC_022579	GTAG	2	8	242887	242894	25 %	25 %	50 %	0 %	551593847
4039	NC_022579	ACTCC	2	10	242927	242936	20 %	20 %	0 %	60 %	551593847
4040	NC_022579	GCA	2	6	242953	242958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593847
4041	NC_022579	TAC	2	6	243006	243011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593847
4042	NC_022579	GGT	2	6	243084	243089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593847
4043	NC_022579	GTT	2	6	243097	243102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593847
4044	NC_022579	A	6	6	243204	243209	100 %	0 %	0 %	0 %	551593848
4045	NC_022579	A	7	7	243239	243245	100 %	0 %	0 %	0 %	551593848
4046	NC_022579	A	6	6	243280	243285	100 %	0 %	0 %	0 %	551593848
4047	NC_022579	CTT	2	6	243820	243825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593849
4048	NC_022579	AT	3	6	243986	243991	50 %	50 %	0 %	0 %	551593849
4049	NC_022579	T	7	7	244389	244395	0 %	100 %	0 %	0 %	551593850
4050	NC_022579	GAA	2	6	244472	244477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593850
4051	NC_022579	A	6	6	244491	244496	100 %	0 %	0 %	0 %	551593850
4052	NC_022579	GTT	2	6	244518	244523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593850
4053	NC_022579	T	6	6	244522	244527	0 %	100 %	0 %	0 %	551593850
4054	NC_022579	T	7	7	244647	244653	0 %	100 %	0 %	0 %	551593850
4055	NC_022579	TAT	2	6	244675	244680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593851
4056	NC_022579	AT	3	6	244742	244747	50 %	50 %	0 %	0 %	551593851
4057	NC_022579	AGA	2	6	244767	244772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593851
4058	NC_022579	CTG	2	6	244801	244806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593851
4059	NC_022579	GAT	2	6	244827	244832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593851
4060	NC_022579	TTG	2	6	244834	244839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593851
4061	NC_022579	ACTG	2	8	244847	244854	25 %	25 %	25 %	25 %	551593851
4062	NC_022579	TCTTTA	2	12	245114	245125	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	551593852
4063	NC_022579	CAT	2	6	245169	245174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593852
4064	NC_022579	TAA	2	6	245277	245282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593852
4065	NC_022579	ACA	2	6	245350	245355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593852
4066	NC_022579	CATT	2	8	245357	245364	25 %	50 %	0 %	25 %	551593852
4067	NC_022579	A	8	8	245398	245405	100 %	0 %	0 %	0 %	551593852
4068	NC_022579	TTGC	2	8	245440	245447	0 %	50 %	25 %	25 %	551593852
4069	NC_022579	AGG	2	6	245452	245457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593852
4070	NC_022579	A	7	7	245538	245544	100 %	0 %	0 %	0 %	551593852
4071	NC_022579	CAA	2	6	245616	245621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593852
4072	NC_022579	CAT	2	6	245640	245645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593852
4073	NC_022579	AGT	2	6	245754	245759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593852
4074	NC_022579	CAAC	2	8	245822	245829	50 %	0 %	0 %	50 %	551593852
4075	NC_022579	ATAAA	2	10	245861	245870	80 %	20 %	0 %	0 %	551593852
4076	NC_022579	GC	3	6	245894	245899	0 %	0 %	50 %	50 %	551593852
4077	NC_022579	GA	3	6	245902	245907	50 %	0 %	50 %	0 %	551593852
4078	NC_022579	TAA	2	6	245952	245957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593852
4079	NC_022579	TTC	2	6	246042	246047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593853
4080	NC_022579	TAT	2	6	246155	246160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593853
4081	NC_022579	AAT	2	6	246205	246210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593853
4082	NC_022579	T	7	7	246212	246218	0 %	100 %	0 %	0 %	551593853
4083	NC_022579	AGC	2	6	246261	246266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593853
4084	NC_022579	TACA	2	8	246339	246346	50 %	25 %	0 %	25 %	551593853
4085	NC_022579	AAG	2	6	246429	246434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593853
4086	NC_022579	TTC	2	6	246456	246461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593853
4087	NC_022579	AGT	2	6	246471	246476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593853
4088	NC_022579	TTAT	2	8	246484	246491	25 %	75 %	0 %	0 %	551593853
