MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 plasmid pDEIPE02

Total Repeats: 1298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019790	CGT	2	6	477	482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221854
2	NC_019790	CAG	2	6	484	489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221854
3	NC_019790	GTT	2	6	517	522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429221854
4	NC_019790	GAC	2	6	550	555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221854
5	NC_019790	CACCT	2	10	604	613	20 %	20 %	0 %	60 %	429221854
6	NC_019790	GCT	2	6	696	701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221854
7	NC_019790	GCC	3	9	713	721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221854
8	NC_019790	TCG	2	6	749	754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221854
9	NC_019790	ACG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221854
10	NC_019790	GCT	2	6	773	778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221854
11	NC_019790	GCA	2	6	807	812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221854
12	NC_019790	GTG	2	6	823	828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221854
13	NC_019790	GGA	2	6	843	848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221854
14	NC_019790	TCA	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221854
15	NC_019790	GAA	2	6	874	879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429221854
16	NC_019790	CGTCC	2	10	904	913	0 %	20 %	20 %	60 %	429221854
17	NC_019790	GC	3	6	947	952	0 %	0 %	50 %	50 %	429221854
18	NC_019790	ACTC	2	8	1323	1330	25 %	25 %	0 %	50 %	429221855
19	NC_019790	GGT	2	6	1741	1746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221855
20	NC_019790	TCA	2	6	1809	1814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221855
21	NC_019790	CGC	2	6	1818	1823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221855
22	NC_019790	GCGCA	2	10	1826	1835	20 %	0 %	40 %	40 %	429221855
23	NC_019790	ATTG	2	8	1881	1888	25 %	50 %	25 %	0 %	429221855
24	NC_019790	CAC	2	6	1903	1908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221855
25	NC_019790	TTC	2	6	1958	1963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221855
26	NC_019790	ACC	2	6	1985	1990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221855
27	NC_019790	GTG	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221855
28	NC_019790	GTC	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221855
29	NC_019790	CAGGA	2	10	2060	2069	40 %	0 %	40 %	20 %	429221855
30	NC_019790	CAGT	2	8	2099	2106	25 %	25 %	25 %	25 %	429221855
31	NC_019790	ATG	2	6	2156	2161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429221855
32	NC_019790	GCT	2	6	2205	2210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221855
33	NC_019790	TCGT	2	8	2218	2225	0 %	50 %	25 %	25 %	429221855
34	NC_019790	TTC	2	6	2236	2241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221855
35	NC_019790	CAT	2	6	2242	2247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221855
36	NC_019790	GGAC	2	8	2277	2284	25 %	0 %	50 %	25 %	429221855
37	NC_019790	CAC	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221855
38	NC_019790	CAG	2	6	2339	2344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221855
39	NC_019790	AGA	2	6	2346	2351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429221855
40	NC_019790	GCA	2	6	2370	2375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221855
41	NC_019790	CTT	2	6	2457	2462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221855
42	NC_019790	GCC	2	6	2470	2475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221855
43	NC_019790	CGG	2	6	2520	2525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221855
44	NC_019790	GCC	2	6	2551	2556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221855
45	NC_019790	CGA	2	6	2613	2618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221855
46	NC_019790	GTT	2	6	2623	2628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429221855
47	NC_019790	ACCGT	2	10	2648	2657	20 %	20 %	20 %	40 %	429221855
48	NC_019790	GCC	2	6	2680	2685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221855
49	NC_019790	TGG	2	6	2715	2720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221855
50	NC_019790	GTGACG	2	12	2729	2740	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	429221855
51	NC_019790	GTG	2	6	2790	2795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221855
52	NC_019790	TGG	2	6	2796	2801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221855
