MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalobacter sp. DCA chromosome

Total Repeats: 50535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018866	ACC	2	6	199296	199301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410656841
3502	NC_018866	GCT	2	6	199302	199307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656841
3503	NC_018866	ATC	2	6	199366	199371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656841
3504	NC_018866	A	7	7	199372	199378	100 %	0 %	0 %	0 %	410656841
3505	NC_018866	AAC	2	6	199407	199412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410656841
3506	NC_018866	CGG	2	6	199461	199466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656841
3507	NC_018866	AAG	2	6	199501	199506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656841
3508	NC_018866	CTG	2	6	199627	199632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656841
3509	NC_018866	GAA	2	6	199781	199786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656842
3510	NC_018866	AGAC	2	8	199827	199834	50 %	0 %	25 %	25 %	410656842
3511	NC_018866	GCT	2	6	199872	199877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656842
3512	NC_018866	GTA	2	6	199924	199929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656842
3513	NC_018866	GAG	2	6	199948	199953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410656842
3514	NC_018866	CTG	2	6	199963	199968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656842
3515	NC_018866	ATGAT	2	10	200033	200042	40 %	40 %	20 %	0 %	410656842
3516	NC_018866	GCGA	2	8	200140	200147	25 %	0 %	50 %	25 %	410656842
3517	NC_018866	CTG	2	6	200194	200199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656842
3518	NC_018866	CCG	2	6	200248	200253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410656842
3519	NC_018866	CGGA	2	8	200285	200292	25 %	0 %	50 %	25 %	410656842
3520	NC_018866	TTA	2	6	200301	200306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656842
3521	NC_018866	TTG	2	6	200330	200335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656842
3522	NC_018866	TGA	3	9	200351	200359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656842
3523	NC_018866	AGC	2	6	200402	200407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656842
3524	NC_018866	TGA	2	6	200438	200443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656842
3525	NC_018866	ATT	2	6	200452	200457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656842
3526	NC_018866	CTG	2	6	200497	200502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656842
3527	NC_018866	CTG	2	6	200542	200547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656842
3528	NC_018866	T	6	6	200650	200655	0 %	100 %	0 %	0 %	410656842
3529	NC_018866	TAT	2	6	200670	200675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656842
3530	NC_018866	TTTTC	2	10	200685	200694	0 %	80 %	0 %	20 %	410656842
3531	NC_018866	CAT	2	6	200763	200768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656842
3532	NC_018866	ATTTT	2	10	200830	200839	20 %	80 %	0 %	0 %	410656842
3533	NC_018866	GTT	2	6	200844	200849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656842
3534	NC_018866	AAG	2	6	200875	200880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656842
3535	NC_018866	GA	3	6	200918	200923	50 %	0 %	50 %	0 %	410656843
3536	NC_018866	A	6	6	200923	200928	100 %	0 %	0 %	0 %	410656843
3537	NC_018866	GAA	2	6	200991	200996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656843
3538	NC_018866	AGA	2	6	201053	201058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656843
3539	NC_018866	ATT	2	6	201096	201101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656843
3540	NC_018866	CAT	2	6	201210	201215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656843
3541	NC_018866	A	6	6	201232	201237	100 %	0 %	0 %	0 %	410656843
3542	NC_018866	GATC	2	8	201272	201279	25 %	25 %	25 %	25 %	410656843
3543	NC_018866	CAG	2	6	201290	201295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656843
3544	NC_018866	TGA	2	6	201518	201523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656843
3545	NC_018866	GCA	2	6	201613	201618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656844
3546	NC_018866	GTTTT	2	10	201682	201691	0 %	80 %	20 %	0 %	410656844
3547	NC_018866	TTAA	2	8	201697	201704	50 %	50 %	0 %	0 %	410656844
3548	NC_018866	TAG	2	6	201725	201730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656844
3549	NC_018866	GA	3	6	201743	201748	50 %	0 %	50 %	0 %	410656844
3550	NC_018866	TAT	2	6	201753	201758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656844
3551	NC_018866	TAT	2	6	201884	201889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656844
3552	NC_018866	AAAGG	2	10	201930	201939	60 %	0 %	40 %	0 %	410656844
3553	NC_018866	AT	3	6	202066	202071	50 %	50 %	0 %	0 %	410656844
3554	NC_018866	C	6	6	202170	202175	0 %	0 %	0 %	100 %	410656844
3555	NC_018866	AGTT	2	8	202263	202270	25 %	50 %	25 %	0 %	410656844
3556	NC_018866	T	6	6	202291	202296	0 %	100 %	0 %	0 %	410656844
3557	NC_018866	TTC	2	6	202404	202409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656844
3558	NC_018866	CAT	2	6	202445	202450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656844
3559	NC_018866	CATC	2	8	202508	202515	25 %	25 %	0 %	50 %	410656844
3560	NC_018866	TTC	2	6	202561	202566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656844
3561	NC_018866	ATG	2	6	202717	202722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656844
3562	NC_018866	CTG	2	6	202856	202861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656844
3563	NC_018866	TTGT	2	8	202863	202870	0 %	75 %	25 %	0 %	410656844
3564	NC_018866	TAA	2	6	202872	202877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656844
3565	NC_018866	AAT	2	6	202888	202893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410656844
3566	NC_018866	CTT	2	6	202919	202924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656844
3567	NC_018866	GGC	2	6	203792	203797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656845
3568	NC_018866	A	6	6	203800	203805	100 %	0 %	0 %	0 %	410656845
3569	NC_018866	TGG	2	6	203816	203821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410656845
3570	NC_018866	GATG	2	8	204024	204031	25 %	25 %	50 %	0 %	410656845
3571	NC_018866	TGA	2	6	204066	204071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656845
3572	NC_018866	AG	3	6	204085	204090	50 %	0 %	50 %	0 %	410656845
3573	NC_018866	CGT	2	6	204104	204109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656845
3574	NC_018866	GGC	2	6	204112	204117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656845
3575	NC_018866	TA	3	6	204128	204133	50 %	50 %	0 %	0 %	410656845
