MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 chromosome

Total Repeats: 2641

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019793	GAACA	2	10	925	934	60 %	0 %	20 %	20 %	429217737
2	NC_019793	GGCGT	2	10	4056	4065	0 %	20 %	60 %	20 %	429217740
3	NC_019793	GGACA	2	10	5880	5889	40 %	0 %	40 %	20 %	429217740
4	NC_019793	GATTC	2	10	6587	6596	20 %	40 %	20 %	20 %	429217741
5	NC_019793	GCGCC	2	10	7288	7297	0 %	0 %	40 %	60 %	429217741
6	NC_019793	GCCGG	2	10	7308	7317	0 %	0 %	60 %	40 %	429217741
7	NC_019793	GCCCG	2	10	8469	8478	0 %	0 %	40 %	60 %	429217742
8	NC_019793	TGACG	2	10	11258	11267	20 %	20 %	40 %	20 %	429217744
9	NC_019793	TCACC	2	10	11989	11998	20 %	20 %	0 %	60 %	429217745
10	NC_019793	CGTGG	2	10	12808	12817	0 %	20 %	60 %	20 %	429217746
11	NC_019793	CGGGC	2	10	14028	14037	0 %	0 %	60 %	40 %	429217747
12	NC_019793	GCCGC	2	10	14976	14985	0 %	0 %	40 %	60 %	429217747
13	NC_019793	CGGTC	2	10	18550	18559	0 %	20 %	40 %	40 %	429217750
14	NC_019793	CCGTC	2	10	19505	19514	0 %	20 %	20 %	60 %	429217752
15	NC_019793	GGCGG	2	10	19784	19793	0 %	0 %	80 %	20 %	429217752
16	NC_019793	GGTGT	2	10	22486	22495	0 %	40 %	60 %	0 %	429217754
17	NC_019793	CGGGT	2	10	22786	22795	0 %	20 %	60 %	20 %	429217754
18	NC_019793	TGGTC	2	10	23055	23064	0 %	40 %	40 %	20 %	429217754
19	NC_019793	ACGCG	2	10	23500	23509	20 %	0 %	40 %	40 %	429217754
20	NC_019793	CAGCG	2	10	24501	24510	20 %	0 %	40 %	40 %	429217755
21	NC_019793	GCGGA	2	10	24851	24860	20 %	0 %	60 %	20 %	429217755
22	NC_019793	TGGCG	2	10	25816	25825	0 %	20 %	60 %	20 %	429217756
23	NC_019793	CCGCG	2	10	27655	27664	0 %	0 %	40 %	60 %	429217757
24	NC_019793	GAACT	2	10	27748	27757	40 %	20 %	20 %	20 %	429217757
25	NC_019793	ACCGA	2	10	28180	28189	40 %	0 %	20 %	40 %	429217757
26	NC_019793	CTCGG	2	10	28229	28238	0 %	20 %	40 %	40 %	429217757
27	NC_019793	CCCTC	2	10	30041	30050	0 %	20 %	0 %	80 %	429217760
28	NC_019793	CCGGC	2	10	33283	33292	0 %	0 %	40 %	60 %	429217763
29	NC_019793	AGGAC	2	10	35487	35496	40 %	0 %	40 %	20 %	429217764
30	NC_019793	TGCGG	2	10	38482	38491	0 %	20 %	60 %	20 %	429217765
31	NC_019793	CGCGG	2	10	38935	38944	0 %	0 %	60 %	40 %	429217765
32	NC_019793	GCGCG	2	10	41603	41612	0 %	0 %	60 %	40 %	429217767
33	NC_019793	CGGAG	2	10	43430	43439	20 %	0 %	60 %	20 %	429217768
34	NC_019793	GGTGT	2	10	44286	44295	0 %	40 %	60 %	0 %	429217769
35	NC_019793	GGCCC	2	10	46480	46489	0 %	0 %	40 %	60 %	429217770
36	NC_019793	GGCAG	2	10	47380	47389	20 %	0 %	60 %	20 %	429217771
37	NC_019793	AGCTG	2	10	48902	48911	20 %	20 %	40 %	20 %	429217771
38	NC_019793	GACCT	2	10	49091	49100	20 %	20 %	20 %	40 %	429217772
39	NC_019793	CGGGT	2	10	49436	49445	0 %	20 %	60 %	20 %	429217772
40	NC_019793	GGCGT	2	10	51027	51036	0 %	20 %	60 %	20 %	429217772
41	NC_019793	CGAGT	2	10	52393	52402	20 %	20 %	40 %	20 %	429217773
42	NC_019793	CGTGC	2	10	53615	53624	0 %	20 %	40 %	40 %	429217774
