MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 74800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018068	AGA	2	6	215377	215382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
3002	NC_018068	AAG	2	6	215409	215414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
3003	NC_018068	A	7	7	215463	215469	100 %	0 %	0 %	0 %	392423631
3004	NC_018068	TTC	2	6	215532	215537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423631
3005	NC_018068	AGAAA	2	10	215680	215689	80 %	0 %	20 %	0 %	392423631
3006	NC_018068	AGTT	2	8	215767	215774	25 %	50 %	25 %	0 %	392423631
3007	NC_018068	GCA	2	6	215956	215961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
3008	NC_018068	CAG	2	6	215989	215994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
3009	NC_018068	GGA	2	6	216055	216060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423631
3010	NC_018068	TC	3	6	216090	216095	0 %	50 %	0 %	50 %	392423631
3011	NC_018068	CAA	2	6	216104	216109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423631
3012	NC_018068	AG	3	6	216176	216181	50 %	0 %	50 %	0 %	392423631
3013	NC_018068	GAAA	2	8	216192	216199	75 %	0 %	25 %	0 %	392423631
3014	NC_018068	TGG	2	6	216204	216209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423631
3015	NC_018068	TCA	2	6	216292	216297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423631
3016	NC_018068	GAA	2	6	216335	216340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
3017	NC_018068	TAA	2	6	216343	216348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423631
3018	NC_018068	AG	3	6	216400	216405	50 %	0 %	50 %	0 %	392423631
3019	NC_018068	CAA	2	6	216408	216413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423631
3020	NC_018068	GGCG	2	8	216414	216421	0 %	0 %	75 %	25 %	392423631
3021	NC_018068	GCT	2	6	216440	216445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423631
3022	NC_018068	GACA	2	8	216481	216488	50 %	0 %	25 %	25 %	392423631
3023	NC_018068	GTT	2	6	216500	216505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423631
3024	NC_018068	GAA	2	6	216515	216520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
3025	NC_018068	TAT	2	6	216522	216527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423631
3026	NC_018068	GAT	2	6	216530	216535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423631
3027	NC_018068	GAA	2	6	216551	216556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
3028	NC_018068	GAG	2	6	216581	216586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423631
3029	NC_018068	AGA	2	6	216685	216690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
3030	NC_018068	T	6	6	216766	216771	0 %	100 %	0 %	0 %	392423631
3031	NC_018068	G	6	6	216813	216818	0 %	0 %	100 %	0 %	392423631
3032	NC_018068	TC	3	6	216822	216827	0 %	50 %	0 %	50 %	392423631
3033	NC_018068	GCC	2	6	216875	216880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423631
3034	NC_018068	CAG	2	6	216941	216946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
3035	NC_018068	GAA	2	6	216961	216966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
3036	NC_018068	TGAGCT	2	12	216973	216984	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392423631
3037	NC_018068	AGC	2	6	217012	217017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
3038	NC_018068	CAG	2	6	217122	217127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
3039	NC_018068	AAG	2	6	217139	217144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
3040	NC_018068	AAG	2	6	217161	217166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
3041	NC_018068	AGTA	2	8	217195	217202	50 %	25 %	25 %	0 %	392423631
3042	NC_018068	AGA	2	6	217291	217296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
3043	NC_018068	CT	3	6	217349	217354	0 %	50 %	0 %	50 %	392423631
3044	NC_018068	CAG	2	6	217361	217366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423631
3045	NC_018068	GAA	2	6	217436	217441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
3046	NC_018068	TGGC	2	8	217442	217449	0 %	25 %	50 %	25 %	392423631
3047	NC_018068	GAA	2	6	217550	217555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423631
3048	NC_018068	CTTA	2	8	217603	217610	25 %	50 %	0 %	25 %	392423631
3049	NC_018068	CTG	2	6	217681	217686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423631
3050	NC_018068	AAC	2	6	217707	217712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423631
3051	NC_018068	GATA	2	8	217738	217745	50 %	25 %	25 %	0 %	392423631
3052	NC_018068	GAT	2	6	217769	217774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423631
3053	NC_018068	C	6	6	217887	217892	0 %	0 %	0 %	100 %	392423631
3054	NC_018068	TTC	2	6	217898	217903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423631
3055	NC_018068	TGA	2	6	217953	217958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423631
3056	NC_018068	AAT	2	6	217999	218004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423631
3057	NC_018068	CGTT	2	8	218438	218445	0 %	50 %	25 %	25 %	392423632
