MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Deinococcus peraridilitoris DSM 19664 plasmid pDEIPE02

Total Repeats: 1298

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_019790	CCA	2	6	27457	27462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221873
502	NC_019790	GGC	2	6	27472	27477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221873
503	NC_019790	CAT	3	9	27488	27496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221873
504	NC_019790	GGC	2	6	27641	27646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221874
505	NC_019790	ATC	2	6	27693	27698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221874
506	NC_019790	GGT	2	6	27895	27900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221874
507	NC_019790	GCG	2	6	28025	28030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221874
508	NC_019790	ACG	2	6	28036	28041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221874
509	NC_019790	AGC	2	6	28044	28049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221874
510	NC_019790	GCA	2	6	28053	28058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221874
511	NC_019790	CGA	2	6	28151	28156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221874
512	NC_019790	GTC	2	6	28187	28192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221874
513	NC_019790	GCT	2	6	28223	28228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221874
514	NC_019790	GCC	2	6	28242	28247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221874
515	NC_019790	TGC	2	6	28255	28260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221874
516	NC_019790	TGC	2	6	28366	28371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221874
517	NC_019790	ACG	2	6	28372	28377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221874
518	NC_019790	GAGC	2	8	28400	28407	25 %	0 %	50 %	25 %	429221874
519	NC_019790	GCG	2	6	28415	28420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221874
520	NC_019790	GGT	2	6	28426	28431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221874
521	NC_019790	ATG	2	6	28470	28475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429221874
522	NC_019790	GC	3	6	28479	28484	0 %	0 %	50 %	50 %	429221874
523	NC_019790	TCA	2	6	28524	28529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221874
524	NC_019790	GTC	3	9	28794	28802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221875
525	NC_019790	GCA	2	6	28807	28812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221875
526	NC_019790	AGGAT	2	10	28827	28836	40 %	20 %	40 %	0 %	429221875
527	NC_019790	CG	3	6	28878	28883	0 %	0 %	50 %	50 %	429221875
528	NC_019790	CGG	2	6	28903	28908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221875
529	NC_019790	CAC	2	6	28988	28993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221875
530	NC_019790	GCC	2	6	28999	29004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221875
531	NC_019790	GAC	2	6	29012	29017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221875
532	NC_019790	CTT	2	6	29060	29065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221875
533	NC_019790	GCT	2	6	29127	29132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221875
534	NC_019790	GTCAG	2	10	29139	29148	20 %	20 %	40 %	20 %	429221875
535	NC_019790	GTC	2	6	29165	29170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221875
536	NC_019790	CGC	2	6	29175	29180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221875
537	NC_019790	AGC	2	6	29217	29222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221875
538	NC_019790	GGC	2	6	29298	29303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221875
539	NC_019790	CGT	2	6	29305	29310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221875
540	NC_019790	CG	3	6	29314	29319	0 %	0 %	50 %	50 %	429221875
541	NC_019790	GTC	2	6	29384	29389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221875
542	NC_019790	CG	3	6	29437	29442	0 %	0 %	50 %	50 %	429221875
543	NC_019790	TCG	2	6	29485	29490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221875
544	NC_019790	CAT	2	6	29495	29500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	429221875
545	NC_019790	TCT	2	6	29508	29513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221875
546	NC_019790	GCTG	2	8	29518	29525	0 %	25 %	50 %	25 %	429221875
547	NC_019790	CAG	2	6	29537	29542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221875
548	NC_019790	GCA	2	6	29581	29586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221875
549	NC_019790	CTC	2	6	30170	30175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221876
550	NC_019790	GCT	2	6	30250	30255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221876
551	NC_019790	GTT	2	6	30282	30287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429221876
552	NC_019790	GCC	2	6	30339	30344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221876
553	NC_019790	CG	3	6	30350	30355	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
554	NC_019790	GGGT	2	8	30401	30408	0 %	25 %	75 %	0 %	429221876
555	NC_019790	GCT	2	6	30431	30436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221876
556	NC_019790	CAG	2	6	30467	30472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221876
557	NC_019790	CAC	2	6	30499	30504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221876
558	NC_019790	CGT	2	6	30535	30540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221876
559	NC_019790	CAG	2	6	30554	30559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221876
560	NC_019790	GGC	2	6	30586	30591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221876
561	NC_019790	TCG	2	6	30594	30599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221876
562	NC_019790	CCG	2	6	30650	30655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221876
563	NC_019790	CG	4	8	30662	30669	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
564	NC_019790	C	6	6	30700	30705	0 %	0 %	0 %	100 %	429221876
565	NC_019790	ACGCA	2	10	30719	30728	40 %	0 %	20 %	40 %	429221876
566	NC_019790	GC	3	6	30787	30792	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
