MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio hydrothermalis AM13 = DSM 14728 chromosome

Total Repeats: 62685

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020055	AACAG	2	10	299509	299518	60 %	0 %	20 %	20 %	436840034
5002	NC_020055	TCA	2	6	299549	299554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840034
5003	NC_020055	TTG	2	6	299596	299601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840034
5004	NC_020055	GCA	2	6	299636	299641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840034
5005	NC_020055	AT	3	6	299663	299668	50 %	50 %	0 %	0 %	436840034
5006	NC_020055	TGT	2	6	299775	299780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840034
5007	NC_020055	GTA	2	6	299882	299887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840034
5008	NC_020055	CTT	2	6	299907	299912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840034
5009	NC_020055	CAC	2	6	299961	299966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840034
5010	NC_020055	AGA	2	6	300034	300039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840034
5011	NC_020055	GT	3	6	300138	300143	0 %	50 %	50 %	0 %	436840034
5012	NC_020055	AGAA	2	8	300286	300293	75 %	0 %	25 %	0 %	436840035
5013	NC_020055	T	6	6	300340	300345	0 %	100 %	0 %	0 %	436840035
5014	NC_020055	T	7	7	300385	300391	0 %	100 %	0 %	0 %	436840035
5015	NC_020055	CAAT	2	8	300414	300421	50 %	25 %	0 %	25 %	436840035
5016	NC_020055	CGC	2	6	300488	300493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840035
5017	NC_020055	TTG	2	6	300535	300540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840035
5018	NC_020055	TG	4	8	300547	300554	0 %	50 %	50 %	0 %	436840035
5019	NC_020055	AAT	3	9	300608	300616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840035
5020	NC_020055	A	6	6	300638	300643	100 %	0 %	0 %	0 %	436840035
5021	NC_020055	ATCC	2	8	300704	300711	25 %	25 %	0 %	50 %	436840035
5022	NC_020055	ATCA	2	8	300806	300813	50 %	25 %	0 %	25 %	436840035
5023	NC_020055	GAA	2	6	300865	300870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840035
5024	NC_020055	AGT	2	6	300915	300920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840035
5025	NC_020055	T	6	6	300933	300938	0 %	100 %	0 %	0 %	436840035
5026	NC_020055	TTC	2	6	301007	301012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840035
5027	NC_020055	ATGTC	2	10	301047	301056	20 %	40 %	20 %	20 %	436840035
5028	NC_020055	AAT	2	6	301264	301269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840036
5029	NC_020055	GCA	2	6	301306	301311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840036
5030	NC_020055	TCCAA	2	10	301354	301363	40 %	20 %	0 %	40 %	436840036
5031	NC_020055	AG	3	6	301364	301369	50 %	0 %	50 %	0 %	436840036
5032	NC_020055	CT	3	6	301426	301431	0 %	50 %	0 %	50 %	436840036
5033	NC_020055	TCTA	2	8	301438	301445	25 %	50 %	0 %	25 %	436840036
5034	NC_020055	TAT	2	6	301446	301451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840036
5035	NC_020055	ATTT	2	8	301492	301499	25 %	75 %	0 %	0 %	436840036
5036	NC_020055	AAT	2	6	301513	301518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840036
5037	NC_020055	ATT	2	6	301582	301587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840036
5038	NC_020055	AAT	2	6	301624	301629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840036
5039	NC_020055	TA	3	6	301717	301722	50 %	50 %	0 %	0 %	436840036
5040	NC_020055	CA	3	6	301770	301775	50 %	0 %	0 %	50 %	436840036
5041	NC_020055	A	6	6	301958	301963	100 %	0 %	0 %	0 %	436840036
5042	NC_020055	AT	3	6	302055	302060	50 %	50 %	0 %	0 %	436840036
5043	NC_020055	ATT	2	6	302115	302120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840037
5044	NC_020055	T	8	8	302156	302163	0 %	100 %	0 %	0 %	436840037
5045	NC_020055	T	6	6	302242	302247	0 %	100 %	0 %	0 %	436840037
5046	NC_020055	AACAAA	2	12	302262	302273	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	436840037
5047	NC_020055	A	6	6	302415	302420	100 %	0 %	0 %	0 %	436840037
5048	NC_020055	GTT	2	6	302520	302525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840037
5049	NC_020055	GGCA	2	8	302580	302587	25 %	0 %	50 %	25 %	436840037
5050	NC_020055	TCA	2	6	302602	302607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840037
5051	NC_020055	ACA	2	6	302608	302613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840037
5052	NC_020055	GGT	2	6	302674	302679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840037
5053	NC_020055	GGA	2	6	302738	302743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436840037
5054	NC_020055	AAT	2	6	302857	302862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	436840037
5055	NC_020055	TATC	2	8	302897	302904	25 %	50 %	0 %	25 %	436840037
5056	NC_020055	TCT	2	6	302935	302940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840037
5057	NC_020055	CAAC	2	8	302945	302952	50 %	0 %	0 %	50 %	436840037
5058	NC_020055	A	7	7	302974	302980	100 %	0 %	0 %	0 %	436840037
5059	NC_020055	AAGG	2	8	303008	303015	50 %	0 %	50 %	0 %	436840037