3058	NC_018068	AGA	2	6	218473	218478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423632
3059	NC_018068	GA	3	6	218573	218578	50 %	0 %	50 %	0 %	392423632
3060	NC_018068	GAAC	2	8	218587	218594	50 %	0 %	25 %	25 %	392423632
3061	NC_018068	CTT	2	6	218635	218640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423632
3062	NC_018068	ATT	2	6	218695	218700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423632
3063	NC_018068	TGC	2	6	218721	218726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423632
3064	NC_018068	TGA	2	6	218728	218733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423632
3065	NC_018068	TA	3	6	218745	218750	50 %	50 %	0 %	0 %	392423632
3066	NC_018068	CTG	2	6	218823	218828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423632
3067	NC_018068	GAG	2	6	218858	218863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423632
3068	NC_018068	AGA	2	6	218986	218991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423632
3069	NC_018068	TTTG	2	8	219009	219016	0 %	75 %	25 %	0 %	392423632
3070	NC_018068	ATT	2	6	219033	219038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423632
3071	NC_018068	CAG	2	6	219079	219084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423632
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3073	NC_018068	GAA	2	6	219137	219142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423632
3074	NC_018068	CAA	2	6	219309	219314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423633
3075	NC_018068	GTG	2	6	219457	219462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423633
3076	NC_018068	GAA	2	6	219523	219528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423633
3077	NC_018068	CTGT	2	8	219599	219606	0 %	50 %	25 %	25 %	392423633
3078	NC_018068	TG	3	6	219607	219612	0 %	50 %	50 %	0 %	392423633
3079	NC_018068	GCG	2	6	219671	219676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423633
3080	NC_018068	GGA	2	6	219777	219782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423633
3081	NC_018068	ATGGA	2	10	219811	219820	40 %	20 %	40 %	0 %	392423633
3082	NC_018068	A	6	6	219861	219866	100 %	0 %	0 %	0 %	392423633
3083	NC_018068	GCA	2	6	219902	219907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423633
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3087	NC_018068	GATA	2	8	220100	220107	50 %	25 %	25 %	0 %	392423633
3088	NC_018068	GTT	2	6	220137	220142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423633
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3090	NC_018068	TGA	2	6	220202	220207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423633
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3092	NC_018068	ATT	2	6	220385	220390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423633
3093	NC_018068	GCT	2	6	220438	220443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423633
3094	NC_018068	AGA	2	6	220504	220509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423633
3095	NC_018068	CAA	2	6	220589	220594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423633
3096	NC_018068	TGA	2	6	220838	220843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423634
3097	NC_018068	CGG	2	6	221018	221023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423634
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3099	NC_018068	CGT	2	6	221087	221092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423634
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3101	NC_018068	TCT	2	6	221120	221125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423634
3102	NC_018068	TCCC	2	8	221152	221159	0 %	25 %	0 %	75 %	392423634
3103	NC_018068	GGC	2	6	221190	221195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423634
3104	NC_018068	GAAT	2	8	221512	221519	50 %	25 %	25 %	0 %	392423634
3105	NC_018068	TCA	2	6	221521	221526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423634
3106	NC_018068	GC	3	6	221723	221728	0 %	0 %	50 %	50 %	392423634
3107	NC_018068	TGTT	2	8	221870	221877	0 %	75 %	25 %	0 %	392423634
3108	NC_018068	ATG	2	6	221998	222003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423634
3109	NC_018068	CAA	2	6	222048	222053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423634
3110	NC_018068	GTT	2	6	222135	222140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423635
3111	NC_018068	GA	3	6	222163	222168	50 %	0 %	50 %	0 %	392423635
3112	NC_018068	CGT	2	6	222173	222178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423635
3113	NC_018068	TTA	2	6	222222	222227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423635
3114	NC_018068	GTT	2	6	222246	222251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423635
3115	NC_018068	TGA	2	6	222292	222297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423635
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3117	NC_018068	TCA	2	6	222454	222459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423635
3118	NC_018068	GAAAA	2	10	222483	222492	80 %	0 %	20 %	0 %	392423635
