MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Dactylococcopsis salina PCC 8305 chromosome

Total Repeats: 1509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019780	GCTAAC	2	12	272	283	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778396
2	NC_019780	TTTATC	2	12	1015	1026	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428778396
3	NC_019780	TCAACA	2	12	3825	3836	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428778400
4	NC_019780	GGTCGC	2	12	3964	3975	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428778400
5	NC_019780	CTGATC	2	12	11446	11457	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428778406
6	NC_019780	AGTTAA	2	12	19973	19984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428778415
7	NC_019780	GAACAA	2	12	21802	21813	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428778416
8	NC_019780	AGCATG	2	12	23209	23220	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428778417
9	NC_019780	TCATGC	2	12	23709	23720	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428778418
10	NC_019780	TTCTCC	2	12	27157	27168	0 %	50 %	0 %	50 %	428778421
11	NC_019780	AGAAAA	2	12	28529	28540	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428778423
12	NC_019780	CAAGAA	2	12	35369	35380	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428778427
13	NC_019780	GTTTCG	2	12	41967	41978	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428778437
14	NC_019780	CCAAGT	2	12	42142	42153	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778437
15	NC_019780	GCACCA	2	12	48355	48366	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428778441
16	NC_019780	CCTTCT	2	12	48865	48876	0 %	50 %	0 %	50 %	428778441
17	NC_019780	CGGCGA	2	12	49553	49564	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	428778442
18	NC_019780	ATCAAG	2	12	50706	50717	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428778444
19	NC_019780	GGCTTA	2	12	52806	52817	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428778445
20	NC_019780	CGACAA	2	12	53646	53657	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428778445
21	NC_019780	GTTCCC	2	12	57382	57393	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428778448
22	NC_019780	GAAAAA	2	12	57903	57914	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428778448
23	NC_019780	ACTTGC	2	12	62625	62636	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428778454
24	NC_019780	TCCGTT	2	12	62821	62832	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428778454
25	NC_019780	GAAGTG	2	12	65192	65203	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428778455
26	NC_019780	GCGATG	2	12	65378	65389	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428778455
27	NC_019780	GCGATC	2	12	65394	65405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428778455
28	NC_019780	ATACTC	2	12	68129	68140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778458
29	NC_019780	CACTTC	2	12	71296	71307	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428778461
30	NC_019780	GGAAAA	2	12	82693	82704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778470
31	NC_019780	GAGCAA	2	12	84640	84651	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428778472
32	NC_019780	TGAAAT	2	12	88508	88519	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428778474
33	NC_019780	GTTCCA	2	12	93867	93878	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428778483
34	NC_019780	TTGGGT	2	12	96160	96171	0 %	50 %	50 %	0 %	428778485
35	NC_019780	GCGATC	2	12	96754	96765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428778485
36	NC_019780	GAGTCA	2	12	98526	98537	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428778486
37	NC_019780	GTCTCT	2	12	105046	105057	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428778489
38	NC_019780	GGGTTT	2	12	105968	105979	0 %	50 %	50 %	0 %	428778490
39	NC_019780	ACGGTA	2	12	108360	108371	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428778495
40	NC_019780	CTAATT	2	12	112152	112163	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428778497
41	NC_019780	CGATCG	2	12	113316	113327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428778497
42	NC_019780	AGCTAA	2	12	113377	113388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428778497
43	NC_019780	TGGCTT	2	12	115208	115219	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428778501
44	NC_019780	TTTAAC	2	12	116440	116451	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428778501
45	NC_019780	TTTTCA	2	12	116477	116488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428778501
46	NC_019780	ATCAGG	2	12	123149	123160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428778507
47	NC_019780	AATTGG	2	12	125645	125656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778509
48	NC_019780	TAACTC	2	12	127130	127141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778511
49	NC_019780	TCATCT	2	12	131419	131430	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428778514
50	NC_019780	ACAAGT	2	12	139368	139379	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428778523
51	NC_019780	CATTGT	2	12	143462	143473	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428778526
52	NC_019780	AAATAG	2	12	147550	147561	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428778530
53	NC_019780	AAAAAT	2	12	153967	153978	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	428778534
54	NC_019780	TTAGAA	2	12	155949	155960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428778535
55	NC_019780	TCTCCC	2	12	157706	157717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428778536
56	NC_019780	GAATCC	2	12	160919	160930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778540
57	NC_019780	TCGGGT	2	12	161536	161547	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428778541
