MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 62686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022579	AGC	2	6	210667	210672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593801
3502	NC_022579	TCTTGA	2	12	210733	210744	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	551593801
3503	NC_022579	AGC	2	6	210745	210750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593801
3504	NC_022579	GTT	2	6	210761	210766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593801
3505	NC_022579	ACA	2	6	210774	210779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593801
3506	NC_022579	CTG	2	6	211053	211058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593802
3507	NC_022579	CGG	2	6	211078	211083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593802
3508	NC_022579	CTC	2	6	211113	211118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593802
3509	NC_022579	TTTG	2	8	211169	211176	0 %	75 %	25 %	0 %	551593802
3510	NC_022579	GATCA	2	10	211293	211302	40 %	20 %	20 %	20 %	551593802
3511	NC_022579	A	6	6	211331	211336	100 %	0 %	0 %	0 %	551593802
3512	NC_022579	TCA	2	6	211339	211344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593802
3513	NC_022579	CAGG	2	8	211355	211362	25 %	0 %	50 %	25 %	551593802
3514	NC_022579	TGA	2	6	211388	211393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593802
3515	NC_022579	TG	3	6	211395	211400	0 %	50 %	50 %	0 %	551593802
3516	NC_022579	CTT	2	6	211411	211416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593802
3517	NC_022579	GCTGGT	2	12	211439	211450	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	551593802
3518	NC_022579	T	8	8	211450	211457	0 %	100 %	0 %	0 %	551593802
3519	NC_022579	CGG	2	6	211478	211483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593802
3520	NC_022579	CGC	2	6	211567	211572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593802
3521	NC_022579	TTG	2	6	211575	211580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593802
3522	NC_022579	TTTA	2	8	211590	211597	25 %	75 %	0 %	0 %	551593802
3523	NC_022579	TGCC	2	8	211606	211613	0 %	25 %	25 %	50 %	551593802
3524	NC_022579	CGCT	2	8	211633	211640	0 %	25 %	25 %	50 %	551593802
3525	NC_022579	GCT	3	9	211638	211646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593802
3526	NC_022579	AGA	2	6	211715	211720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593802
3527	NC_022579	TCA	2	6	211840	211845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593802
3528	NC_022579	CCA	2	6	211864	211869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593802
3529	NC_022579	GC	3	6	211889	211894	0 %	0 %	50 %	50 %	551593802
3530	NC_022579	CAGAT	2	10	211897	211906	40 %	20 %	20 %	20 %	551593802
3531	NC_022579	GCT	2	6	211944	211949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593802
3532	NC_022579	ATCT	2	8	211953	211960	25 %	50 %	0 %	25 %	551593802
3533	NC_022579	CTTT	2	8	211981	211988	0 %	75 %	0 %	25 %	551593802
3534	NC_022579	GTC	2	6	212061	212066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593803
3535	NC_022579	AAG	2	6	212067	212072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593803
3536	NC_022579	GTG	2	6	212119	212124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593803
3537	NC_022579	CTT	2	6	212214	212219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593803
3538	NC_022579	AGA	2	6	212278	212283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593803
3539	NC_022579	CAG	2	6	212322	212327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593803
3540	NC_022579	AGA	2	6	212425	212430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593803
3541	NC_022579	AGC	2	6	212497	212502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593803
3542	NC_022579	GAT	2	6	212540	212545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593803
3543	NC_022579	GAC	2	6	212622	212627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593803
3544	NC_022579	T	6	6	212739	212744	0 %	100 %	0 %	0 %	551593803
3545	NC_022579	ATA	2	6	212921	212926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593804
3546	NC_022579	TTA	2	6	212973	212978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593804
3547	NC_022579	GCTT	2	8	213025	213032	0 %	50 %	25 %	25 %	551593804
3548	NC_022579	GTA	2	6	213108	213113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593804
3549	NC_022579	GGT	2	6	213157	213162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593804
3550	NC_022579	ATTAT	2	10	213195	213204	40 %	60 %	0 %	0 %	551593804
3551	NC_022579	TGC	2	6	213238	213243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593804
3552	NC_022579	T	6	6	213245	213250	0 %	100 %	0 %	0 %	551593804
3553	NC_022579	GCT	2	6	213272	213277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593804
3554	NC_022579	CGG	2	6	213279	213284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593804
3555	NC_022579	CTG	2	6	213308	213313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593804
3556	NC_022579	T	6	6	213399	213404	0 %	100 %	0 %	0 %	551593804
3557	NC_022579	CTGA	2	8	213458	213465	25 %	25 %	25 %	25 %	551593804
3558	NC_022579	ATT	2	6	213474	213479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593804
3559	NC_022579	GTA	2	6	213504	213509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593804
3560	NC_022579	TGA	2	6	213529	213534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593804