5060	NC_020055	TCT	2	6	303031	303036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840037
5061	NC_020055	ACAA	2	8	303096	303103	75 %	0 %	0 %	25 %	436840037
5062	NC_020055	TA	3	6	303134	303139	50 %	50 %	0 %	0 %	436840037
5063	NC_020055	T	7	7	303195	303201	0 %	100 %	0 %	0 %	436840037
5064	NC_020055	ATC	2	6	303222	303227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840037
5065	NC_020055	TA	4	8	303267	303274	50 %	50 %	0 %	0 %	436840037
5066	NC_020055	TCA	2	6	303292	303297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840037
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5070	NC_020055	TCA	2	6	303626	303631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840037
5071	NC_020055	T	6	6	303729	303734	0 %	100 %	0 %	0 %	436840038
5072	NC_020055	ATTG	2	8	303785	303792	25 %	50 %	25 %	0 %	436840038
5073	NC_020055	GATTT	2	10	303831	303840	20 %	60 %	20 %	0 %	436840038
5074	NC_020055	TTCT	2	8	303874	303881	0 %	75 %	0 %	25 %	436840038
5075	NC_020055	AAC	2	6	303903	303908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840038
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5077	NC_020055	GAA	2	6	304182	304187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840038
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5079	NC_020055	T	7	7	304262	304268	0 %	100 %	0 %	0 %	436840038
5080	NC_020055	TTC	2	6	304334	304339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840038
5081	NC_020055	ATC	2	6	304343	304348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840038
5082	NC_020055	GAA	2	6	304351	304356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840038
5083	NC_020055	AATA	2	8	304358	304365	75 %	25 %	0 %	0 %	436840038
5084	NC_020055	TTG	2	6	304374	304379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840038
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5087	NC_020055	T	6	6	304470	304475	0 %	100 %	0 %	0 %	436840038
5088	NC_020055	CAA	2	6	304483	304488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840038
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5090	NC_020055	ATT	2	6	304532	304537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840038
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5092	NC_020055	TTC	2	6	304569	304574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840039
5093	NC_020055	TAT	2	6	304608	304613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840039
5094	NC_020055	ATC	2	6	304668	304673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840039
5095	NC_020055	TC	3	6	304715	304720	0 %	50 %	0 %	50 %	436840039
5096	NC_020055	GCT	2	6	304765	304770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840039
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5103	NC_020055	AAC	2	6	305089	305094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	436840039
5104	NC_020055	ATC	2	6	305152	305157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840039
5105	NC_020055	TTG	2	6	305187	305192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840039
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5107	NC_020055	AATCT	2	10	305376	305385	40 %	40 %	0 %	20 %	436840040
5108	NC_020055	AATG	2	8	305454	305461	50 %	25 %	25 %	0 %	436840040
5109	NC_020055	CTG	2	6	305497	305502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840040
5110	NC_020055	T	6	6	305527	305532	0 %	100 %	0 %	0 %	436840040
5111	NC_020055	TTC	2	6	305627	305632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840041
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5113	NC_020055	GTT	2	6	305706	305711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840041
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5115	NC_020055	CAG	2	6	305737	305742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840041
5116	NC_020055	AT	3	6	305760	305765	50 %	50 %	0 %	0 %	436840041
5117	NC_020055	T	6	6	305884	305889	0 %	100 %	0 %	0 %	436840042
5118	NC_020055	AATT	2	8	305938	305945	50 %	50 %	0 %	0 %	436840042
5119	NC_020055	CCA	2	6	305946	305951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840042
5120	NC_020055	GCA	2	6	306035	306040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840042
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5122	NC_020055	TGA	2	6	306129	306134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840042
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5124	NC_020055	GTT	2	6	306182	306187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840042
5125	NC_020055	GAA	2	6	306381	306386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840042
5126	NC_020055	TCA	2	6	306455	306460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840042
5127	NC_020055	TGT	2	6	306468	306473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840042
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5131	NC_020055	CAT	2	6	306684	306689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840042
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5137	NC_020055	T	6	6	306982	306987	0 %	100 %	0 %	0 %	436840042