43	NC_019793	GCCCG	2	10	54251	54260	0 %	0 %	40 %	60 %	429217774
44	NC_019793	GGGGT	2	10	57226	57235	0 %	20 %	80 %	0 %	429217777
45	NC_019793	ACCGC	2	10	57894	57903	20 %	0 %	20 %	60 %	429217778
46	NC_019793	GTCGC	2	10	58337	58346	0 %	20 %	40 %	40 %	429217779
47	NC_019793	CCTCG	2	10	58662	58671	0 %	20 %	20 %	60 %	429217779
48	NC_019793	GATCA	2	10	63297	63306	40 %	20 %	20 %	20 %	429217782
49	NC_019793	GCCCT	2	10	63495	63504	0 %	20 %	20 %	60 %	429217782
50	NC_019793	ACGCG	2	10	64343	64352	20 %	0 %	40 %	40 %	429217782
51	NC_019793	TTCCC	2	10	64592	64601	0 %	40 %	0 %	60 %	429217783
52	NC_019793	GCGAC	2	10	69554	69563	20 %	0 %	40 %	40 %	429217786
53	NC_019793	AGCGC	2	10	73118	73127	20 %	0 %	40 %	40 %	429217790
54	NC_019793	CGGCG	2	10	73221	73230	0 %	0 %	60 %	40 %	429217790
55	NC_019793	ACGTG	2	10	73900	73909	20 %	20 %	40 %	20 %	429217791
56	NC_019793	TCACC	2	10	76805	76814	20 %	20 %	0 %	60 %	429217792
57	NC_019793	GGTCC	2	10	77396	77405	0 %	20 %	40 %	40 %	429217792
58	NC_019793	GACCT	2	10	80820	80829	20 %	20 %	20 %	40 %	429217794
59	NC_019793	CCCTA	2	10	82828	82837	20 %	20 %	0 %	60 %	429217794
60	NC_019793	CACCG	2	10	83223	83232	20 %	0 %	20 %	60 %	429217794
61	NC_019793	GAACG	2	10	85502	85511	40 %	0 %	40 %	20 %	429217797
62	NC_019793	GGCCA	2	10	85559	85568	20 %	0 %	40 %	40 %	429217797
63	NC_019793	CCTGC	2	10	86223	86232	0 %	20 %	20 %	60 %	429217797
64	NC_019793	CGGAC	2	10	89708	89717	20 %	0 %	40 %	40 %	429217802
65	NC_019793	ACAGC	2	10	90227	90236	40 %	0 %	20 %	40 %	429217802
66	NC_019793	GACCA	2	10	93198	93207	40 %	0 %	20 %	40 %	429217802
67	NC_019793	TGAAC	2	10	93866	93875	40 %	20 %	20 %	20 %	429217802
68	NC_019793	TCCGG	2	10	94424	94433	0 %	20 %	40 %	40 %	429217803
69	NC_019793	GCGTG	2	10	94765	94774	0 %	20 %	60 %	20 %	429217803
70	NC_019793	GTGCG	2	10	97033	97042	0 %	20 %	60 %	20 %	429217805
71	NC_019793	GCGCG	2	10	97069	97078	0 %	0 %	60 %	40 %	429217805
72	NC_019793	TCGCG	2	10	97580	97589	0 %	20 %	40 %	40 %	429217805
73	NC_019793	CGCTC	2	10	99177	99186	0 %	20 %	20 %	60 %	429217807
74	NC_019793	GAAAA	2	10	99307	99316	80 %	0 %	20 %	0 %	429217808
75	NC_019793	GGCGG	2	10	101874	101883	0 %	0 %	80 %	20 %	429217810
76	NC_019793	CGCGG	2	10	102463	102472	0 %	0 %	60 %	40 %	429217811
77	NC_019793	AAGTG	2	10	105088	105097	40 %	20 %	40 %	0 %	429217812
78	NC_019793	CGGCG	2	10	105608	105617	0 %	0 %	60 %	40 %	429217813
79	NC_019793	GCGCG	2	10	105738	105747	0 %	0 %	60 %	40 %	429217813
80	NC_019793	CAGGG	2	10	110133	110142	20 %	0 %	60 %	20 %	429217817
81	NC_019793	GTGCA	2	10	110268	110277	20 %	20 %	40 %	20 %	429217817
82	NC_019793	GCGTG	2	10	110761	110770	0 %	20 %	60 %	20 %	429217817
83	NC_019793	CTGGA	2	10	111744	111753	20 %	20 %	40 %	20 %	429217818
84	NC_019793	GAAGT	2	10	113307	113316	40 %	20 %	40 %	0 %	429217819
85	NC_019793	GCCGC	2	10	115863	115872	0 %	0 %	40 %	60 %	429217821
