MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides mccartyi BTF08

Total Repeats: 23910

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020387	ATA	3	9	90639	90647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204409
1502	NC_020387	CTG	2	6	90659	90664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204409
1503	NC_020387	GAA	2	6	90671	90676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204409
1504	NC_020387	TCAG	2	8	90711	90718	25 %	25 %	25 %	25 %	452204409
1505	NC_020387	ATT	2	6	90728	90733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452204409
1506	NC_020387	GGT	2	6	90739	90744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204409
1507	NC_020387	AGG	2	6	90831	90836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452204409
1508	NC_020387	TCT	2	6	90888	90893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204409
1509	NC_020387	TTC	2	6	90902	90907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204409
1510	NC_020387	TTCA	2	8	90911	90918	25 %	50 %	0 %	25 %	452204409
1511	NC_020387	CAG	3	9	90920	90928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204409
1512	NC_020387	GTT	2	6	90959	90964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452204409
1513	NC_020387	GTCA	2	8	91013	91020	25 %	25 %	25 %	25 %	452204409
1514	NC_020387	GCT	3	9	91027	91035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204409
1515	NC_020387	TAT	3	9	91070	91078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452204409
1516	NC_020387	TTCA	2	8	91181	91188	25 %	50 %	0 %	25 %	452204409
1517	NC_020387	AAC	2	6	91346	91351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452204409
1518	NC_020387	GTTT	2	8	91419	91426	0 %	75 %	25 %	0 %	452204409
1519	NC_020387	CTG	2	6	91427	91432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204409
1520	NC_020387	GCA	2	6	91534	91539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204409
1521	NC_020387	TGT	2	6	91552	91557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452204409
1522	NC_020387	ATA	2	6	91560	91565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204409
1523	NC_020387	GGC	2	6	91739	91744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204409
1524	NC_020387	AGCGGT	2	12	91759	91770	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	452204409
1525	NC_020387	TTC	2	6	91800	91805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204409
1526	NC_020387	GGC	2	6	91807	91812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204409
1527	NC_020387	GGT	2	6	91826	91831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204409
1528	NC_020387	AT	3	6	91839	91844	50 %	50 %	0 %	0 %	452204409
1529	NC_020387	TGAT	2	8	91854	91861	25 %	50 %	25 %	0 %	452204409
1530	NC_020387	GGC	2	6	91989	91994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204409
1531	NC_020387	CAG	2	6	92051	92056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204409
1532	NC_020387	GCC	2	6	92088	92093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204409
1533	NC_020387	GGTT	2	8	92095	92102	0 %	50 %	50 %	0 %	452204409
1534	NC_020387	CAAA	2	8	92155	92162	75 %	0 %	0 %	25 %	452204409
1535	NC_020387	TTC	2	6	92174	92179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204409
1536	NC_020387	CTT	2	6	92194	92199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204409
1537	NC_020387	GGC	2	6	92395	92400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204409
1538	NC_020387	CTC	2	6	92567	92572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452204409
1539	NC_020387	T	6	6	92617	92622	0 %	100 %	0 %	0 %	452204409
1540	NC_020387	AT	3	6	92635	92640	50 %	50 %	0 %	0 %	452204409
1541	NC_020387	CTT	2	6	92668	92673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204409
1542	NC_020387	ATA	2	6	92710	92715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204409
1543	NC_020387	CAG	2	6	92720	92725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204409
1544	NC_020387	ACT	2	6	92820	92825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204409
1545	NC_020387	CTG	2	6	92849	92854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204409
1546	NC_020387	GCAG	2	8	92875	92882	25 %	0 %	50 %	25 %	452204409
1547	NC_020387	CA	3	6	93019	93024	50 %	0 %	0 %	50 %	452204409
1548	NC_020387	CTT	2	6	93040	93045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204409
1549	NC_020387	TGG	2	6	93066	93071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204409
1550	NC_020387	TTC	2	6	93107	93112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204409
1551	NC_020387	CCAG	2	8	93157	93164	25 %	0 %	25 %	50 %	452204409
1552	NC_020387	TGGCAA	2	12	93298	93309	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	452204409
1553	NC_020387	GAT	2	6	93311	93316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204409
1554	NC_020387	GCT	2	6	93327	93332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204409
1555	NC_020387	TGG	2	6	93340	93345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204409
1556	NC_020387	AGG	2	6	93372	93377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	452204409
1557	NC_020387	AG	3	6	93465	93470	50 %	0 %	50 %	0 %	452204409
1558	NC_020387	G	6	6	93470	93475	0 %	0 %	100 %	0 %	452204409
1559	NC_020387	ATGAAG	2	12	93635	93646	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	452204410
1560	NC_020387	TGAGG	2	10	93744	93753	20 %	20 %	60 %	0 %	452204410
1561	NC_020387	GCT	2	6	93828	93833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204410
1562	NC_020387	CTT	2	6	93857	93862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204410
1563	NC_020387	TCT	2	6	93921	93926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204410
1564	NC_020387	CGC	2	6	93952	93957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204410