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5143	NC_020055	TCT	2	6	307211	307216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840042
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5145	NC_020055	CTGG	2	8	307543	307550	0 %	25 %	50 %	25 %	436840042
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5154	NC_020055	TCCAA	2	10	307817	307826	40 %	20 %	0 %	40 %	436840042
5155	NC_020055	GCCA	2	8	307838	307845	25 %	0 %	25 %	50 %	436840042
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5224	NC_020055	TGA	2	6	311959	311964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840045
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5227	NC_020055	CACCTT	2	12	312264	312275	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	436840045
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5229	NC_020055	TCTT	2	8	312382	312389	0 %	75 %	0 %	25 %	436840045
5230	NC_020055	CCG	2	6	312407	312412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840045
5231	NC_020055	CTT	2	6	312531	312536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840045
5232	NC_020055	CGA	2	6	312557	312562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840045
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5235	NC_020055	GA	3	6	312768	312773	50 %	0 %	50 %	0 %	436840045
5236	NC_020055	GCT	2	6	312807	312812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840045
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5238	NC_020055	AGC	2	6	312892	312897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840045
5239	NC_020055	TTGG	2	8	312901	312908	0 %	50 %	50 %	0 %	436840045
5240	NC_020055	GCT	2	6	312927	312932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840045
5241	NC_020055	CTT	2	6	312951	312956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840045
5242	NC_020055	CGG	2	6	312983	312988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840045
5243	NC_020055	TC	3	6	313040	313045	0 %	50 %	0 %	50 %	436840045
5244	NC_020055	CAT	2	6	313050	313055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840045
5245	NC_020055	TAT	2	6	313086	313091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840045
5246	NC_020055	CAC	2	6	313145	313150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840046
5247	NC_020055	T	6	6	313179	313184	0 %	100 %	0 %	0 %	436840046
5248	NC_020055	CATGC	2	10	313218	313227	20 %	20 %	20 %	40 %	436840046
5249	NC_020055	TATC	2	8	313229	313236	25 %	50 %	0 %	25 %	436840046
5250	NC_020055	ATTT	2	8	313305	313312	25 %	75 %	0 %	0 %	436840046
5251	NC_020055	TAT	2	6	313482	313487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840047
5252	NC_020055	CCG	2	6	313595	313600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840047
5253	NC_020055	TGC	2	6	313606	313611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840047
5254	NC_020055	GGC	2	6	313647	313652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840047
5255	NC_020055	TCA	2	6	313678	313683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840047
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5258	NC_020055	GACA	2	8	314019	314026	50 %	0 %	25 %	25 %	436840048
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5260	NC_020055	TTG	2	6	314207	314212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840048
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5262	NC_020055	GTT	2	6	314470	314475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840048
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5265	NC_020055	TG	3	6	314589	314594	0 %	50 %	50 %	0 %	436840048
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5269	NC_020055	T	6	6	314740	314745	0 %	100 %	0 %	0 %	436840048
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5272	NC_020055	CAT	2	6	314825	314830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840049
5273	NC_020055	CCA	2	6	314843	314848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840049
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5302	NC_020055	TCG	2	6	316673	316678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840053
5303	NC_020055	TCA	2	6	316712	316717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840053
5304	NC_020055	CGT	2	6	316764	316769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840053
5305	NC_020055	TGG	2	6	316827	316832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840053
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5343	NC_020055	CCAC	2	8	319166	319173	25 %	0 %	0 %	75 %	436840053
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5349	NC_020055	AGC	2	6	319519	319524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840053
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5351	NC_020055	GAA	2	6	319550	319555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840053
5352	NC_020055	CAG	2	6	319585	319590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840053
5353	NC_020055	CAC	2	6	319669	319674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840053
5354	NC_020055	ATT	2	6	319690	319695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840053
