MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis str. sp nov AM13 chromosome

Total Repeats: 62686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_022579	AACAG	2	10	299509	299518	60 %	0 %	20 %	20 %	551593918
5003	NC_022579	TCA	2	6	299549	299554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593918
5004	NC_022579	TTG	2	6	299596	299601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593918
5005	NC_022579	GCA	2	6	299636	299641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593918
5006	NC_022579	AT	3	6	299663	299668	50 %	50 %	0 %	0 %	551593918
5007	NC_022579	TGT	2	6	299775	299780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593918
5008	NC_022579	GTA	2	6	299882	299887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593918
5009	NC_022579	CTT	2	6	299907	299912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593918
5010	NC_022579	CAC	2	6	299961	299966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593918
5011	NC_022579	AGA	2	6	300034	300039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593918
5012	NC_022579	GT	3	6	300138	300143	0 %	50 %	50 %	0 %	551593918
5013	NC_022579	AGAA	2	8	300286	300293	75 %	0 %	25 %	0 %	551593919
5014	NC_022579	T	6	6	300340	300345	0 %	100 %	0 %	0 %	551593919
5015	NC_022579	T	7	7	300385	300391	0 %	100 %	0 %	0 %	551593919
5016	NC_022579	CAAT	2	8	300414	300421	50 %	25 %	0 %	25 %	551593919
5017	NC_022579	CGC	2	6	300488	300493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593919
5018	NC_022579	TTG	2	6	300535	300540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593919
5019	NC_022579	TG	4	8	300547	300554	0 %	50 %	50 %	0 %	551593919
5020	NC_022579	AAT	3	9	300608	300616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593919
5021	NC_022579	A	6	6	300638	300643	100 %	0 %	0 %	0 %	551593919
5022	NC_022579	ATCC	2	8	300704	300711	25 %	25 %	0 %	50 %	551593919
5023	NC_022579	ATCA	2	8	300806	300813	50 %	25 %	0 %	25 %	551593919
5024	NC_022579	GAA	2	6	300865	300870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593919
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5027	NC_022579	TTC	2	6	301007	301012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593919
5028	NC_022579	ATGTC	2	10	301047	301056	20 %	40 %	20 %	20 %	551593919
5029	NC_022579	AAT	2	6	301264	301269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593920
5030	NC_022579	GCA	2	6	301306	301311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	551593920
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5032	NC_022579	AG	3	6	301364	301369	50 %	0 %	50 %	0 %	551593920
5033	NC_022579	CT	3	6	301426	301431	0 %	50 %	0 %	50 %	551593920
5034	NC_022579	TCTA	2	8	301438	301445	25 %	50 %	0 %	25 %	551593920
5035	NC_022579	TAT	2	6	301446	301451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593920
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5037	NC_022579	AAT	2	6	301513	301518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593920
5038	NC_022579	ATT	2	6	301582	301587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593920
5039	NC_022579	AAT	2	6	301624	301629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593920
5040	NC_022579	TA	3	6	301717	301722	50 %	50 %	0 %	0 %	551593920
5041	NC_022579	CA	3	6	301770	301775	50 %	0 %	0 %	50 %	551593920
5042	NC_022579	A	6	6	301958	301963	100 %	0 %	0 %	0 %	551593920
5043	NC_022579	AT	3	6	302055	302060	50 %	50 %	0 %	0 %	551593920
5044	NC_022579	ATT	2	6	302115	302120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593921
5045	NC_022579	T	8	8	302156	302163	0 %	100 %	0 %	0 %	551593921
5046	NC_022579	T	6	6	302242	302247	0 %	100 %	0 %	0 %	551593921
5047	NC_022579	AACAAA	2	12	302262	302273	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	551593921
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5049	NC_022579	GTT	2	6	302520	302525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	551593921
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5053	NC_022579	GGT	2	6	302674	302679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593921
5054	NC_022579	GGA	2	6	302738	302743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	551593921
5055	NC_022579	AAT	2	6	302857	302862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593921
5056	NC_022579	TATC	2	8	302897	302904	25 %	50 %	0 %	25 %	551593921
5057	NC_022579	TCT	2	6	302935	302940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593921
5058	NC_022579	CAAC	2	8	302945	302952	50 %	0 %	0 %	50 %	551593921
5059	NC_022579	A	7	7	302974	302980	100 %	0 %	0 %	0 %	551593921
5060	NC_022579	AAGG	2	8	303008	303015	50 %	0 %	50 %	0 %	551593921
