MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 62685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020055	AAG	2	6	181025	181030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839893
3002	NC_020055	TTA	2	6	181081	181086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839893
3003	NC_020055	TGA	2	6	181096	181101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839893
3004	NC_020055	A	6	6	181194	181199	100 %	0 %	0 %	0 %	436839893
3005	NC_020055	ATG	2	6	181302	181307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839893
3006	NC_020055	TGC	2	6	181324	181329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839893
3007	NC_020055	ATC	2	6	181365	181370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839893
3008	NC_020055	T	6	6	181426	181431	0 %	100 %	0 %	0 %	436839893
3009	NC_020055	GTT	2	6	181561	181566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839894
3010	NC_020055	AGC	2	6	181634	181639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839894
3011	NC_020055	T	8	8	181655	181662	0 %	100 %	0 %	0 %	436839894
3012	NC_020055	GT	3	6	181685	181690	0 %	50 %	50 %	0 %	436839894
3013	NC_020055	ATT	2	6	182022	182027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839895
3014	NC_020055	TGA	2	6	182041	182046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839895
3015	NC_020055	T	6	6	182077	182082	0 %	100 %	0 %	0 %	436839895
3016	NC_020055	TCA	2	6	182109	182114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839895
3017	NC_020055	TGTT	2	8	182122	182129	0 %	75 %	25 %	0 %	436839895
3018	NC_020055	T	7	7	182313	182319	0 %	100 %	0 %	0 %	436839895
3019	NC_020055	AGC	2	6	182365	182370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839895
3020	NC_020055	CTG	2	6	182371	182376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839895
3021	NC_020055	GGTCAG	2	12	182387	182398	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	436839895
3022	NC_020055	TTATT	2	10	182488	182497	20 %	80 %	0 %	0 %	436839896
3023	NC_020055	G	6	6	182531	182536	0 %	0 %	100 %	0 %	436839896
3024	NC_020055	TCT	2	6	182564	182569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839896
3025	NC_020055	TGA	2	6	182665	182670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839896
3026	NC_020055	AAAT	2	8	182737	182744	75 %	25 %	0 %	0 %	436839896
3027	NC_020055	AG	4	8	182951	182958	50 %	0 %	50 %	0 %	436839896
3028	NC_020055	CAT	2	6	182989	182994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839896
3029	NC_020055	AGT	2	6	183021	183026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839896
3030	NC_020055	T	7	7	183026	183032	0 %	100 %	0 %	0 %	436839896
3031	NC_020055	GCA	2	6	183043	183048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839896
3032	NC_020055	GCA	2	6	183113	183118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839896
3033	NC_020055	TTGTT	2	10	183146	183155	0 %	80 %	20 %	0 %	436839896
3034	NC_020055	GAGG	2	8	183428	183435	25 %	0 %	75 %	0 %	436839897
3035	NC_020055	TGC	2	6	183461	183466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839897
3036	NC_020055	GT	3	6	183490	183495	0 %	50 %	50 %	0 %	436839897
3037	NC_020055	TG	3	6	183542	183547	0 %	50 %	50 %	0 %	436839897
3038	NC_020055	CATC	2	8	183555	183562	25 %	25 %	0 %	50 %	436839897
3039	NC_020055	CCG	2	6	183605	183610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839897
3040	NC_020055	T	6	6	183621	183626	0 %	100 %	0 %	0 %	436839897
3041	NC_020055	T	6	6	184058	184063	0 %	100 %	0 %	0 %	436839899
3042	NC_020055	CAGCG	2	10	184072	184081	20 %	0 %	40 %	40 %	436839899
3043	NC_020055	TTG	2	6	184094	184099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839899
3044	NC_020055	ATTT	2	8	184128	184135	25 %	75 %	0 %	0 %	436839899
3045	NC_020055	GCG	2	6	184273	184278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839899
3046	NC_020055	CTTT	2	8	184287	184294	0 %	75 %	0 %	25 %	436839899
3047	NC_020055	TTG	2	6	184307	184312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839899
3048	NC_020055	TTC	2	6	184480	184485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839899
3049	NC_020055	AAG	2	6	184487	184492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839899
3050	NC_020055	TGAA	2	8	184528	184535	50 %	25 %	25 %	0 %	436839899
3051	NC_020055	CAA	2	6	184566	184571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839899
3052	NC_020055	GTC	2	6	184719	184724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839900
3053	NC_020055	AAT	2	6	184758	184763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839900
3054	NC_020055	TTC	2	6	184780	184785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839900
3055	NC_020055	T	6	6	184805	184810	0 %	100 %	0 %	0 %	436839900
3056	NC_020055	ATC	2	6	184831	184836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839900
3057	NC_020055	CCA	2	6	184911	184916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436839900
3058	NC_020055	AGGT	2	8	185059	185066	25 %	25 %	50 %	0 %	436839900
3059	NC_020055	GAT	2	6	185100	185105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839900
3060	NC_020055	GCA	2	6	185108	185113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839900
3061	NC_020055	CAG	2	6	185254	185259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839900
3062	NC_020055	TCA	2	6	185386	185391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839900
3063	NC_020055	AAT	2	6	185402	185407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839900
3064	NC_020055	TGC	2	6	185554	185559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839900
3065	NC_020055	AAG	2	6	185566	185571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839900
3066	NC_020055	ATT	2	6	185613	185618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839900
3067	NC_020055	TCA	2	6	185716	185721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839900
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3069	NC_020055	GCA	2	6	185771	185776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839900
3070	NC_020055	GTT	2	6	185785	185790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839900
