MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Dehalobacter sp. DCA chromosome

Total Repeats: 33492

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018866	CAA	2	6	123	128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410656643
2	NC_018866	GCA	2	6	385	390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656643
3	NC_018866	CGG	2	6	441	446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656643
4	NC_018866	TTA	2	6	622	627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656643
5	NC_018866	AAG	2	6	656	661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656643
6	NC_018866	GAA	2	6	670	675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656643
7	NC_018866	CAA	2	6	708	713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410656643
8	NC_018866	ATT	2	6	721	726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656643
9	NC_018866	AAC	2	6	798	803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410656643
10	NC_018866	TGA	2	6	882	887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656643
11	NC_018866	ATT	3	9	889	897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656643
12	NC_018866	AGA	2	6	1005	1010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656643
13	NC_018866	AGA	2	6	1118	1123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656643
14	NC_018866	GGA	2	6	1219	1224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410656643
15	NC_018866	ATT	2	6	1312	1317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656643
16	NC_018866	TCC	2	6	1656	1661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410656644
17	NC_018866	GAA	2	6	1779	1784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656644
18	NC_018866	GTT	2	6	1791	1796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656644
19	NC_018866	AAT	2	6	1869	1874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656644
20	NC_018866	GAA	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656644
21	NC_018866	TGC	2	6	2059	2064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656644
22	NC_018866	ATT	2	6	2166	2171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656644
23	NC_018866	GAT	2	6	2211	2216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656644
24	NC_018866	ATT	2	6	2250	2255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656644
25	NC_018866	ATC	2	6	2559	2564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656644
26	NC_018866	GTT	2	6	2577	2582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656644
27	NC_018866	ATC	2	6	2615	2620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656644
28	NC_018866	TTA	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656645
29	NC_018866	TTA	2	6	2966	2971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656645
30	NC_018866	GAT	2	6	3066	3071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656645
31	NC_018866	AAG	2	6	3101	3106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656645
32	NC_018866	CTG	2	6	3120	3125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656645
33	NC_018866	CGA	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656645
34	NC_018866	AAT	2	6	3503	3508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656645
35	NC_018866	CAG	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656645
36	NC_018866	ATC	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656645
37	NC_018866	CTG	2	6	3636	3641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656645
38	NC_018866	GAT	2	6	3642	3647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656645
39	NC_018866	ATC	2	6	3720	3725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656645
40	NC_018866	AGG	2	6	3798	3803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410656645
41	NC_018866	TAA	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656646
42	NC_018866	TAT	2	6	3836	3841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656646
43	NC_018866	CAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656646
44	NC_018866	TTG	2	6	3912	3917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656646
45	NC_018866	ATG	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656646
46	NC_018866	TGA	2	6	3982	3987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656646
47	NC_018866	TTC	2	6	4016	4021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656646
48	NC_018866	CCA	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410656647
49	NC_018866	TTA	2	6	4482	4487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656647
50	NC_018866	TCA	2	6	4489	4494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656647
51	NC_018866	CGG	2	6	4600	4605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656647
52	NC_018866	TAA	2	6	4612	4617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656647
53	NC_018866	TGG	2	6	4636	4641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410656647
54	NC_018866	GTT	2	6	4664	4669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656647
55	NC_018866	AAT	2	6	4955	4960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656647
56	NC_018866	TCA	2	6	5008	5013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656647
57	NC_018866	ATA	2	6	5043	5048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656647
58	NC_018866	TAA	2	6	5110	5115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656647
59	NC_018866	GTT	2	6	5174	5179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656647
60	NC_018866	ATT	2	6	5264	5269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656647
61	NC_018866	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656647
62	NC_018866	TTG	2	6	5412	5417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656647
63	NC_018866	GCC	2	6	5450	5455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410656647
64	NC_018866	CTT	2	6	5502	5507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656647
65	NC_018866	GGC	2	6	5585	5590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656647
66	NC_018866	GAA	2	6	5604	5609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656647
67	NC_018866	GAT	2	6	6089	6094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656647
68	NC_018866	ATT	2	6	6290	6295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656648
69	NC_018866	ATG	2	6	6479	6484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656648
70	NC_018866	ATG	2	6	6668	6673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656648
71	NC_018866	TTC	2	6	6732	6737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656648
72	NC_018866	CCG	2	6	6769	6774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410656648
73	NC_018866	CGT	2	6	6801	6806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656648
74	NC_018866	TGA	2	6	6866	6871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656648
75	NC_018866	TTA	2	6	6875	6880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656648