53	NC_019790	AGC	2	6	2819	2824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221855
54	NC_019790	CGG	2	6	2849	2854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221855
55	NC_019790	GGAC	2	8	2856	2863	25 %	0 %	50 %	25 %	429221855
56	NC_019790	TGCC	2	8	3251	3258	0 %	25 %	25 %	50 %	429221856
57	NC_019790	GTCG	2	8	3265	3272	0 %	25 %	50 %	25 %	429221856
58	NC_019790	ACGT	2	8	3296	3303	25 %	25 %	25 %	25 %	429221856
59	NC_019790	CG	4	8	3340	3347	0 %	0 %	50 %	50 %	429221856
60	NC_019790	ACGA	2	8	3350	3357	50 %	0 %	25 %	25 %	429221856
61	NC_019790	CCG	2	6	3358	3363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221856
62	NC_019790	TGGCG	2	10	3417	3426	0 %	20 %	60 %	20 %	429221856
63	NC_019790	CAG	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221856
64	NC_019790	CACG	2	8	3457	3464	25 %	0 %	25 %	50 %	429221856
65	NC_019790	A	6	6	3598	3603	100 %	0 %	0 %	0 %	429221856
66	NC_019790	GCA	2	6	3684	3689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221856
67	NC_019790	CG	3	6	3773	3778	0 %	0 %	50 %	50 %	429221856
68	NC_019790	AGC	2	6	3816	3821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221856
69	NC_019790	ACG	2	6	3824	3829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221856
70	NC_019790	GTT	2	6	3835	3840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429221856
71	NC_019790	CTGGA	2	10	3858	3867	20 %	20 %	40 %	20 %	429221856
72	NC_019790	TCCG	2	8	3889	3896	0 %	25 %	25 %	50 %	429221856
73	NC_019790	ACAT	2	8	3899	3906	50 %	25 %	0 %	25 %	429221856
74	NC_019790	CGCGTA	2	12	3907	3918	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	429221856
75	NC_019790	GCG	2	6	3934	3939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221856
76	NC_019790	GTG	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221856
77	NC_019790	CGC	2	6	4018	4023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221856
78	NC_019790	AGGC	2	8	4104	4111	25 %	0 %	50 %	25 %	429221856
79	NC_019790	ACGG	2	8	4145	4152	25 %	0 %	50 %	25 %	429221856
80	NC_019790	CGG	2	6	4209	4214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221856
81	NC_019790	AGG	2	6	4215	4220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221856
82	NC_019790	TGG	2	6	4221	4226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221856
83	NC_019790	GTC	2	6	4279	4284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221856
84	NC_019790	GAT	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429221856
85	NC_019790	ACG	2	6	4388	4393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221856
86	NC_019790	GCT	2	6	4432	4437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221856
87	NC_019790	CAG	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221857
88	NC_019790	CG	3	6	4657	4662	0 %	0 %	50 %	50 %	429221857
89	NC_019790	CG	3	6	4664	4669	0 %	0 %	50 %	50 %	429221857
90	NC_019790	CCT	2	6	4676	4681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221857
91	NC_019790	GCC	2	6	4717	4722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221857
92	NC_019790	CAC	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221857
93	NC_019790	CAC	2	6	5241	5246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221858
94	NC_019790	ACG	2	6	5293	5298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221858
95	NC_019790	GAA	2	6	5304	5309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429221858
96	NC_019790	GGC	2	6	5330	5335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221858
97	NC_019790	CCAAC	2	10	5351	5360	40 %	0 %	0 %	60 %	429221858
98	NC_019790	TCC	2	6	5410	5415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221858
99	NC_019790	C	7	7	5421	5427	0 %	0 %	0 %	100 %	429221858
100	NC_019790	CTT	2	6	5444	5449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221858
101	NC_019790	TAC	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221858
102	NC_019790	TCG	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221858
103	NC_019790	ACG	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221858
104	NC_019790	CACG	2	8	5654	5661	25 %	0 %	25 %	50 %	429221858
105	NC_019790	GCGA	2	8	5707	5714	25 %	0 %	50 %	25 %	429221858
106	NC_019790	CG	3	6	5729	5734	0 %	0 %	50 %	50 %	429221858
107	NC_019790	ACGCC	2	10	5807	5816	20 %	0 %	20 %	60 %	429221858
108	NC_019790	CGA	2	6	5885	5890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221858
109	NC_019790	CGG	2	6	5894	5899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221858