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3072	NC_020055	TTG	2	6	185798	185803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436839900
3073	NC_020055	GAA	2	6	185903	185908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839900
3074	NC_020055	AAT	2	6	185922	185927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839900
3075	NC_020055	AG	3	6	185973	185978	50 %	0 %	50 %	0 %	436839900
3076	NC_020055	TCA	2	6	186007	186012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839900
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3078	NC_020055	GGC	2	6	186247	186252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436839900
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3080	NC_020055	GTC	2	6	186402	186407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839900
3081	NC_020055	GTG	2	6	186481	186486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839900
3082	NC_020055	CAG	2	6	186561	186566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839900
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3085	NC_020055	CAG	2	6	186792	186797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839900
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3087	NC_020055	T	6	6	186860	186865	0 %	100 %	0 %	0 %	436839900
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3089	NC_020055	GGA	2	6	186946	186951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839900
3090	NC_020055	TCA	3	9	187069	187077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436839900
3091	NC_020055	GGT	2	6	187093	187098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436839900
3092	NC_020055	AGG	2	6	187114	187119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839900
3093	NC_020055	CAGCC	2	10	187260	187269	20 %	0 %	20 %	60 %	436839900
3094	NC_020055	ACCA	2	8	187320	187327	50 %	0 %	0 %	50 %	436839900
3095	NC_020055	GAT	2	6	187368	187373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839900
3096	NC_020055	TTTGT	2	10	187416	187425	0 %	80 %	20 %	0 %	436839900
3097	NC_020055	A	6	6	187435	187440	100 %	0 %	0 %	0 %	436839900
3098	NC_020055	TAATG	2	10	187481	187490	40 %	40 %	20 %	0 %	436839900
3099	NC_020055	GCC	2	6	187541	187546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436839900
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3101	NC_020055	AGT	2	6	187600	187605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839900
3102	NC_020055	GCA	2	6	187612	187617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839900
3103	NC_020055	AAT	2	6	187664	187669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839900
3104	NC_020055	TTC	2	6	187680	187685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839900
3105	NC_020055	GTC	2	6	187725	187730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839900
3106	NC_020055	T	6	6	187770	187775	0 %	100 %	0 %	0 %	436839900
3107	NC_020055	GTGC	2	8	187813	187820	0 %	25 %	50 %	25 %	436839900
3108	NC_020055	TTC	2	6	187887	187892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839900
3109	NC_020055	T	7	7	188116	188122	0 %	100 %	0 %	0 %	436839901
3110	NC_020055	A	7	7	188124	188130	100 %	0 %	0 %	0 %	436839901
3111	NC_020055	TAA	2	6	188163	188168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436839901
3112	NC_020055	AGG	2	6	188217	188222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839901
3113	NC_020055	CTT	3	9	188241	188249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436839901
3114	NC_020055	ACAG	2	8	188342	188349	50 %	0 %	25 %	25 %	436839901
3115	NC_020055	TC	3	6	188384	188389	0 %	50 %	0 %	50 %	436839901
3116	NC_020055	ACA	2	6	188397	188402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436839901
3117	NC_020055	AGC	2	6	188425	188430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436839901
3118	NC_020055	TTTAAA	2	12	188465	188476	50 %	50 %	0 %	0 %	436839901
3119	NC_020055	ATG	2	6	188546	188551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839901
3120	NC_020055	T	6	6	188587	188592	0 %	100 %	0 %	0 %	436839901
3121	NC_020055	ATG	2	6	188814	188819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839901
3122	NC_020055	ATT	2	6	188820	188825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839901
3123	NC_020055	TGA	2	6	188845	188850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839901
3124	NC_020055	ATTA	2	8	189074	189081	50 %	50 %	0 %	0 %	436839901
3125	NC_020055	AGA	2	6	189094	189099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436839901
3126	NC_020055	CTG	2	6	189116	189121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436839901
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3130	NC_020055	GGGAT	2	10	189255	189264	20 %	20 %	60 %	0 %	436839901
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3232	NC_020055	GAT	2	6	195379	195384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839907
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3234	NC_020055	TCCG	2	8	195474	195481	0 %	25 %	25 %	50 %	436839907
3235	NC_020055	TAT	2	6	195510	195515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839907
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3243	NC_020055	GAG	2	6	195919	195924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436839907
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3251	NC_020055	T	6	6	196294	196299	0 %	100 %	0 %	0 %	436839907
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3262	NC_020055	CATC	2	8	197225	197232	25 %	25 %	0 %	50 %	436839907
3263	NC_020055	TGGTAC	2	12	197264	197275	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	436839907
3264	NC_020055	TGA	2	6	197318	197323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839907
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3271	NC_020055	TAT	2	6	197532	197537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436839907
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3490	NC_020055	TGA	2	6	210271	210276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839917
3491	NC_020055	TGA	2	6	210325	210330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436839917
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