3576	NC_018866	GGA	2	6	204192	204197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410656845
3577	NC_018866	TGT	2	6	204210	204215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656845
3578	NC_018866	ACG	2	6	204229	204234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656845
3579	NC_018866	AGG	2	6	204326	204331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410656845
3580	NC_018866	GGT	2	6	204397	204402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410656845
3581	NC_018866	GAT	2	6	204445	204450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656845
3582	NC_018866	CTG	2	6	204526	204531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656845
3583	NC_018866	ATC	2	6	204601	204606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656845
3584	NC_018866	CGG	2	6	204651	204656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656845
3585	NC_018866	TTG	2	6	204695	204700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656845
3586	NC_018866	CTG	2	6	204735	204740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656845
3587	NC_018866	G	6	6	204846	204851	0 %	0 %	100 %	0 %	410656845
3588	NC_018866	ACC	2	6	204976	204981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410656845
3589	NC_018866	CTG	3	9	205013	205021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656845
3590	NC_018866	CGGAAA	2	12	205084	205095	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410656845
3591	NC_018866	CTG	2	6	205114	205119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656845
3592	NC_018866	GAT	2	6	205144	205149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656845
3593	NC_018866	TGT	2	6	205221	205226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656845
3594	NC_018866	GAA	2	6	205228	205233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656845
3595	NC_018866	AAC	2	6	205270	205275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410656845
3596	NC_018866	A	8	8	205332	205339	100 %	0 %	0 %	0 %	410656845
3597	NC_018866	GAC	2	6	205369	205374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656845
3598	NC_018866	ATT	2	6	205398	205403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656845
3599	NC_018866	GAAAA	2	10	205427	205436	80 %	0 %	20 %	0 %	410656845
3600	NC_018866	GGC	3	9	205564	205572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656846
3601	NC_018866	AGA	2	6	205610	205615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656846
3602	NC_018866	ATG	2	6	205627	205632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410656846
3603	NC_018866	GAAG	2	8	205638	205645	50 %	0 %	50 %	0 %	410656846
3604	NC_018866	GGC	3	9	205678	205686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410656846
3605	NC_018866	TGG	2	6	205688	205693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410656846
3606	NC_018866	ACT	2	6	205770	205775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656846
3607	NC_018866	GGA	2	6	205858	205863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410656846
3608	NC_018866	ATT	2	6	205878	205883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656846
3609	NC_018866	TAT	2	6	205981	205986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656847
3610	NC_018866	GCCTT	2	10	206057	206066	0 %	40 %	20 %	40 %	410656847
3611	NC_018866	GCAG	2	8	206106	206113	25 %	0 %	50 %	25 %	410656847
3612	NC_018866	CTT	2	6	206215	206220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656847
3613	NC_018866	AGC	2	6	206333	206338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656847
3614	NC_018866	ATCT	2	8	206342	206349	25 %	50 %	0 %	25 %	410656847
3615	NC_018866	ATT	2	6	206352	206357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656847
3616	NC_018866	CAT	2	6	206707	206712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656848
3617	NC_018866	CGTT	2	8	206715	206722	0 %	50 %	25 %	25 %	410656848
3618	NC_018866	T	7	7	206721	206727	0 %	100 %	0 %	0 %	410656848
3619	NC_018866	GTT	2	6	206731	206736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656848
3620	NC_018866	TTCA	2	8	206801	206808	25 %	50 %	0 %	25 %	410656848
3621	NC_018866	T	6	6	206859	206864	0 %	100 %	0 %	0 %	410656848
3622	NC_018866	TGCT	2	8	206934	206941	0 %	50 %	25 %	25 %	410656848
3623	NC_018866	GCT	2	6	207288	207293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656849
3624	NC_018866	CTA	2	6	207325	207330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656849
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3626	NC_018866	TAC	2	6	207491	207496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656849
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3654	NC_018866	TTA	2	6	209167	209172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410656849
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3662	NC_018866	GAA	2	6	209651	209656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656849
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3730	NC_018866	A	7	7	213027	213033	100 %	0 %	0 %	0 %	410656853
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3739	NC_018866	AGA	2	6	213506	213511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410656853
3740	NC_018866	CTT	2	6	213519	213524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656853
3741	NC_018866	TGT	2	6	213539	213544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656853
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3988	NC_018866	CAG	2	6	228294	228299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656868
3989	NC_018866	GTT	2	6	228420	228425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656868
3990	NC_018866	TTG	2	6	228544	228549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656868
3991	NC_018866	TTG	2	6	228571	228576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410656868
3992	NC_018866	GCA	2	6	228592	228597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410656868
3993	NC_018866	TTC	2	6	228612	228617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410656868
3994	NC_018866	CATCG	2	10	228681	228690	20 %	20 %	20 %	40 %	410656868
3995	NC_018866	TCA	2	6	228803	228808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656868
3996	NC_018866	AG	3	6	228825	228830	50 %	0 %	50 %	0 %	410656868
3997	NC_018866	CAT	2	6	228842	228847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410656868
3998	NC_018866	ACC	2	6	228879	228884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410656868
3999	NC_018866	GCT	2	6	228886	228891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410656868
4000	NC_018866	CATTTT	2	12	228984	228995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410656868

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