86	NC_019793	CGGGT	2	10	117334	117343	0 %	20 %	60 %	20 %	429217822
87	NC_019793	GCGCC	2	10	117689	117698	0 %	0 %	40 %	60 %	429217822
88	NC_019793	TCCGG	2	10	117716	117725	0 %	20 %	40 %	40 %	429217822
89	NC_019793	CCTGA	2	10	117935	117944	20 %	20 %	20 %	40 %	429217822
90	NC_019793	CGGCG	2	10	119260	119269	0 %	0 %	60 %	40 %	429217823
91	NC_019793	CACGT	2	10	120739	120748	20 %	20 %	20 %	40 %	429217824
92	NC_019793	GCGCT	2	10	122713	122722	0 %	20 %	40 %	40 %	429217825
93	NC_019793	ACCTG	2	10	123052	123061	20 %	20 %	20 %	40 %	429217825
94	NC_019793	CGATC	2	10	123783	123792	20 %	20 %	20 %	40 %	429217825
95	NC_019793	GCTGA	2	10	124400	124409	20 %	20 %	40 %	20 %	429217826
96	NC_019793	GAACA	2	10	126830	126839	60 %	0 %	20 %	20 %	429217829
97	NC_019793	ACGCG	2	10	126892	126901	20 %	0 %	40 %	40 %	429217829
98	NC_019793	CCCAC	2	10	126935	126944	20 %	0 %	0 %	80 %	429217829
99	NC_019793	ACCAC	2	10	127046	127055	40 %	0 %	0 %	60 %	429217829
100	NC_019793	CGATC	2	10	128503	128512	20 %	20 %	20 %	40 %	429217830
101	NC_019793	AGCGC	2	10	128803	128812	20 %	0 %	40 %	40 %	429217830
102	NC_019793	GCCCG	2	10	132552	132561	0 %	0 %	40 %	60 %	429217834
103	NC_019793	CGGCG	2	10	132995	133004	0 %	0 %	60 %	40 %	429217835
104	NC_019793	GGGAA	2	10	133510	133519	40 %	0 %	60 %	0 %	429217835
105	NC_019793	GGCCG	2	10	135024	135033	0 %	0 %	60 %	40 %	429217835
106	NC_019793	CGTTC	2	10	135873	135882	0 %	40 %	20 %	40 %	429217835
107	NC_019793	GGACT	2	10	136965	136974	20 %	20 %	40 %	20 %	429217836
108	NC_019793	CCGGT	2	10	137448	137457	0 %	20 %	40 %	40 %	429217837
109	NC_019793	GCTTC	2	10	137651	137660	0 %	40 %	20 %	40 %	429217837
110	NC_019793	AGTCG	2	10	141768	141777	20 %	20 %	40 %	20 %	429217839
111	NC_019793	TGCCG	2	10	143363	143372	0 %	20 %	40 %	40 %	429217841
112	NC_019793	GGCGT	2	10	148167	148176	0 %	20 %	60 %	20 %	429217844
113	NC_019793	GCTGC	2	10	149233	149242	0 %	20 %	40 %	40 %	429217845
114	NC_019793	GTTTC	2	10	149421	149430	0 %	60 %	20 %	20 %	429217845
115	NC_019793	CGACC	2	10	152247	152256	20 %	0 %	20 %	60 %	429217847
116	NC_019793	TGGCA	2	10	152257	152266	20 %	20 %	40 %	20 %	429217847
117	NC_019793	CGGGC	2	10	152397	152406	0 %	0 %	60 %	40 %	429217847
118	NC_019793	CGCAC	2	10	152761	152770	20 %	0 %	20 %	60 %	429217848
119	NC_019793	CCCCA	2	10	153378	153387	20 %	0 %	0 %	80 %	429217849
120	NC_019793	AGCGC	2	10	153622	153631	20 %	0 %	40 %	40 %	429217850
121	NC_019793	GTCGA	2	10	158494	158503	20 %	20 %	40 %	20 %	429217854
122	NC_019793	GCCCG	2	10	159721	159730	0 %	0 %	40 %	60 %	429217855
123	NC_019793	ACCCC	2	10	159810	159819	20 %	0 %	0 %	80 %	429217855
124	NC_019793	CAGCG	2	10	161862	161871	20 %	0 %	40 %	40 %	429217858
125	NC_019793	TTCGC	2	10	162243	162252	0 %	40 %	20 %	40 %	429217858
126	NC_019793	TCGCT	2	10	162432	162441	0 %	40 %	20 %	40 %	429217858
127	NC_019793	CTCGC	2	10	162756	162765	0 %	20 %	20 %	60 %	429217858