3119	NC_018068	TCC	2	6	222503	222508	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423635
3120	NC_018068	AGG	2	6	222539	222544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423635
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3122	NC_018068	GTT	2	6	222621	222626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423635
3123	NC_018068	G	7	7	222653	222659	0 %	0 %	100 %	0 %	392423635
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3233	NC_018068	AACC	2	8	230278	230285	50 %	0 %	0 %	50 %	392423643
3234	NC_018068	TTGC	2	8	230403	230410	0 %	50 %	25 %	25 %	392423643
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3240	NC_018068	TTC	2	6	230668	230673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423644
3241	NC_018068	TC	3	6	230672	230677	0 %	50 %	0 %	50 %	392423644
3242	NC_018068	TTA	2	6	230697	230702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423644
3243	NC_018068	A	6	6	230729	230734	100 %	0 %	0 %	0 %	392423644
3244	NC_018068	T	6	6	230757	230762	0 %	100 %	0 %	0 %	392423644
3245	NC_018068	GAG	2	6	230817	230822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423644
3246	NC_018068	CTG	2	6	230967	230972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423644
3247	NC_018068	CTT	2	6	231021	231026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423644
3248	NC_018068	GGA	2	6	231047	231052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423644
3249	NC_018068	AGC	2	6	231057	231062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423644
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3251	NC_018068	CAT	2	6	231250	231255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423644
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3254	NC_018068	CGCC	2	8	231519	231526	0 %	0 %	25 %	75 %	392423645
3255	NC_018068	ACC	2	6	231536	231541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392423645
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3258	NC_018068	TGA	2	6	231757	231762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423645
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3275	NC_018068	TCC	2	6	232508	232513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423645
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3279	NC_018068	C	6	6	232866	232871	0 %	0 %	0 %	100 %	392423646
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3283	NC_018068	TGC	2	6	233133	233138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423646
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3333	NC_018068	CGG	2	6	236754	236759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423650
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3347	NC_018068	CCTG	2	8	237320	237327	0 %	25 %	25 %	50 %	392423650
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3352	NC_018068	AGC	2	6	237476	237481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423650
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3354	NC_018068	GAA	2	6	237534	237539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423650
3355	NC_018068	AAGC	2	8	237545	237552	50 %	0 %	25 %	25 %	392423650
3356	NC_018068	GAT	2	6	237582	237587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423650
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3358	NC_018068	TTC	2	6	237676	237681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423650
3359	NC_018068	GAT	2	6	237702	237707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423650
3360	NC_018068	GC	4	8	237741	237748	0 %	0 %	50 %	50 %	392423650
3361	NC_018068	TCAT	2	8	237780	237787	25 %	50 %	0 %	25 %	392423650
3362	NC_018068	AT	3	6	237890	237895	50 %	50 %	0 %	0 %	392423650
3363	NC_018068	TC	3	6	237910	237915	0 %	50 %	0 %	50 %	392423650
3364	NC_018068	CTC	2	6	237928	237933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423650
3365	NC_018068	AAG	2	6	237980	237985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423650
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3491	NC_018068	TAA	2	6	248560	248565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423658
3492	NC_018068	GGC	2	6	248792	248797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423658
3493	NC_018068	AAT	2	6	248801	248806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423658
3494	NC_018068	CAG	2	6	248865	248870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423658
3495	NC_018068	GGT	2	6	248917	248922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423658
3496	NC_018068	GAT	2	6	248966	248971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423658
3497	NC_018068	AT	3	6	249035	249040	50 %	50 %	0 %	0 %	392423658
3498	NC_018068	TCTAT	2	10	249057	249066	20 %	60 %	0 %	20 %	392423658
3499	NC_018068	TGC	2	6	249100	249105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423658
3500	NC_018068	TAA	2	6	249193	249198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423658

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