5355	NC_020055	TGG	2	6	319854	319859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840053
5356	NC_020055	ATC	2	6	319919	319924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840053
5357	NC_020055	CAG	2	6	320062	320067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840053
5358	NC_020055	TGG	2	6	320106	320111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840053
5359	NC_020055	TGA	2	6	320163	320168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840054
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5362	NC_020055	ACCG	2	8	320257	320264	25 %	0 %	25 %	50 %	436840054
5363	NC_020055	TGA	2	6	320276	320281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840054
5364	NC_020055	CGC	2	6	320286	320291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840054
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5366	NC_020055	GCCTCG	2	12	320375	320386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	436840054
5367	NC_020055	GAA	2	6	320395	320400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	436840054
5368	NC_020055	TCT	2	6	320420	320425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840054
5369	NC_020055	ACC	2	6	320453	320458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840054
5370	NC_020055	TCC	2	6	320474	320479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436840054
5371	NC_020055	GTA	2	6	320497	320502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	436840054
5372	NC_020055	CGTT	2	8	320516	320523	0 %	50 %	25 %	25 %	436840054
5373	NC_020055	CCGGTG	2	12	320547	320558	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	436840054
5374	NC_020055	TCTCCG	2	12	320585	320596	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	436840054
5375	NC_020055	TTC	2	6	320717	320722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	436840055
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5377	NC_020055	CAG	2	6	320758	320763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840055
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5382	NC_020055	CTG	2	6	320903	320908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840055
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5384	NC_020055	TGT	2	6	320941	320946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	436840055
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5393	NC_020055	CCG	3	9	321462	321470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840057
5394	NC_020055	ATCTGC	2	12	321477	321488	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	436840057
5395	NC_020055	TCAG	2	8	321531	321538	25 %	25 %	25 %	25 %	436840057
5396	NC_020055	TCA	2	6	321558	321563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	436840057
5397	NC_020055	GCG	2	6	321570	321575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	436840057
5398	NC_020055	TCTGT	2	10	321679	321688	0 %	60 %	20 %	20 %	436840057
5399	NC_020055	CTG	2	6	321746	321751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840057
5400	NC_020055	T	6	6	321854	321859	0 %	100 %	0 %	0 %	436840057
5401	NC_020055	CTC	2	6	321881	321886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436840057
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5403	NC_020055	GCA	2	6	321903	321908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840057
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5409	NC_020055	ATT	2	6	322250	322255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	436840057
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5470	NC_020055	TCG	2	6	325921	325926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840063
5471	NC_020055	GGA	2	6	325948	325953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436840063
5472	NC_020055	GTGA	2	8	325959	325966	25 %	25 %	50 %	0 %	436840063
5473	NC_020055	CTG	2	6	325971	325976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	436840064
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5476	NC_020055	CGGA	2	8	326117	326124	25 %	0 %	50 %	25 %	436840064
5477	NC_020055	GGT	2	6	326149	326154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840064
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5481	NC_020055	CCG	2	6	326358	326363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	436840064
5482	NC_020055	GGA	2	6	326404	326409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	436840064
5483	NC_020055	AGC	2	6	326505	326510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840064
5484	NC_020055	TGAG	2	8	326541	326548	25 %	25 %	50 %	0 %	436840064
5485	NC_020055	TGG	2	6	326644	326649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	436840064
5486	NC_020055	CCA	2	6	326802	326807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	436840064
5487	NC_020055	CTC	2	6	326819	326824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	436840064
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5489	NC_020055	GAC	2	6	326942	326947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	436840064
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