MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 74800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018068	ATG	2	6	89509	89514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423546
1502	NC_018068	ATG	2	6	89523	89528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423546
1503	NC_018068	GAT	2	6	89646	89651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423546
1504	NC_018068	CGGA	2	8	89750	89757	25 %	0 %	50 %	25 %	392423546
1505	NC_018068	GAT	2	6	89778	89783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423546
1506	NC_018068	TCA	2	6	90139	90144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423546
1507	NC_018068	CAT	2	6	90147	90152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423546
1508	NC_018068	ATG	2	6	90300	90305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423546
1509	NC_018068	GAT	2	6	90359	90364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423546
1510	NC_018068	AAG	2	6	90378	90383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423546
1511	NC_018068	ACG	2	6	90393	90398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423546
1512	NC_018068	TGA	2	6	90509	90514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423546
1513	NC_018068	TGA	2	6	90554	90559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423546
1514	NC_018068	CGC	2	6	90661	90666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423546
1515	NC_018068	CCA	2	6	90876	90881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392423546
1516	NC_018068	AGG	2	6	90884	90889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423546
1517	NC_018068	ATCG	2	8	90903	90910	25 %	25 %	25 %	25 %	392423546
1518	NC_018068	AGA	2	6	90980	90985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423546
1519	NC_018068	ATTA	2	8	97772	97779	50 %	50 %	0 %	0 %	392423547
1520	NC_018068	TGA	2	6	97795	97800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423547
1521	NC_018068	CTG	2	6	97869	97874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423547
1522	NC_018068	ATTT	2	8	97892	97899	25 %	75 %	0 %	0 %	392423547
1523	NC_018068	GTT	2	6	98063	98068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423547
1524	NC_018068	ACT	2	6	98129	98134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423547
1525	NC_018068	TGC	2	6	98211	98216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423547
1526	NC_018068	GAA	2	6	98288	98293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423547
1527	NC_018068	GAA	2	6	98413	98418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423547
1528	NC_018068	ATT	2	6	98423	98428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423547
1529	NC_018068	AGA	3	9	100767	100775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423548
1530	NC_018068	GC	3	6	100880	100885	0 %	0 %	50 %	50 %	392423548
1531	NC_018068	AGC	2	6	100941	100946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423548
1532	NC_018068	T	6	6	100954	100959	0 %	100 %	0 %	0 %	392423548
1533	NC_018068	GA	3	6	100997	101002	50 %	0 %	50 %	0 %	392423548
1534	NC_018068	CTA	2	6	101137	101142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423548
1535	NC_018068	AGT	2	6	101320	101325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423548
1536	NC_018068	TAA	2	6	101326	101331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423548
1537	NC_018068	A	8	8	101336	101343	100 %	0 %	0 %	0 %	392423548
1538	NC_018068	GGA	2	6	101344	101349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423548
1539	NC_018068	GTT	2	6	101559	101564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423549
1540	NC_018068	GCG	2	6	101623	101628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423549
1541	NC_018068	ATG	2	6	101720	101725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423549
1542	NC_018068	GAC	2	6	101761	101766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423549
1543	NC_018068	CATA	2	8	101781	101788	50 %	25 %	0 %	25 %	392423549
1544	NC_018068	TGGCA	2	10	101805	101814	20 %	20 %	40 %	20 %	392423549
1545	NC_018068	TGCGCT	2	12	101870	101881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423549
1546	NC_018068	TTG	2	6	102032	102037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423549
1547	NC_018068	TCA	2	6	102062	102067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423549
1548	NC_018068	AAC	2	6	102411	102416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423549
1549	NC_018068	ATT	2	6	102442	102447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423549
1550	NC_018068	AGC	2	6	102517	102522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423549
1551	NC_018068	AAC	2	6	102547	102552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423549
1552	NC_018068	C	6	6	102589	102594	0 %	0 %	0 %	100 %	392423549
1553	NC_018068	TTA	2	6	102632	102637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423549
1554	NC_018068	TGG	2	6	104546	104551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423550
1555	NC_018068	AAT	2	6	104683	104688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423550
1556	NC_018068	T	6	6	104865	104870	0 %	100 %	0 %	0 %	392423550
1557	NC_018068	CATT	2	8	104895	104902	25 %	50 %	0 %	25 %	392423550
1558	NC_018068	GCG	2	6	112029	112034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423551
1559	NC_018068	TA	3	6	112052	112057	50 %	50 %	0 %	0 %	392423551
1560	NC_018068	TGG	2	6	112069	112074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423551
1561	NC_018068	TTCTT	2	10	112151	112160	0 %	80 %	0 %	20 %	392423551
1562	NC_018068	GCA	2	6	112177	112182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423551