58	NC_019780	GTTAAA	2	12	163507	163518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428778544
59	NC_019780	TCACCA	2	12	164364	164375	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428778545
60	NC_019780	CATTCC	2	12	164665	164676	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428778545
61	NC_019780	TGACCA	2	12	167538	167549	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778547
62	NC_019780	CACCGA	2	12	168767	168778	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428778548
63	NC_019780	TGATCC	2	12	169903	169914	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428778550
64	NC_019780	CGCGAT	2	12	170993	171004	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428778551
65	NC_019780	ACCATT	2	12	174183	174194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778555
66	NC_019780	CCACTC	2	12	176548	176559	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428778558
67	NC_019780	AAAATG	2	12	178161	178172	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428778562
68	NC_019780	CGGATT	2	12	178506	178517	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428778562
69	NC_019780	CGCGCT	2	12	178686	178697	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428778562
70	NC_019780	CCACCG	2	12	181735	181746	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428778564
71	NC_019780	GCTGGT	4	24	182925	182948	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428778565
72	NC_019780	TCGGGT	2	12	184269	184280	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428778567
73	NC_019780	GCCAAT	2	12	184363	184374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778567
74	NC_019780	TCAAAA	2	12	185039	185050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428778567
75	NC_019780	CAATTA	2	12	187687	187698	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428778572
76	NC_019780	TGTTTC	2	12	191060	191071	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428778576
77	NC_019780	GATCAG	2	12	193255	193266	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428778579
78	NC_019780	ACGAAG	2	12	193807	193818	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428778580
79	NC_019780	TAACTC	2	12	197637	197648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778582
80	NC_019780	CTAAAA	2	12	199531	199542	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428778583
81	NC_019780	ACCATT	2	12	200496	200507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778585
82	NC_019780	TTAAAA	2	12	204102	204113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428778589
83	NC_019780	ACAAGC	2	12	205201	205212	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428778590
84	NC_019780	ACGCCA	2	12	205479	205490	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428778590
85	NC_019780	CACCAA	2	12	210086	210097	50 %	0 %	0 %	50 %	428778593
86	NC_019780	TGATGG	2	12	211541	211552	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428778593
87	NC_019780	GAATAA	2	12	213859	213870	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428778594
88	NC_019780	CTGTTG	2	12	218999	219010	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428778597
89	NC_019780	AGTTGT	2	12	219779	219790	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428778598
90	NC_019780	CGGGAA	2	12	229415	229426	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428778603
91	NC_019780	CGCTAA	2	12	233352	233363	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778609
92	NC_019780	TGTTCT	2	12	234565	234576	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428778609
93	NC_019780	ATAGTA	2	12	238608	238619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428778614
94	NC_019780	AAATGG	2	12	238687	238698	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428778614
95	NC_019780	GAAACC	2	12	238891	238902	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428778614
96	NC_019780	ATGTGG	2	12	240258	240269	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428778614
97	NC_019780	CAAGAA	2	12	243932	243943	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428778616
98	NC_019780	TGAGTT	2	12	246109	246120	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428778617
99	NC_019780	GCTGTC	2	12	246654	246665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428778617
100	NC_019780	GAAACG	2	12	253265	253276	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428778627
101	NC_019780	CAAGTC	2	12	272040	272051	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778645
102	NC_019780	ATTGAT	2	12	277006	277017	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428778650
103	NC_019780	CTTTAT	2	12	280336	280347	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428778653
104	NC_019780	CTTCCT	2	12	280574	280585	0 %	50 %	0 %	50 %	428778653
105	NC_019780	CGACAA	2	12	285870	285881	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428778656
106	NC_019780	TTGATC	2	12	298148	298159	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428778676
107	NC_019780	ACCATT	2	12	300199	300210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778677
108	NC_019780	TTCAAT	2	12	302567	302578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428778679
109	NC_019780	ACTCCC	2	12	311252	311263	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428778686
110	NC_019780	CGATCG	2	12	312275	312286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428778688
111	NC_019780	GCTTCT	2	12	313196	313207	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428778690
112	NC_019780	GAAAGA	2	12	315341	315352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428778692
113	NC_019780	GAAGTT	2	12	316463	316474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428778693
