MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 74800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018068	A	6	6	157	162	100 %	0 %	0 %	0 %	392423460
2	NC_018068	TTC	2	6	187	192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423460
3	NC_018068	CCA	2	6	583	588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392423461
4	NC_018068	TTGG	2	8	747	754	0 %	50 %	50 %	0 %	392423461
5	NC_018068	TAA	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423461
6	NC_018068	TCC	2	6	781	786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423461
7	NC_018068	TCAA	2	8	789	796	50 %	25 %	0 %	25 %	392423461
8	NC_018068	CT	3	6	921	926	0 %	50 %	0 %	50 %	392423461
9	NC_018068	TGC	3	9	984	992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423461
10	NC_018068	TTGCTG	2	12	995	1006	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	392423461
11	NC_018068	ATT	2	6	1032	1037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423461
12	NC_018068	ATGC	2	8	1075	1082	25 %	25 %	25 %	25 %	392423461
13	NC_018068	TGA	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423461
14	NC_018068	ATT	2	6	1324	1329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423461
15	NC_018068	TCA	2	6	1330	1335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423461
16	NC_018068	CCG	2	6	1342	1347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423461
17	NC_018068	TTA	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423461
18	NC_018068	A	7	7	1452	1458	100 %	0 %	0 %	0 %	392423461
19	NC_018068	AGATA	2	10	1509	1518	60 %	20 %	20 %	0 %	392423461
20	NC_018068	ATT	2	6	1688	1693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423461
21	NC_018068	TCG	2	6	1792	1797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423461
22	NC_018068	ACA	2	6	1837	1842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423461
23	NC_018068	ATGC	2	8	1846	1853	25 %	25 %	25 %	25 %	392423461
24	NC_018068	A	6	6	1859	1864	100 %	0 %	0 %	0 %	392423461
25	NC_018068	AGA	2	6	1898	1903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423461
26	NC_018068	AATT	2	8	1913	1920	50 %	50 %	0 %	0 %	392423461
27	NC_018068	TCT	2	6	2198	2203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423462
28	NC_018068	CAAA	2	8	2255	2262	75 %	0 %	0 %	25 %	392423462
29	NC_018068	TAA	2	6	2291	2296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423462
30	NC_018068	GAA	2	6	2374	2379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423462
31	NC_018068	ATT	2	6	2406	2411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423462
32	NC_018068	GTT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423462
33	NC_018068	ATT	2	6	2473	2478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423462
34	NC_018068	AT	3	6	2479	2484	50 %	50 %	0 %	0 %	392423462
35	NC_018068	ATCA	2	8	2489	2496	50 %	25 %	0 %	25 %	392423462
36	NC_018068	GAA	2	6	2524	2529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423462
37	NC_018068	TCCT	2	8	2537	2544	0 %	50 %	0 %	50 %	392423462
38	NC_018068	GAA	2	6	2629	2634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423462
39	NC_018068	ATT	2	6	2767	2772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423462
40	NC_018068	AT	3	6	2794	2799	50 %	50 %	0 %	0 %	392423462
41	NC_018068	TAA	2	6	2841	2846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423462
42	NC_018068	GTT	2	6	2854	2859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423462
43	NC_018068	TAT	2	6	3002	3007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423462
44	NC_018068	A	6	6	3014	3019	100 %	0 %	0 %	0 %	392423462
45	NC_018068	ATT	2	6	3307	3312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
46	NC_018068	A	6	6	3324	3329	100 %	0 %	0 %	0 %	392423463
47	NC_018068	ATG	3	9	3341	3349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
48	NC_018068	TAT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
49	NC_018068	AGA	2	6	3495	3500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423463
50	NC_018068	AG	3	6	3549	3554	50 %	0 %	50 %	0 %	392423463
51	NC_018068	AGAA	2	8	3568	3575	75 %	0 %	25 %	0 %	392423463
52	NC_018068	ATCA	2	8	3586	3593	50 %	25 %	0 %	25 %	392423463
53	NC_018068	T	9	9	3641	3649	0 %	100 %	0 %	0 %	392423463
54	NC_018068	GAT	2	6	3655	3660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
55	NC_018068	TTA	2	6	3662	3667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
56	NC_018068	TAA	2	6	3759	3764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423463
57	NC_018068	A	6	6	3776	3781	100 %	0 %	0 %	0 %	392423463
58	NC_018068	TTC	2	6	3875	3880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423463
59	NC_018068	TGA	2	6	3885	3890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
60	NC_018068	TGA	2	6	3918	3923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
61	NC_018068	TTA	2	6	3969	3974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
62	NC_018068	TTA	2	6	4024	4029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
63	NC_018068	TTG	2	6	4070	4075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423463
64	NC_018068	TGA	2	6	4086	4091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
65	NC_018068	ATT	2	6	4101	4106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
66	NC_018068	GAT	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423463
67	NC_018068	CTT	2	6	4219	4224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423463
68	NC_018068	TTA	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423463
69	NC_018068	TAA	2	6	4274	4279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423463
70	NC_018068	AAC	2	6	4334	4339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423463
71	NC_018068	AGG	3	9	4381	4389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423463
72	NC_018068	TGG	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423464
73	NC_018068	TAA	2	6	4427	4432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423464
74	NC_018068	A	7	7	4431	4437	100 %	0 %	0 %	0 %	392423464
75	NC_018068	GTT	2	6	4444	4449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423464