110	NC_019790	CGC	2	6	5906	5911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221858
111	NC_019790	TGC	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221858
112	NC_019790	CAC	2	6	6083	6088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221858
113	NC_019790	TCC	2	6	6099	6104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221858
114	NC_019790	ACA	2	6	6116	6121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221858
115	NC_019790	GCG	2	6	6151	6156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221858
116	NC_019790	AGCTG	2	10	6164	6173	20 %	20 %	40 %	20 %	429221858
117	NC_019790	GC	3	6	6203	6208	0 %	0 %	50 %	50 %	429221858
118	NC_019790	CACC	2	8	6227	6234	25 %	0 %	0 %	75 %	429221858
119	NC_019790	GCG	2	6	6255	6260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221858
120	NC_019790	TCCAT	2	10	6291	6300	20 %	40 %	0 %	40 %	429221858
121	NC_019790	TGG	2	6	6399	6404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221859
122	NC_019790	AAC	2	6	6447	6452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221859
123	NC_019790	GCC	2	6	6577	6582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221859
124	NC_019790	CGG	2	6	6626	6631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221859
125	NC_019790	GCC	2	6	6660	6665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221859
126	NC_019790	CGA	2	6	6683	6688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221859
127	NC_019790	CAA	2	6	6704	6709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221859
128	NC_019790	AAC	2	6	6756	6761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221859
129	NC_019790	ACCT	2	8	6789	6796	25 %	25 %	0 %	50 %	429221859
130	NC_019790	GCC	2	6	6801	6806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221859
131	NC_019790	AAC	2	6	6865	6870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221859
132	NC_019790	CCG	2	6	6928	6933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221859
133	NC_019790	CTG	2	6	7107	7112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221859
134	NC_019790	TCG	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221859
135	NC_019790	GC	3	6	7146	7151	0 %	0 %	50 %	50 %	429221859
136	NC_019790	TCG	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221859
137	NC_019790	CCGG	2	8	7212	7219	0 %	0 %	50 %	50 %	429221859
138	NC_019790	CG	3	6	7275	7280	0 %	0 %	50 %	50 %	429221859
139	NC_019790	CGT	2	6	7286	7291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221859
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144	NC_019790	CTG	2	6	7455	7460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221859
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152	NC_019790	CGC	2	6	7720	7725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221860
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245	NC_019790	GCCA	2	8	11073	11080	25 %	0 %	25 %	50 %	429221863
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249	NC_019790	CAG	2	6	11387	11392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221863
250	NC_019790	CCTG	2	8	11420	11427	0 %	25 %	25 %	50 %	429221863
251	NC_019790	GC	3	6	11448	11453	0 %	0 %	50 %	50 %	429221863
252	NC_019790	CGT	2	6	11558	11563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221863
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254	NC_019790	GCG	2	6	11588	11593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221863
255	NC_019790	CGA	2	6	11603	11608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221863
256	NC_019790	TAC	2	6	11661	11666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221863
257	NC_019790	GGA	2	6	11700	11705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221863
258	NC_019790	CAC	2	6	11770	11775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221864
259	NC_019790	CG	3	6	11783	11788	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
260	NC_019790	ATC	2	6	11861	11866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221864
261	NC_019790	AGC	2	6	11878	11883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221864
262	NC_019790	CAG	2	6	11906	11911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221864
263	NC_019790	CG	3	6	11924	11929	0 %	0 %	50 %	50 %	429221864
264	NC_019790	GTG	2	6	11936	11941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221864
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386	NC_019790	CCA	2	6	17375	17380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221867
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