MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 62686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_022579	GGCT	2	8	151640	151647	0 %	25 %	50 %	25 %	551593750
2502	NC_022579	GAA	2	6	151705	151710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593750
2503	NC_022579	GAT	2	6	151716	151721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593750
2504	NC_022579	CAATA	2	10	151840	151849	60 %	20 %	0 %	20 %	551593750
2505	NC_022579	TGT	2	6	151926	151931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593750
2506	NC_022579	GCCT	2	8	151933	151940	0 %	25 %	25 %	50 %	551593750
2507	NC_022579	GAGCCG	2	12	152017	152028	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	551593750
2508	NC_022579	CCG	2	6	152071	152076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593750
2509	NC_022579	TGCC	2	8	152139	152146	0 %	25 %	25 %	50 %	551593750
2510	NC_022579	GAG	2	6	152161	152166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593750
2511	NC_022579	TGC	2	6	152193	152198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593750
2512	NC_022579	TGC	2	6	152208	152213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593750
2513	NC_022579	ACT	2	6	152587	152592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593750
2514	NC_022579	GCGT	2	8	152624	152631	0 %	25 %	50 %	25 %	551593750
2515	NC_022579	AG	3	6	152658	152663	50 %	0 %	50 %	0 %	551593750
2516	NC_022579	ATT	2	6	152902	152907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593750
2517	NC_022579	GCA	2	6	152946	152951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593750
2518	NC_022579	GCCGGA	2	12	153049	153060	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	551593750
2519	NC_022579	ATGG	2	8	153075	153082	25 %	25 %	50 %	0 %	551593750
2520	NC_022579	G	8	8	153102	153109	0 %	0 %	100 %	0 %	551593750
2521	NC_022579	GT	3	6	153120	153125	0 %	50 %	50 %	0 %	551593750
2522	NC_022579	TCA	2	6	153181	153186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593750
2523	NC_022579	A	6	6	153193	153198	100 %	0 %	0 %	0 %	551593750
2524	NC_022579	CAG	2	6	153244	153249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593750
2525	NC_022579	AAG	2	6	153458	153463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593750
2526	NC_022579	GCT	2	6	153483	153488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593750
2527	NC_022579	ATG	2	6	153521	153526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593750
2528	NC_022579	TGCCTT	2	12	153530	153541	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	551593750
2529	NC_022579	GCTTC	2	10	153544	153553	0 %	40 %	20 %	40 %	551593750
2530	NC_022579	GAA	2	6	153556	153561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593750
2531	NC_022579	TTC	2	6	153569	153574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593750
2532	NC_022579	A	6	6	153601	153606	100 %	0 %	0 %	0 %	551593750
2533	NC_022579	ATC	2	6	153635	153640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593750
2534	NC_022579	AGA	2	6	153663	153668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593750
2535	NC_022579	GTT	2	6	153789	153794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593751
2536	NC_022579	GCG	2	6	153826	153831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593751
2537	NC_022579	G	6	6	153831	153836	0 %	0 %	100 %	0 %	551593751
2538	NC_022579	GCCT	2	8	153838	153845	0 %	25 %	25 %	50 %	551593751
2539	NC_022579	GAT	2	6	153850	153855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593751
2540	NC_022579	T	6	6	153868	153873	0 %	100 %	0 %	0 %	551593752
2541	NC_022579	TTC	2	6	153898	153903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593752
2542	NC_022579	G	6	6	153917	153922	0 %	0 %	100 %	0 %	551593752
2543	NC_022579	GT	3	6	153966	153971	0 %	50 %	50 %	0 %	551593752
2544	NC_022579	ATTT	2	8	153996	154003	25 %	75 %	0 %	0 %	551593752
2545	NC_022579	CTT	2	6	154005	154010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593752
2546	NC_022579	TTCTT	2	10	154051	154060	0 %	80 %	0 %	20 %	551593752
2547	NC_022579	T	6	6	154084	154089	0 %	100 %	0 %	0 %	551593752
2548	NC_022579	CTA	2	6	154155	154160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593752
2549	NC_022579	CTT	2	6	154287	154292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593752
2550	NC_022579	GGC	2	6	154300	154305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593752
2551	NC_022579	CAT	2	6	154324	154329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593752
2552	NC_022579	TC	3	6	154374	154379	0 %	50 %	0 %	50 %	551593752
2553	NC_022579	TTC	2	6	154450	154455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593752
2554	NC_022579	TTC	2	6	154483	154488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593752
2555	NC_022579	GA	3	6	154491	154496	50 %	0 %	50 %	0 %	551593752
2556	NC_022579	GTT	2	6	154528	154533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593752
2557	NC_022579	GC	3	6	154596	154601	0 %	0 %	50 %	50 %	551593752
2558	NC_022579	A	6	6	154604	154609	100 %	0 %	0 %	0 %	551593752
2559	NC_022579	ATG	2	6	154613	154618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593752
2560	NC_022579	TCA	2	6	154671	154676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593752
2561	NC_022579	AAG	2	6	154693	154698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593752
2562	NC_022579	CAA	2	6	154701	154706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593752
2563	NC_022579	CCG	2	6	154787	154792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593752
2564	NC_022579	T	6	6	154873	154878	0 %	100 %	0 %	0 %	551593752
2565	NC_022579	TCCT	2	8	154882	154889	0 %	50 %	0 %	50 %	551593752
2566	NC_022579	GCA	2	6	155031	155036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593752
2567	NC_022579	CCAGCA	2	12	155091	155102	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	551593752
2568	NC_022579	TGA	2	6	155133	155138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593752