1565	NC_020387	CCG	3	9	93982	93990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204410
1566	NC_020387	GT	3	6	94000	94005	0 %	50 %	50 %	0 %	452204410
1567	NC_020387	ATT	2	6	94041	94046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452204410
1568	NC_020387	GCC	2	6	94055	94060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204410
1569	NC_020387	TA	4	8	94064	94071	50 %	50 %	0 %	0 %	452204410
1570	NC_020387	GCC	2	6	94073	94078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204410
1571	NC_020387	AGGC	2	8	94088	94095	25 %	0 %	50 %	25 %	452204410
1572	NC_020387	C	6	6	94132	94137	0 %	0 %	0 %	100 %	452204410
1573	NC_020387	ACA	2	6	94144	94149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452204410
1574	NC_020387	ATA	2	6	94166	94171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204410
1575	NC_020387	CAGG	2	8	94258	94265	25 %	0 %	50 %	25 %	452204410
1576	NC_020387	CCTG	2	8	94497	94504	0 %	25 %	25 %	50 %	452204410
1577	NC_020387	GGC	2	6	94565	94570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204410
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1580	NC_020387	TA	3	6	94826	94831	50 %	50 %	0 %	0 %	452204410
1581	NC_020387	GGC	2	6	94850	94855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204410
1582	NC_020387	GGC	2	6	94880	94885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204410
1583	NC_020387	GCT	2	6	94895	94900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204410
1584	NC_020387	GCT	2	6	94916	94921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204410
1585	NC_020387	GAA	2	6	94923	94928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204410
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1588	NC_020387	GAAG	2	8	95173	95180	50 %	0 %	50 %	0 %	452204411
1589	NC_020387	AGTC	2	8	95258	95265	25 %	25 %	25 %	25 %	452204411
1590	NC_020387	AGT	2	6	95270	95275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204411
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1592	NC_020387	G	6	6	95341	95346	0 %	0 %	100 %	0 %	452204411
1593	NC_020387	TGGCTG	2	12	95367	95378	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	452204411
1594	NC_020387	GGGCA	2	10	95399	95408	20 %	0 %	60 %	20 %	452204411
1595	NC_020387	TCAC	2	8	95428	95435	25 %	25 %	0 %	50 %	452204412
1596	NC_020387	TTG	2	6	95437	95442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452204412
1597	NC_020387	ATA	3	9	95539	95547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204412
1598	NC_020387	GCC	2	6	95590	95595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204412
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1601	NC_020387	TGC	2	6	95717	95722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204412
1602	NC_020387	TTC	2	6	95742	95747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204412
1603	NC_020387	TCA	2	6	95749	95754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204412
1604	NC_020387	TATTTT	2	12	95763	95774	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	452204412
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1607	NC_020387	CAGA	2	8	96092	96099	50 %	0 %	25 %	25 %	452204413
1608	NC_020387	TC	3	6	96111	96116	0 %	50 %	0 %	50 %	452204413
1609	NC_020387	T	6	6	96239	96244	0 %	100 %	0 %	0 %	452204413
1610	NC_020387	CTG	2	6	96416	96421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204414
1611	NC_020387	CGA	2	6	96445	96450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204414
1612	NC_020387	C	6	6	96456	96461	0 %	0 %	0 %	100 %	452204414
1613	NC_020387	GGAA	2	8	96486	96493	50 %	0 %	50 %	0 %	452204414
1614	NC_020387	ATA	2	6	96501	96506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204414
1615	NC_020387	AG	3	6	96529	96534	50 %	0 %	50 %	0 %	452204414
1616	NC_020387	TAG	2	6	96656	96661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204414
1617	NC_020387	CTGC	2	8	96675	96682	0 %	25 %	25 %	50 %	452204414
1618	NC_020387	GAA	2	6	96695	96700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204414
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1620	NC_020387	ATC	2	6	96726	96731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204414
1621	NC_020387	GAA	2	6	96749	96754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204414
1622	NC_020387	GAA	2	6	96896	96901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204414
1623	NC_020387	ATT	2	6	96918	96923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	452204414
1624	NC_020387	TC	3	6	97091	97096	0 %	50 %	0 %	50 %	452204415
1625	NC_020387	GGT	2	6	97130	97135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204415
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1627	NC_020387	GCC	2	6	97413	97418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204415
1628	NC_020387	GGGGC	2	10	97470	97479	0 %	0 %	80 %	20 %	452204415
1629	NC_020387	GAA	2	6	97617	97622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	452204415
1630	NC_020387	TAC	2	6	97652	97657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204415
1631	NC_020387	GTG	2	6	97776	97781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204415
1632	NC_020387	GAT	2	6	97785	97790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204415
1633	NC_020387	TAA	2	6	97847	97852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204415
1634	NC_020387	G	6	6	97889	97894	0 %	0 %	100 %	0 %	452204415
1635	NC_020387	TCAG	2	8	97911	97918	25 %	25 %	25 %	25 %	452204415
1636	NC_020387	TGG	2	6	98026	98031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204415
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1642	NC_020387	C	6	6	98214	98219	0 %	0 %	0 %	100 %	452204416
1643	NC_020387	TA	4	8	98434	98441	50 %	50 %	0 %	0 %	452204417
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1645	NC_020387	GAT	2	6	98924	98929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204418