3561	NC_022579	GCG	2	6	213562	213567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593804
3562	NC_022579	TGT	2	6	213673	213678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593804
3563	NC_022579	GTC	2	6	213693	213698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593804
3564	NC_022579	T	6	6	213720	213725	0 %	100 %	0 %	0 %	551593804
3565	NC_022579	TGT	2	6	213769	213774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593804
3566	NC_022579	AG	3	6	213860	213865	50 %	0 %	50 %	0 %	551593804
3567	NC_022579	TGA	2	6	213907	213912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593804
3568	NC_022579	CTG	2	6	213985	213990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593804
3569	NC_022579	A	6	6	214035	214040	100 %	0 %	0 %	0 %	551593805
3570	NC_022579	ATTTC	2	10	214059	214068	20 %	60 %	0 %	20 %	551593805
3571	NC_022579	AGC	2	6	214112	214117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593805
3572	NC_022579	TCA	2	6	214168	214173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593805
3573	NC_022579	TCGG	2	8	214182	214189	0 %	25 %	50 %	25 %	551593805
3574	NC_022579	CAT	2	6	214240	214245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593805
3575	NC_022579	T	7	7	214310	214316	0 %	100 %	0 %	0 %	551593805
3576	NC_022579	CTGTAG	2	12	214369	214380	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	551593805
3577	NC_022579	CTG	2	6	214386	214391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593805
3578	NC_022579	AAG	2	6	214518	214523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593805
3579	NC_022579	ATG	2	6	214560	214565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593805
3580	NC_022579	AG	3	6	214653	214658	50 %	0 %	50 %	0 %	551593805
3581	NC_022579	T	6	6	214659	214664	0 %	100 %	0 %	0 %	551593805
3582	NC_022579	GGC	3	9	214670	214678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593805
3583	NC_022579	CAT	2	6	214772	214777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593805
3584	NC_022579	GCG	2	6	214991	214996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593805
3585	NC_022579	CGGG	2	8	215084	215091	0 %	0 %	75 %	25 %	551593805
3586	NC_022579	GTG	2	6	215228	215233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593806
3587	NC_022579	CTG	2	6	215385	215390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593806
3588	NC_022579	TTGC	2	8	215489	215496	0 %	50 %	25 %	25 %	551593806
3589	NC_022579	AT	3	6	215539	215544	50 %	50 %	0 %	0 %	551593806
3590	NC_022579	GAT	2	6	215588	215593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593806
3591	NC_022579	GCTG	2	8	215707	215714	0 %	25 %	50 %	25 %	551593806
3592	NC_022579	AGC	2	6	215771	215776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593806
3593	NC_022579	CTGT	2	8	215893	215900	0 %	50 %	25 %	25 %	551593806
3594	NC_022579	ATT	2	6	215918	215923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593806
3595	NC_022579	CTG	2	6	216014	216019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593806
3596	NC_022579	GCT	2	6	216059	216064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593806
3597	NC_022579	TGC	2	6	216076	216081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593806
3598	NC_022579	GAT	2	6	216163	216168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593806
3599	NC_022579	GCT	2	6	216196	216201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593806
3600	NC_022579	GCA	2	6	216262	216267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593806
3601	NC_022579	ATG	2	6	216269	216274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593806
3602	NC_022579	TGG	2	6	216288	216293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593806
3603	NC_022579	AGT	2	6	216294	216299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593806
3604	NC_022579	T	6	6	216416	216421	0 %	100 %	0 %	0 %	551593807
3605	NC_022579	A	7	7	216428	216434	100 %	0 %	0 %	0 %	551593807
3606	NC_022579	GCA	2	6	216453	216458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593807
3607	NC_022579	ACG	2	6	216459	216464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593807
3608	NC_022579	ATA	2	6	216489	216494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593807
3609	NC_022579	TTA	2	6	216495	216500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593807
3610	NC_022579	ATG	2	6	216528	216533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593807
3611	NC_022579	TTA	2	6	216597	216602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593807
3612	NC_022579	ATT	2	6	216638	216643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593807
3613	NC_022579	TAAGA	2	10	216764	216773	60 %	20 %	20 %	0 %	551593807
3614	NC_022579	GAT	2	6	216782	216787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593807
3615	NC_022579	ATA	2	6	216795	216800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593807
3616	NC_022579	TTA	2	6	216803	216808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593808
3617	NC_022579	T	6	6	216812	216817	0 %	100 %	0 %	0 %	551593808
3618	NC_022579	AAT	2	6	217042	217047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593808
3619	NC_022579	ATA	2	6	217131	217136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593808
3620	NC_022579	CAGC	2	8	217220	217227	25 %	0 %	25 %	50 %	551593808