4089	NC_022579	AGT	2	6	246547	246552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593854
4090	NC_022579	A	7	7	246703	246709	100 %	0 %	0 %	0 %	551593854
4091	NC_022579	A	8	8	246766	246773	100 %	0 %	0 %	0 %	551593854
4092	NC_022579	TCA	2	6	246873	246878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593854
4093	NC_022579	AGG	2	6	246943	246948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593854
4094	NC_022579	TTA	2	6	246953	246958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593854
4095	NC_022579	AG	3	6	247002	247007	50 %	0 %	50 %	0 %	551593854
4096	NC_022579	TTA	2	6	247017	247022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593854
4097	NC_022579	AGG	2	6	247072	247077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593854
4098	NC_022579	TAA	2	6	247086	247091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593854
4099	NC_022579	ATG	2	6	247138	247143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593854
4100	NC_022579	A	7	7	247151	247157	100 %	0 %	0 %	0 %	551593854
4101	NC_022579	TTA	2	6	247169	247174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593854
4102	NC_022579	ACT	2	6	247323	247328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593855
4103	NC_022579	A	6	6	247331	247336	100 %	0 %	0 %	0 %	551593855
4104	NC_022579	AAC	2	6	247366	247371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593855
4105	NC_022579	CAA	2	6	247410	247415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593855
4106	NC_022579	TTAA	2	8	247451	247458	50 %	50 %	0 %	0 %	551593855
4107	NC_022579	ACAGT	2	10	247472	247481	40 %	20 %	20 %	20 %	551593855
4108	NC_022579	GCG	2	6	247630	247635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593856
4109	NC_022579	ATC	2	6	247638	247643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593856
4110	NC_022579	CCGGG	2	10	247680	247689	0 %	0 %	60 %	40 %	551593856
4111	NC_022579	GGT	2	6	247742	247747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593856
4112	NC_022579	GGT	2	6	247854	247859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593856
4113	NC_022579	GAAAAA	2	12	247934	247945	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	551593856
4114	NC_022579	TGAT	2	8	247963	247970	25 %	50 %	25 %	0 %	551593856
4115	NC_022579	GGAT	2	8	248012	248019	25 %	25 %	50 %	0 %	551593856
4116	NC_022579	GAA	2	6	248028	248033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593856
4117	NC_022579	CTT	2	6	248067	248072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593856
4118	NC_022579	AAT	2	6	248087	248092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593856
4119	NC_022579	TCT	2	6	248126	248131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593856
4120	NC_022579	CACT	2	8	248197	248204	25 %	25 %	0 %	50 %	551593856
4121	NC_022579	GAG	2	6	248283	248288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593856
4122	NC_022579	AAT	2	6	248336	248341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593856
4123	NC_022579	TGCCG	2	10	248396	248405	0 %	20 %	40 %	40 %	551593856
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4487	NC_022579	AT	3	6	271563	271568	50 %	50 %	0 %	0 %	551593881
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4489	NC_022579	GA	3	6	271660	271665	50 %	0 %	50 %	0 %	551593881
4490	NC_022579	ATT	2	6	271666	271671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593882
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4493	NC_022579	CCAC	2	8	271735	271742	25 %	0 %	0 %	75 %	551593882
4494	NC_022579	AAT	2	6	271839	271844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593882
4495	NC_022579	AGC	2	6	271908	271913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593882
4496	NC_022579	AAC	2	6	271937	271942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593882
4497	NC_022579	TAA	2	6	271988	271993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593882
4498	NC_022579	AT	3	6	272036	272041	50 %	50 %	0 %	0 %	551593882
4499	NC_022579	AAT	2	6	272081	272086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593882
4500	NC_022579	TGC	2	6	272189	272194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593882

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