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1647	NC_020387	GCC	2	6	99090	99095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204418
1648	NC_020387	GAT	2	6	99185	99190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204418
1649	NC_020387	CTG	2	6	99221	99226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204418
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1652	NC_020387	ACGGA	2	10	99340	99349	40 %	0 %	40 %	20 %	452204418
1653	NC_020387	AAC	2	6	99429	99434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	452204418
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1739	NC_020387	GACT	2	8	104018	104025	25 %	25 %	25 %	25 %	452204423
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1741	NC_020387	TA	3	6	104061	104066	50 %	50 %	0 %	0 %	452204423
1742	NC_020387	TGG	2	6	104069	104074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204423
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1744	NC_020387	GCT	2	6	104238	104243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204423
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1747	NC_020387	GCC	2	6	104455	104460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204423
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1874	NC_020387	AT	3	6	111733	111738	50 %	50 %	0 %	0 %	452204431
1875	NC_020387	TCTG	2	8	111819	111826	0 %	50 %	25 %	25 %	452204431
1876	NC_020387	TCT	2	6	111991	111996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204432
1877	NC_020387	CTGCTT	2	12	112001	112012	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	452204432
1878	NC_020387	TCT	2	6	112039	112044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204432
1879	NC_020387	TCA	2	6	112090	112095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204432
1880	NC_020387	CCATGC	2	12	112145	112156	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	452204432
1881	NC_020387	CTT	2	6	112217	112222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204432
1882	NC_020387	GGT	2	6	112610	112615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204433
1883	NC_020387	T	6	6	112677	112682	0 %	100 %	0 %	0 %	452204433
1884	NC_020387	GGC	2	6	112723	112728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204433
1885	NC_020387	GCC	2	6	112807	112812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	452204433
1886	NC_020387	TCC	2	6	112931	112936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452204433
1887	NC_020387	CATT	2	8	112953	112960	25 %	50 %	0 %	25 %	452204433
1888	NC_020387	TGG	2	6	113030	113035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204433
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1890	NC_020387	T	7	7	113213	113219	0 %	100 %	0 %	0 %	452204434
1891	NC_020387	TAACA	2	10	113235	113244	60 %	20 %	0 %	20 %	452204434
1892	NC_020387	AAT	2	6	113325	113330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204434
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1894	NC_020387	ACT	2	6	113428	113433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204434
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1903	NC_020387	TGG	2	6	113612	113617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204434
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1968	NC_020387	TAC	2	6	117970	117975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204440
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1970	NC_020387	GCA	2	6	118172	118177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204440
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1972	NC_020387	ATA	2	6	118302	118307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	452204441
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1977	NC_020387	TCA	2	6	118599	118604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204441
1978	NC_020387	AT	3	6	118644	118649	50 %	50 %	0 %	0 %	452204441
1979	NC_020387	CTC	2	6	118661	118666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	452204441
1980	NC_020387	TTTCAG	2	12	118697	118708	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	452204441
1981	NC_020387	GTTCAA	2	12	118726	118737	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	452204441
1982	NC_020387	CTG	2	6	118785	118790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	452204441
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1985	NC_020387	G	6	6	118864	118869	0 %	0 %	100 %	0 %	452204441
1986	NC_020387	GCCT	2	8	118902	118909	0 %	25 %	25 %	50 %	452204441
1987	NC_020387	GCCT	2	8	118932	118939	0 %	25 %	25 %	50 %	452204441
1988	NC_020387	CAG	2	6	118940	118945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204441
1989	NC_020387	TCCG	2	8	119011	119018	0 %	25 %	25 %	50 %	452204441
1990	NC_020387	ATC	2	6	119042	119047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	452204441
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1992	NC_020387	GGC	2	6	119218	119223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204441
1993	NC_020387	TGA	2	6	119364	119369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204441
1994	NC_020387	TCT	2	6	119430	119435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204441
1995	NC_020387	AGT	2	6	119470	119475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	452204441
1996	NC_020387	GTG	2	6	119484	119489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	452204441
1997	NC_020387	GTT	2	6	119498	119503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	452204441
1998	NC_020387	GGC	2	6	119513	119518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	452204441
1999	NC_020387	TTC	2	6	119522	119527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	452204441
2000	NC_020387	CAG	2	6	119616	119621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	452204441

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