3621	NC_022579	ATA	2	6	217228	217233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593808
3622	NC_022579	AAAG	2	8	217270	217277	75 %	0 %	25 %	0 %	551593808
3623	NC_022579	TGAA	2	8	217291	217298	50 %	25 %	25 %	0 %	551593808
3624	NC_022579	TTA	2	6	217333	217338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593808
3625	NC_022579	TAAT	2	8	217369	217376	50 %	50 %	0 %	0 %	551593808
3626	NC_022579	AAT	2	6	217400	217405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593808
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3629	NC_022579	GCT	2	6	217608	217613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593808
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3633	NC_022579	AAAT	2	8	217966	217973	75 %	25 %	0 %	0 %	551593808
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3637	NC_022579	T	7	7	218024	218030	0 %	100 %	0 %	0 %	551593808
3638	NC_022579	ATA	3	9	218065	218073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593808
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3641	NC_022579	GAAG	2	8	218133	218140	50 %	0 %	50 %	0 %	551593808
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3723	NC_022579	CAAA	2	8	223913	223920	75 %	0 %	0 %	25 %	551593814
3724	NC_022579	TG	3	6	223921	223926	0 %	50 %	50 %	0 %	551593814
3725	NC_022579	CA	3	6	223986	223991	50 %	0 %	0 %	50 %	551593815
3726	NC_022579	ACTGA	2	10	224021	224030	40 %	20 %	20 %	20 %	551593815
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3730	NC_022579	GA	3	6	224322	224327	50 %	0 %	50 %	0 %	551593815
3731	NC_022579	CAT	2	6	224338	224343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593815
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3740	NC_022579	GCG	2	6	224981	224986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593816
3741	NC_022579	TCC	2	6	224994	224999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593816
3742	NC_022579	TGA	2	6	225054	225059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593816
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3744	NC_022579	TGA	2	6	225359	225364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593817
3745	NC_022579	AGC	2	6	225479	225484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593817
3746	NC_022579	TGAC	2	8	225490	225497	25 %	25 %	25 %	25 %	551593817
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3753	NC_022579	CCTG	2	8	225793	225800	0 %	25 %	25 %	50 %	551593818
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3771	NC_022579	GACC	2	8	226744	226751	25 %	0 %	25 %	50 %	551593821
3772	NC_022579	GAAT	2	8	226836	226843	50 %	25 %	25 %	0 %	551593821
3773	NC_022579	GCT	2	6	226873	226878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593821
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3775	NC_022579	AGC	2	6	226953	226958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593821
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3777	NC_022579	TCT	2	6	227272	227277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593823
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3833	NC_022579	GCAA	2	8	231209	231216	50 %	0 %	25 %	25 %	551593831
3834	NC_022579	TCA	2	6	231224	231229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593831
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3838	NC_022579	GGCT	2	8	231547	231554	0 %	25 %	50 %	25 %	551593832
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3845	NC_022579	GGC	2	6	232096	232101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593832
3846	NC_022579	TGG	2	6	232131	232136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593832
3847	NC_022579	ACACC	2	10	232167	232176	40 %	0 %	0 %	60 %	551593832
3848	NC_022579	GGA	2	6	232213	232218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593832
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3853	NC_022579	TG	3	6	232415	232420	0 %	50 %	50 %	0 %	551593834
3854	NC_022579	TTGA	2	8	232540	232547	25 %	50 %	25 %	0 %	551593834
3855	NC_022579	CTC	2	6	232783	232788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593835
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3862	NC_022579	GTTG	2	8	233234	233241	0 %	50 %	50 %	0 %	551593835
3863	NC_022579	T	6	6	233302	233307	0 %	100 %	0 %	0 %	551593835
3864	NC_022579	TCCG	2	8	233347	233354	0 %	25 %	25 %	50 %	551593835
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3989	NC_022579	T	6	6	240139	240144	0 %	100 %	0 %	0 %	551593844
3990	NC_022579	GCT	2	6	240167	240172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593844
3991	NC_022579	ACAA	2	8	240216	240223	75 %	0 %	0 %	25 %	551593844
3992	NC_022579	GAAA	2	8	240225	240232	75 %	0 %	25 %	0 %	551593844
3993	NC_022579	GAT	2	6	240293	240298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593844
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3995	NC_022579	TAT	2	6	240358	240363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593844
3996	NC_022579	A	6	6	240431	240436	100 %	0 %	0 %	0 %	551593844
3997	NC_022579	AGAA	2	8	240483	240490	75 %	0 %	25 %	0 %	551593844
3998	NC_022579	ACT	2	6	240509	240514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593844
3999	NC_022579	GCAA	2	8	240515	240522	50 %	0 %	25 %	25 %	551593844
4000	NC_022579	TGA	2	6	240531	240536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593844

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