128	NC_019793	GCGCC	2	10	163098	163107	0 %	0 %	40 %	60 %	429217859
129	NC_019793	TCAGG	2	10	165012	165021	20 %	20 %	40 %	20 %	429217861
130	NC_019793	GCGCC	2	10	165264	165273	0 %	0 %	40 %	60 %	429217861
131	NC_019793	GAGGC	2	10	166936	166945	20 %	0 %	60 %	20 %	429217863
132	NC_019793	CGCAA	2	10	169050	169059	40 %	0 %	20 %	40 %	429217865
133	NC_019793	CGCGC	2	10	169447	169456	0 %	0 %	40 %	60 %	429217865
134	NC_019793	GTCTC	2	10	170352	170361	0 %	40 %	20 %	40 %	429217865
135	NC_019793	TGCAG	2	10	170623	170632	20 %	20 %	40 %	20 %	429217865
136	NC_019793	CGCTC	2	10	171059	171068	0 %	20 %	20 %	60 %	429217866
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146	NC_019793	GGCAC	2	10	195470	195479	20 %	0 %	40 %	40 %	429217885
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156	NC_019793	CTCGA	2	10	216901	216910	20 %	20 %	20 %	40 %	429217904
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174	NC_019793	GGCGT	2	10	243713	243722	0 %	20 %	60 %	20 %	429217933
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177	NC_019793	CAGCT	2	10	245062	245071	20 %	20 %	20 %	40 %	429217934
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245	NC_019793	GCCGG	2	10	338676	338685	0 %	0 %	60 %	40 %	429218023
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248	NC_019793	CGGAC	2	10	343036	343045	20 %	0 %	40 %	40 %	429218027
249	NC_019793	GCGCG	2	10	344285	344294	0 %	0 %	60 %	40 %	429218027
250	NC_019793	CCTGA	2	10	346620	346629	20 %	20 %	20 %	40 %	429218030
251	NC_019793	GCGTG	2	10	350698	350707	0 %	20 %	60 %	20 %	429218033
252	NC_019793	GCGCA	2	10	351820	351829	20 %	0 %	40 %	40 %	429218034
253	NC_019793	TGGGG	2	10	351926	351935	0 %	20 %	80 %	0 %	429218034
254	NC_019793	ACCGA	2	10	353068	353077	40 %	0 %	20 %	40 %	429218035
255	NC_019793	CGAAA	3	15	353343	353357	60 %	0 %	20 %	20 %	429218035
256	NC_019793	GCCTG	2	10	354379	354388	0 %	20 %	40 %	40 %	429218037
257	NC_019793	CACTG	2	10	357333	357342	20 %	20 %	20 %	40 %	429218040
258	NC_019793	CTGCG	2	10	359978	359987	0 %	20 %	40 %	40 %	429218044
259	NC_019793	GTGAG	2	10	360491	360500	20 %	20 %	60 %	0 %	429218044
260	NC_019793	TGCCC	2	10	360927	360936	0 %	20 %	20 %	60 %	429218045
261	NC_019793	CGCGG	2	10	361982	361991	0 %	0 %	60 %	40 %	429218046
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382	NC_019793	CGGCA	2	10	517025	517034	20 %	0 %	40 %	40 %	429218222
383	NC_019793	TGGGA	2	10	520745	520754	20 %	20 %	60 %	0 %	429218227
384	NC_019793	GACCT	2	10	521528	521537	20 %	20 %	20 %	40 %	429218228
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386	NC_019793	GCACC	2	10	524466	524475	20 %	0 %	20 %	60 %	429218232
387	NC_019793	CCGTC	2	10	526432	526441	0 %	20 %	20 %	60 %	429218235
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389	NC_019793	GGGTT	2	10	531059	531068	0 %	40 %	60 %	0 %	429218239
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