76	NC_018068	AAGGCA	2	12	4478	4489	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	392423464
77	NC_018068	ATA	2	6	4505	4510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423464
78	NC_018068	ATTA	2	8	4563	4570	50 %	50 %	0 %	0 %	392423464
79	NC_018068	ACT	2	6	4583	4588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423464
80	NC_018068	TCA	2	6	4603	4608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423464
81	NC_018068	ACA	2	6	4609	4614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423464
82	NC_018068	GAT	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423465
83	NC_018068	CAA	2	6	4920	4925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423465
84	NC_018068	GCA	2	6	4926	4931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423465
85	NC_018068	TCA	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423465
86	NC_018068	TTG	2	6	4959	4964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423465
87	NC_018068	ATA	2	6	4965	4970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
88	NC_018068	TGA	2	6	4975	4980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423465
89	NC_018068	ATA	2	6	5028	5033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
90	NC_018068	GTTT	2	8	5108	5115	0 %	75 %	25 %	0 %	392423465
91	NC_018068	CGG	2	6	5131	5136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423465
92	NC_018068	CGG	2	6	5143	5148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423465
93	NC_018068	GTT	2	6	5201	5206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423465
94	NC_018068	CTATGA	2	12	5377	5388	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392423465
95	NC_018068	AG	3	6	5408	5413	50 %	0 %	50 %	0 %	392423465
96	NC_018068	T	6	6	5480	5485	0 %	100 %	0 %	0 %	392423465
97	NC_018068	TAA	2	6	5521	5526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
98	NC_018068	TGCA	2	8	5597	5604	25 %	25 %	25 %	25 %	392423465
99	NC_018068	AAT	2	6	5645	5650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
100	NC_018068	TTA	2	6	5709	5714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423465
101	NC_018068	A	6	6	5728	5733	100 %	0 %	0 %	0 %	392423465
102	NC_018068	GAT	2	6	5771	5776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423465
103	NC_018068	CAG	2	6	5793	5798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423465
104	NC_018068	TCA	2	6	5885	5890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423465
105	NC_018068	GCAAGG	2	12	5969	5980	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	392423465
106	NC_018068	GGT	2	6	6119	6124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423465
107	NC_018068	CGT	2	6	6146	6151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423465
108	NC_018068	GAT	2	6	6241	6246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423465
109	NC_018068	TAA	2	6	6301	6306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
110	NC_018068	TAT	2	6	6357	6362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423465
111	NC_018068	TA	4	8	6411	6418	50 %	50 %	0 %	0 %	392423465
112	NC_018068	A	6	6	6442	6447	100 %	0 %	0 %	0 %	392423465
113	NC_018068	TAA	2	6	6487	6492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423465
114	NC_018068	GA	3	6	6549	6554	50 %	0 %	50 %	0 %	392423465
115	NC_018068	AAC	2	6	6577	6582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423465
116	NC_018068	TCAGA	2	10	6633	6642	40 %	20 %	20 %	20 %	392423465
117	NC_018068	TTC	2	6	6779	6784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423466
118	NC_018068	GGAC	2	8	6870	6877	25 %	0 %	50 %	25 %	392423466
119	NC_018068	TTTA	2	8	6900	6907	25 %	75 %	0 %	0 %	392423466
120	NC_018068	ATG	2	6	7013	7018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
121	NC_018068	ATG	2	6	7202	7207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
122	NC_018068	AAG	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
123	NC_018068	TTC	2	6	7266	7271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423466
124	NC_018068	CTC	2	6	7304	7309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423466
125	NC_018068	ATG	2	6	7433	7438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
126	NC_018068	TTG	2	6	7532	7537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423466
127	NC_018068	TAA	2	6	7560	7565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423466
128	NC_018068	ATT	2	6	7699	7704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
129	NC_018068	TTG	2	6	7756	7761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423466
130	NC_018068	TAA	2	6	7770	7775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423466
131	NC_018068	ATT	2	6	7811	7816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
132	NC_018068	TGA	2	6	7926	7931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423466
133	NC_018068	AAT	2	6	7978	7983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423466
134	NC_018068	ATT	2	6	8155	8160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
135	NC_018068	GAA	2	6	8260	8265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423466
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141	NC_018068	ATT	2	6	8582	8587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423466
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262	NC_018068	ACGG	2	8	16750	16757	25 %	0 %	50 %	25 %	392423473
263	NC_018068	ACA	2	6	16834	16839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423473
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265	NC_018068	TGG	2	6	16853	16858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423473
266	NC_018068	TTA	2	6	16915	16920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423473
267	NC_018068	GCC	2	6	16984	16989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423473
268	NC_018068	TTA	2	6	17068	17073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423473
269	NC_018068	A	7	7	17075	17081	100 %	0 %	0 %	0 %	392423473
270	NC_018068	TTA	2	6	17116	17121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423473
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