2569	NC_022579	TGG	2	6	155169	155174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593752
2570	NC_022579	AAT	2	6	155257	155262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593752
2571	NC_022579	TTC	3	9	155275	155283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593752
2572	NC_022579	TTC	2	6	155329	155334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593752
2573	NC_022579	CCG	2	6	155339	155344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593752
2574	NC_022579	CAT	2	6	155356	155361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593752
2575	NC_022579	GTT	2	6	155387	155392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593752
2576	NC_022579	TGAT	2	8	155403	155410	25 %	50 %	25 %	0 %	551593752
2577	NC_022579	TTCCA	2	10	155499	155508	20 %	40 %	0 %	40 %	551593752
2578	NC_022579	AAT	2	6	155512	155517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593752
2579	NC_022579	TTTTG	2	10	155659	155668	0 %	80 %	20 %	0 %	551593752
2580	NC_022579	CTT	2	6	155730	155735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593752
2581	NC_022579	T	6	6	155857	155862	0 %	100 %	0 %	0 %	551593752
2582	NC_022579	CAG	3	9	155959	155967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593752
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2584	NC_022579	CAA	2	6	156102	156107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593752
2585	NC_022579	AAG	2	6	156148	156153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593752
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2588	NC_022579	TGC	2	6	156432	156437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593753
2589	NC_022579	GCTCG	2	10	156447	156456	0 %	20 %	40 %	40 %	551593753
2590	NC_022579	GGGC	2	8	156672	156679	0 %	0 %	75 %	25 %	551593753
2591	NC_022579	GAA	2	6	156682	156687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593753
2592	NC_022579	CGG	3	9	156699	156707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593753
2593	NC_022579	TAA	2	6	156711	156716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593753
2594	NC_022579	GAA	2	6	156727	156732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593753
2595	NC_022579	CGG	2	6	156765	156770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593753
2596	NC_022579	AG	3	6	156892	156897	50 %	0 %	50 %	0 %	551593753
2597	NC_022579	GAA	2	6	156922	156927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593753
2598	NC_022579	GC	3	6	157066	157071	0 %	0 %	50 %	50 %	551593753
2599	NC_022579	CTT	2	6	157207	157212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593753
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2601	NC_022579	AATTTG	2	12	157283	157294	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	551593753
2602	NC_022579	GCG	2	6	157334	157339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593753
2603	NC_022579	GC	3	6	157409	157414	0 %	0 %	50 %	50 %	551593753
2604	NC_022579	A	6	6	157521	157526	100 %	0 %	0 %	0 %	551593753
2605	NC_022579	CCG	2	6	157559	157564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593753
2606	NC_022579	TGATC	2	10	157572	157581	20 %	40 %	20 %	20 %	551593753
2607	NC_022579	AAAAG	2	10	157583	157592	80 %	0 %	20 %	0 %	551593753
2608	NC_022579	GCT	2	6	157614	157619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593753
2609	NC_022579	TTG	2	6	157628	157633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593753
2610	NC_022579	CAT	2	6	157689	157694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593753
2611	NC_022579	CTT	2	6	157708	157713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593753
2612	NC_022579	ATG	2	6	157726	157731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593753
2613	NC_022579	GA	3	6	157867	157872	50 %	0 %	50 %	0 %	551593754
2614	NC_022579	TGC	2	6	157875	157880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593754
2615	NC_022579	CTT	2	6	157926	157931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593754
2616	NC_022579	TTA	2	6	157935	157940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593754
2617	NC_022579	ACC	2	6	158030	158035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593754
2618	NC_022579	GGTGCG	2	12	158077	158088	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	551593754
2619	NC_022579	G	7	7	158212	158218	0 %	0 %	100 %	0 %	551593754
2620	NC_022579	ATG	2	6	158241	158246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593754
2621	NC_022579	T	6	6	158306	158311	0 %	100 %	0 %	0 %	551593754
2622	NC_022579	CTT	2	6	158360	158365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593754
2623	NC_022579	ATG	2	6	158399	158404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593754
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2989	NC_022579	ATC	2	6	180369	180374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593777
2990	NC_022579	GTCC	2	8	180397	180404	0 %	25 %	25 %	50 %	551593777
2991	NC_022579	GCC	2	6	180407	180412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593777
2992	NC_022579	GGA	2	6	180428	180433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593777
2993	NC_022579	CCA	2	6	180465	180470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593777
2994	NC_022579	GAT	2	6	180566	180571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593777
2995	NC_022579	TGG	2	6	180613	180618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593777
2996	NC_022579	GCCA	2	8	180704	180711	25 %	0 %	25 %	50 %	551593777
2997	NC_022579	ACC	2	6	180790	180795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593777
2998	NC_022579	CAGGT	2	10	180915	180924	20 %	20 %	40 %	20 %	551593777
2999	NC_022579	AAC	2	6	180926	180931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593777
3000	NC_022579	TCC	2	6	180974	180979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593777

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