5061	NC_022579	TCT	2	6	303031	303036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593921
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5063	NC_022579	TA	3	6	303134	303139	50 %	50 %	0 %	0 %	551593921
5064	NC_022579	T	7	7	303195	303201	0 %	100 %	0 %	0 %	551593921
5065	NC_022579	ATC	2	6	303222	303227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593921
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5067	NC_022579	TCA	2	6	303292	303297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593921
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5074	NC_022579	GATTT	2	10	303831	303840	20 %	60 %	20 %	0 %	551593922
5075	NC_022579	TTCT	2	8	303874	303881	0 %	75 %	0 %	25 %	551593922
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5088	NC_022579	T	6	6	304470	304475	0 %	100 %	0 %	0 %	551593922
5089	NC_022579	CAA	2	6	304483	304488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593922
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5103	NC_022579	AT	3	6	305017	305022	50 %	50 %	0 %	0 %	551593923
5104	NC_022579	AAC	2	6	305089	305094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	551593923
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5107	NC_022579	TAA	2	6	305350	305355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	551593924
5108	NC_022579	AATCT	2	10	305376	305385	40 %	40 %	0 %	20 %	551593924
5109	NC_022579	AATG	2	8	305454	305461	50 %	25 %	25 %	0 %	551593924
5110	NC_022579	CTG	2	6	305497	305502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593924
5111	NC_022579	T	6	6	305527	305532	0 %	100 %	0 %	0 %	551593924
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5119	NC_022579	AATT	2	8	305938	305945	50 %	50 %	0 %	0 %	551593926
5120	NC_022579	CCA	2	6	305946	305951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593926
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5122	NC_022579	TTC	2	6	306055	306060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593926
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5124	NC_022579	GCC	3	9	306172	306180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593926
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5230	NC_022579	TCTT	2	8	312382	312389	0 %	75 %	0 %	25 %	551593929
5231	NC_022579	CCG	2	6	312407	312412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593929
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5241	NC_022579	GCT	2	6	312927	312932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593929
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5245	NC_022579	CAT	2	6	313050	313055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	551593929
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5248	NC_022579	T	6	6	313179	313184	0 %	100 %	0 %	0 %	551593930
5249	NC_022579	CATGC	2	10	313218	313227	20 %	20 %	20 %	40 %	551593930
5250	NC_022579	TATC	2	8	313229	313236	25 %	50 %	0 %	25 %	551593930
5251	NC_022579	ATTT	2	8	313305	313312	25 %	75 %	0 %	0 %	551593930
5252	NC_022579	TAT	2	6	313482	313487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	551593931
5253	NC_022579	CCG	2	6	313595	313600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	551593931
5254	NC_022579	TGC	2	6	313606	313611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	551593931
5255	NC_022579	GGC	2	6	313647	313652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593931
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5259	NC_022579	GACA	2	8	314019	314026	50 %	0 %	25 %	25 %	551593932
5260	NC_022579	GCG	2	6	314088	314093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	551593932
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5262	NC_022579	GGATG	2	10	314460	314469	20 %	20 %	60 %	0 %	551593932
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5364	NC_022579	TGA	2	6	320276	320281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593938
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5368	NC_022579	GAA	2	6	320395	320400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	551593938
5369	NC_022579	TCT	2	6	320420	320425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	551593938
5370	NC_022579	ACC	2	6	320453	320458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	551593938
5371	NC_022579	TCC	2	6	320474	320479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	551593938
5372	NC_022579	GTA	2	6	320497	320502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	551593938
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5485	NC_022579	TGAG	2	8	326541	326548	25 %	25 %	50 %	0 %	551593948
5486	NC_022579	TGG	2	6	326644	326649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	551593948
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