567	NC_019790	TCG	2	6	30828	30833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221876
568	NC_019790	GC	3	6	30875	30880	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
569	NC_019790	GCA	2	6	30922	30927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221876
570	NC_019790	CG	3	6	30961	30966	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
571	NC_019790	TCC	2	6	30987	30992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	429221876
572	NC_019790	GC	3	6	31086	31091	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
573	NC_019790	TTC	2	6	31103	31108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221876
574	NC_019790	ACA	2	6	31110	31115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	429221876
575	NC_019790	AGC	2	6	31125	31130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221876
576	NC_019790	CCG	2	6	31308	31313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221876
577	NC_019790	GTT	2	6	31381	31386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429221876
578	NC_019790	AGC	2	6	31428	31433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221876
579	NC_019790	GTT	2	6	31483	31488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429221876
580	NC_019790	GC	3	6	31535	31540	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
581	NC_019790	CCA	2	6	31608	31613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221876
582	NC_019790	TGC	2	6	31650	31655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221876
583	NC_019790	GC	3	6	31654	31659	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
584	NC_019790	GTGAG	2	10	31668	31677	20 %	20 %	60 %	0 %	429221876
585	NC_019790	CCA	2	6	31739	31744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221876
586	NC_019790	CGC	2	6	31753	31758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221876
587	NC_019790	CG	3	6	31795	31800	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
588	NC_019790	GTT	2	6	31927	31932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	429221876
589	NC_019790	CACG	2	8	31949	31956	25 %	0 %	25 %	50 %	429221876
590	NC_019790	CG	3	6	31976	31981	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
591	NC_019790	GC	3	6	31997	32002	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
592	NC_019790	ACGC	2	8	32074	32081	25 %	0 %	25 %	50 %	429221876
593	NC_019790	CTG	2	6	32177	32182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221876
594	NC_019790	GGTG	2	8	32242	32249	0 %	25 %	75 %	0 %	429221876
595	NC_019790	CGA	2	6	32260	32265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221876
596	NC_019790	CCTAC	2	10	32290	32299	20 %	20 %	0 %	60 %	429221876
597	NC_019790	CCTTC	2	10	32320	32329	0 %	40 %	0 %	60 %	429221876
598	NC_019790	CAC	2	6	32369	32374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	429221876
599	NC_019790	CGGT	2	8	32391	32398	0 %	25 %	50 %	25 %	429221876
600	NC_019790	GGTG	2	8	32431	32438	0 %	25 %	75 %	0 %	429221876
601	NC_019790	CG	3	6	32501	32506	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
602	NC_019790	CG	3	6	32564	32569	0 %	0 %	50 %	50 %	429221876
603	NC_019790	CCG	2	6	32692	32697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221876
604	NC_019790	TGAT	2	8	32775	32782	25 %	50 %	25 %	0 %	429221876
605	NC_019790	TCT	2	6	32793	32798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	429221876
606	NC_019790	GGT	2	6	32926	32931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221876
607	NC_019790	CAG	2	6	33047	33052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221876
608	NC_019790	CAGT	2	8	33241	33248	25 %	25 %	25 %	25 %	429221876
609	NC_019790	TTCAC	2	10	33249	33258	20 %	40 %	0 %	40 %	429221876
610	NC_019790	CTG	2	6	33304	33309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221877
611	NC_019790	GGA	2	6	33312	33317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221877
612	NC_019790	TGC	2	6	33332	33337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221877
613	NC_019790	GCCG	2	8	33366	33373	0 %	0 %	50 %	50 %	429221877
614	NC_019790	GAA	2	6	33400	33405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	429221877
615	NC_019790	TGC	2	6	33429	33434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221877
616	NC_019790	GCG	2	6	33516	33521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221877
617	NC_019790	GGT	2	6	33546	33551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	429221877
618	NC_019790	CAG	2	6	33558	33563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221877
619	NC_019790	CAG	2	6	33567	33572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	429221877
620	NC_019790	CGG	2	6	33586	33591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	429221877
621	NC_019790	GAG	2	6	33660	33665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221877
622	NC_019790	GAG	2	6	33721	33726	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221877
623	NC_019790	GCT	2	6	34031	34036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221878
624	NC_019790	CGC	2	6	34061	34066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221878
625	NC_019790	CCG	2	6	34070	34075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	429221878
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627	NC_019790	ATG	2	6	34111	34116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	429221878
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755	NC_019790	GTC	2	6	40095	40100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	429221883
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759	NC_019790	GGA	2	6	40200	40205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221883
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777	NC_019790	GAG	2	6	41188	41193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	429221884
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878	NC_019790	CCCA	2	8	49095	49102	25 %	0 %	0 %	75 %	429221892
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1000	NC_019790	GCAG	2	8	56904	56911	25 %	0 %	50 %	25 %	429221904

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