114	NC_019780	ATTAAC	2	12	320443	320454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428778697
115	NC_019780	GTTTCT	2	12	320774	320785	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428778697
116	NC_019780	CCGTTA	3	18	323163	323180	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428778697
117	NC_019780	ACCGTC	2	12	323216	323227	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428778697
118	NC_019780	GATTCG	2	12	323532	323543	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428778697
119	NC_019780	GATTCG	2	12	323811	323822	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428778697
120	NC_019780	TTACCG	2	12	324069	324080	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428778697
121	NC_019780	GATTCG	2	12	324090	324101	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428778697
122	NC_019780	ACCGTC	2	12	324353	324364	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428778697
123	NC_019780	AAACTT	2	12	324425	324436	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428778697
124	NC_019780	AATCAA	2	12	325248	325259	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428778697
125	NC_019780	ACTTCA	2	12	327146	327157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428778697
126	NC_019780	ATCAGC	2	12	327556	327567	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778697
127	NC_019780	TCAAAG	2	12	327794	327805	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428778697
128	NC_019780	GTAAAG	2	12	327866	327877	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428778697
129	NC_019780	TTAAAG	2	12	328151	328162	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428778697
130	NC_019780	TCTACC	2	12	328379	328390	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428778697
131	NC_019780	CATCAA	2	12	329337	329348	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428778698
132	NC_019780	TGTAAC	2	12	330255	330266	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428778698
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134	NC_019780	CATCGC	2	12	333780	333791	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428778699
135	NC_019780	ACGGTT	2	12	334265	334276	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428778699
136	NC_019780	CCATCA	2	12	335045	335056	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428778699
137	NC_019780	CTTCAT	2	12	335787	335798	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428778699
138	NC_019780	CCTCTA	2	12	337911	337922	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428778699
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143	NC_019780	GGTTGC	2	12	350413	350424	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428778703
144	NC_019780	AATCTG	2	12	351642	351653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428778703
145	NC_019780	AGCTTA	2	12	352863	352874	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428778704
146	NC_019780	CTTCTC	2	12	353645	353656	0 %	50 %	0 %	50 %	428778704
147	NC_019780	CCAAAG	2	12	354703	354714	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428778704
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149	NC_019780	CGGTTA	2	12	356771	356782	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428778704
150	NC_019780	ATCAAA	2	12	357372	357383	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428778704
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152	NC_019780	CCAAAG	2	12	359749	359760	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428778704
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218	NC_019780	AACCGC	2	12	564307	564318	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428778901
219	NC_019780	CTCGCC	2	12	566435	566446	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	428778904
220	NC_019780	TGCGGG	2	12	579533	579544	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428778914
221	NC_019780	TCTGAT	2	12	580133	580144	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428778914
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227	NC_019780	ATCAAA	2	12	596355	596366	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428778931
228	NC_019780	TTGTCG	2	12	599203	599214	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428778934
229	NC_019780	CTAAGC	2	12	600042	600053	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428778934
230	NC_019780	TGGAAG	2	12	605454	605465	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428778936
231	NC_019780	TTTAAG	2	12	606284	606295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428778938
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342	NC_019780	GATTTA	2	12	862408	862419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428779170
343	NC_019780	CTATCG	2	12	865949	865960	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428779174
344	NC_019780	AAACCC	2	12	866676	866687	50 %	0 %	0 %	50 %	428779174
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447	NC_019780	GGTTGA	2	12	1166730	1166741	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428779433
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449	NC_019780	TGGGGC	2	12	1169981	1169992	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428779435
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451	NC_019780	GTAATT	2	12	1173220	1173231	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428779438
452	NC_019780	CAGAAG	2	12	1173311	1173322	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428779438
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454	NC_019780	CTTCTA	2	12	1176875	1176886	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428779441
455	NC_019780	TCGCCA	2	12	1177190	1177201	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428779441
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