76	NC_018866	TCA	2	6	6929	6934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656648
77	NC_018866	GTT	2	6	7021	7026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656648
78	NC_018866	GAA	2	6	7353	7358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656648
79	NC_018866	AGA	2	6	7362	7367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656648
80	NC_018866	TTG	2	6	7379	7384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656648
81	NC_018866	TTC	2	6	7437	7442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656648
82	NC_018866	GAT	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656648
83	NC_018866	ATT	2	6	7642	7647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656648
84	NC_018866	CGA	2	6	7715	7720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656648
85	NC_018866	CGT	2	6	7755	7760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656648
86	NC_018866	AGA	2	6	7822	7827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656648
87	NC_018866	GTG	2	6	7835	7840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410656648
88	NC_018866	CAT	3	9	7900	7908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656648
89	NC_018866	CGA	2	6	8039	8044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656648
90	NC_018866	CTG	2	6	8077	8082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656648
91	NC_018866	AAG	2	6	8139	8144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656648
92	NC_018866	GAT	3	9	8212	8220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656648
93	NC_018866	GCC	2	6	8500	8505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410656648
94	NC_018866	GTC	2	6	8512	8517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656648
95	NC_018866	CCG	2	6	8519	8524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410656648
96	NC_018866	AGA	3	9	8673	8681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656648
97	NC_018866	GGC	2	6	8808	8813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656649
98	NC_018866	GGA	2	6	8855	8860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410656649
99	NC_018866	GCA	2	6	8913	8918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656649
100	NC_018866	TAA	2	6	8954	8959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656649
101	NC_018866	TGA	2	6	9056	9061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656649
102	NC_018866	CGA	2	6	9083	9088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656649
103	NC_018866	TGC	2	6	9179	9184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656649
104	NC_018866	GAT	2	6	9185	9190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656649
105	NC_018866	CCG	2	6	9266	9271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410656649
106	NC_018866	ACC	2	6	9276	9281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410656649
107	NC_018866	TGA	2	6	9298	9303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656649
108	NC_018866	ATG	2	6	9423	9428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656649
109	NC_018866	TTG	2	6	9451	9456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656649
110	NC_018866	ACC	2	6	9516	9521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410656649
111	NC_018866	GAA	2	6	9558	9563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656649
112	NC_018866	CGG	2	6	9607	9612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656649
113	NC_018866	AGA	2	6	9648	9653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656650
114	NC_018866	GGA	2	6	9719	9724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410656650
115	NC_018866	GAT	2	6	9743	9748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656650
116	NC_018866	ATT	2	6	9770	9775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656650
117	NC_018866	CGG	2	6	9778	9783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656650
118	NC_018866	AGC	2	6	9804	9809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656650
119	NC_018866	GAT	2	6	10127	10132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656650
120	NC_018866	CGA	2	6	10168	10173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656650
121	NC_018866	AGG	2	6	10224	10229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410656650
122	NC_018866	GCA	2	6	10260	10265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656651
123	NC_018866	AAG	2	6	10281	10286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656651
124	NC_018866	GAT	2	6	10319	10324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656651
125	NC_018866	GAA	2	6	10403	10408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656651
126	NC_018866	CGG	2	6	10415	10420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656651
127	NC_018866	GAG	2	6	10442	10447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410656651
128	NC_018866	ATG	2	6	10775	10780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656651
129	NC_018866	GCC	2	6	10790	10795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410656651
130	NC_018866	CCG	2	6	10817	10822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410656651
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380	NC_018866	TCA	2	6	36761	36766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656674
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383	NC_018866	CCG	2	6	37165	37170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410656675
384	NC_018866	ATA	2	6	37180	37185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656675
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423	NC_018866	TTC	2	6	40154	40159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656679
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489	NC_018866	ATC	2	6	45822	45827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656685
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491	NC_018866	ACC	2	6	46006	46011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410656685
492	NC_018866	GCT	2	6	46031	46036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656685
493	NC_018866	GTT	2	6	46071	46076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656685
494	NC_018866	GCT	2	6	46313	46318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656685
495	NC_018866	GAT	2	6	46431	46436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656685
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497	NC_018866	TAT	2	6	46491	46496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656685
498	NC_018866	GTC	2	6	46497	46502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656685
499	NC_018866	AGC	2	6	46597	46602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656685
500	NC_018866	ATA	2	6	46647	46652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656685

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