MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 62686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022579	GTT	2	6	31106	31111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593636
502	NC_022579	GCAGA	2	10	31352	31361	40 %	0 %	40 %	20 %	551593636
503	NC_022579	TTG	2	6	31523	31528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593636
504	NC_022579	GAT	2	6	31618	31623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593636
505	NC_022579	GTT	2	6	31649	31654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593636
506	NC_022579	T	6	6	31653	31658	0 %	100 %	0 %	0 %	551593636
507	NC_022579	AGG	2	6	31677	31682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593636
508	NC_022579	CGTT	2	8	31690	31697	0 %	50 %	25 %	25 %	551593636
509	NC_022579	ACT	2	6	31749	31754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593636
510	NC_022579	TG	3	6	31791	31796	0 %	50 %	50 %	0 %	551593636
511	NC_022579	GGA	3	9	31908	31916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593636
512	NC_022579	TCA	2	6	31941	31946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593636
513	NC_022579	AGA	2	6	31972	31977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593636
514	NC_022579	TGG	2	6	32208	32213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593637
515	NC_022579	ATT	2	6	32251	32256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593637
516	NC_022579	TGA	2	6	32311	32316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593637
517	NC_022579	TGT	3	9	32322	32330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593637
518	NC_022579	TC	3	6	32339	32344	0 %	50 %	0 %	50 %	551593637
519	NC_022579	GTT	2	6	32355	32360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593637
520	NC_022579	CTT	2	6	32364	32369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593637
521	NC_022579	TTC	2	6	32383	32388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593637
522	NC_022579	ATC	2	6	32392	32397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593637
523	NC_022579	TTC	2	6	32434	32439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593637
524	NC_022579	GCC	2	6	32476	32481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593637
525	NC_022579	TA	3	6	32484	32489	50 %	50 %	0 %	0 %	551593637
526	NC_022579	ATA	2	6	32671	32676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593637
527	NC_022579	ATTG	2	8	32698	32705	25 %	50 %	25 %	0 %	551593637
528	NC_022579	CGG	2	6	32889	32894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593637
529	NC_022579	GT	3	6	32942	32947	0 %	50 %	50 %	0 %	551593637
530	NC_022579	T	7	7	32956	32962	0 %	100 %	0 %	0 %	551593637
531	NC_022579	T	6	6	32969	32974	0 %	100 %	0 %	0 %	551593637
532	NC_022579	T	8	8	33005	33012	0 %	100 %	0 %	0 %	551593637
533	NC_022579	AT	3	6	33066	33071	50 %	50 %	0 %	0 %	551593637
534	NC_022579	CAT	2	6	33120	33125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593637
535	NC_022579	TTTCCT	6	36	33153	33188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593637
536	NC_022579	AAT	2	6	33262	33267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593637
537	NC_022579	ATG	2	6	33313	33318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593637
538	NC_022579	T	6	6	33382	33387	0 %	100 %	0 %	0 %	551593637
539	NC_022579	CCA	2	6	33457	33462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593637
540	NC_022579	AGG	2	6	33496	33501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593637
541	NC_022579	GTTT	2	8	33523	33530	0 %	75 %	25 %	0 %	551593637
542	NC_022579	TTC	2	6	33553	33558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593637
543	NC_022579	GAA	2	6	33632	33637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593637
544	NC_022579	CA	3	6	33656	33661	50 %	0 %	0 %	50 %	551593637
545	NC_022579	GTCT	2	8	33680	33687	0 %	50 %	25 %	25 %	551593637
546	NC_022579	TTC	2	6	33802	33807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593637
547	NC_022579	TAA	2	6	33825	33830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593637
548	NC_022579	ATAA	2	8	33880	33887	75 %	25 %	0 %	0 %	551593637
549	NC_022579	TTC	2	6	33889	33894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593637
550	NC_022579	GCT	2	6	33908	33913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593637
551	NC_022579	TCT	2	6	33956	33961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593637
552	NC_022579	GCA	2	6	33971	33976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593637
553	NC_022579	TAA	2	6	33978	33983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593637
554	NC_022579	TGA	2	6	34011	34016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593637
555	NC_022579	ATT	2	6	34025	34030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593637
556	NC_022579	TGAT	2	8	34049	34056	25 %	50 %	25 %	0 %	551593638
557	NC_022579	TGGT	2	8	34238	34245	0 %	50 %	50 %	0 %	551593638
558	NC_022579	TCG	2	6	34447	34452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593638
559	NC_022579	TGT	2	6	34504	34509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593638
560	NC_022579	T	6	6	34605	34610	0 %	100 %	0 %	0 %	551593638
561	NC_022579	CTC	2	6	34614	34619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593638
562	NC_022579	GAC	2	6	34631	34636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593638
563	NC_022579	T	9	9	34702	34710	0 %	100 %	0 %	0 %	551593638
564	NC_022579	CAA	2	6	34724	34729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593638
565	NC_022579	A	6	6	34728	34733	100 %	0 %	0 %	0 %	551593638
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568	NC_022579	TGA	2	6	34827	34832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593638
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572	NC_022579	ATT	2	6	34959	34964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593638
573	NC_022579	ACC	2	6	34974	34979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593638
574	NC_022579	A	6	6	35191	35196	100 %	0 %	0 %	0 %	551593639
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577	NC_022579	TAC	2	6	35247	35252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593639
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579	NC_022579	GACT	2	8	35433	35440	25 %	25 %	25 %	25 %	551593639
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583	NC_022579	TAC	2	6	35587	35592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593639
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591	NC_022579	T	7	7	35887	35893	0 %	100 %	0 %	0 %	551593640
592	NC_022579	TAA	2	6	35984	35989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593640
593	NC_022579	TTA	2	6	36020	36025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593640
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597	NC_022579	T	6	6	37451	37456	0 %	100 %	0 %	0 %	551593641
598	NC_022579	T	6	6	37475	37480	0 %	100 %	0 %	0 %	551593641
599	NC_022579	CTT	2	6	37606	37611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593641
600	NC_022579	GC	3	6	37723	37728	0 %	0 %	50 %	50 %	551593641
601	NC_022579	GCTGT	2	10	37825	37834	0 %	40 %	40 %	20 %	551593641
602	NC_022579	TA	3	6	37841	37846	50 %	50 %	0 %	0 %	551593641
603	NC_022579	CTG	2	6	37978	37983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593641
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608	NC_022579	CTTG	2	8	38241	38248	0 %	50 %	25 %	25 %	551593641
609	NC_022579	CCTT	2	8	38272	38279	0 %	50 %	0 %	50 %	551593641
610	NC_022579	CAGG	2	8	38287	38294	25 %	0 %	50 %	25 %	551593641
611	NC_022579	T	6	6	38331	38336	0 %	100 %	0 %	0 %	551593641
612	NC_022579	GTTG	2	8	38463	38470	0 %	50 %	50 %	0 %	551593642
613	NC_022579	AGC	2	6	38523	38528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593642
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617	NC_022579	CATGT	2	10	38652	38661	20 %	40 %	20 %	20 %	551593642
618	NC_022579	TGT	2	6	38666	38671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593642
619	NC_022579	CTT	2	6	38796	38801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593642
620	NC_022579	GCG	2	6	38971	38976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593642
621	NC_022579	TACG	2	8	39002	39009	25 %	25 %	25 %	25 %	551593642
622	NC_022579	GCC	2	6	39107	39112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593642
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628	NC_022579	T	6	6	39357	39362	0 %	100 %	0 %	0 %	551593642
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