1563	NC_018068	CAAT	2	8	112246	112253	50 %	25 %	0 %	25 %	392423551
1564	NC_018068	TAT	2	6	112314	112319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423551
1565	NC_018068	AAT	2	6	112326	112331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423551
1566	NC_018068	TGT	2	6	112496	112501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423552
1567	NC_018068	TTA	2	6	112532	112537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423552
1568	NC_018068	ATA	4	12	112552	112563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423552
1569	NC_018068	TAT	2	6	112576	112581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423552
1570	NC_018068	GTT	2	6	112654	112659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423552
1571	NC_018068	GCT	2	6	112663	112668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423552
1572	NC_018068	GAG	2	6	112675	112680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423552
1573	NC_018068	TGG	2	6	112751	112756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423552
1574	NC_018068	TTG	2	6	113074	113079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423552
1575	NC_018068	ATA	2	6	113093	113098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423552
1576	NC_018068	TGG	2	6	113121	113126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423552
1577	NC_018068	CTGA	2	8	113185	113192	25 %	25 %	25 %	25 %	392423552
1578	NC_018068	ATG	2	6	113249	113254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423552
1579	NC_018068	TTC	2	6	113350	113355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423552
1580	NC_018068	TAA	2	6	113360	113365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423552
1581	NC_018068	T	7	7	113448	113454	0 %	100 %	0 %	0 %	392423552
1582	NC_018068	ATG	2	6	113455	113460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423552
1583	NC_018068	AT	3	6	113553	113558	50 %	50 %	0 %	0 %	392423552
1584	NC_018068	TA	3	6	113605	113610	50 %	50 %	0 %	0 %	392423552
1585	NC_018068	TGT	2	6	113733	113738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423552
1586	NC_018068	A	6	6	113746	113751	100 %	0 %	0 %	0 %	392423552
1587	NC_018068	CAA	2	6	113756	113761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423552
1588	NC_018068	CAAA	2	8	115466	115473	75 %	0 %	0 %	25 %	392423553
1589	NC_018068	TGC	2	6	115607	115612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423553
1590	NC_018068	GGC	2	6	115660	115665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423553
1591	NC_018068	TCAA	2	8	115667	115674	50 %	25 %	0 %	25 %	392423553
1592	NC_018068	CGT	2	6	115679	115684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423553
1593	NC_018068	TGA	2	6	115718	115723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423553
1594	NC_018068	AACC	2	8	115753	115760	50 %	0 %	0 %	50 %	392423553
1595	NC_018068	ATT	2	6	115772	115777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423553
1596	NC_018068	ATC	2	6	115874	115879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423553
1597	NC_018068	GCA	2	6	115991	115996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423553
1598	NC_018068	CTG	2	6	116034	116039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423553
1599	NC_018068	T	6	6	116045	116050	0 %	100 %	0 %	0 %	392423553
1600	NC_018068	TGCC	2	8	116052	116059	0 %	25 %	25 %	50 %	392423553
1601	NC_018068	GGA	2	6	116060	116065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423553
1602	NC_018068	TCA	2	6	116165	116170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423553
1603	NC_018068	AAT	2	6	116213	116218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423553
1604	NC_018068	ACG	2	6	116239	116244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423553
1605	NC_018068	AAG	2	6	116283	116288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423553
1606	NC_018068	AAT	2	6	116324	116329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423553
1607	NC_018068	T	6	6	116490	116495	0 %	100 %	0 %	0 %	392423553
1608	NC_018068	CTT	2	6	117093	117098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423554
1609	NC_018068	TTC	2	6	117105	117110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423554
1610	NC_018068	GCT	2	6	117166	117171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423554
1611	NC_018068	TTC	2	6	117228	117233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423554
1612	NC_018068	ATTT	2	8	117285	117292	25 %	75 %	0 %	0 %	392423554
1613	NC_018068	GTT	2	6	117345	117350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423554
1614	NC_018068	CTT	2	6	117401	117406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423554
1615	NC_018068	GAT	2	6	117453	117458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423554
1616	NC_018068	CTA	2	6	117536	117541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423554
1617	NC_018068	ATTC	2	8	117609	117616	25 %	50 %	0 %	25 %	392423554
1618	NC_018068	GGC	2	6	117623	117628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423554
1619	NC_018068	AAG	2	6	117684	117689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392423554
1620	NC_018068	TAA	2	6	117695	117700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423554
1621	NC_018068	ACG	2	6	117796	117801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423554
1622	NC_018068	TCA	2	6	117820	117825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423554
1623	NC_018068	T	6	6	117849	117854	0 %	100 %	0 %	0 %	392423554
1624	NC_018068	TTC	2	6	117861	117866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423554
1625	NC_018068	GCC	2	6	117909	117914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423554
1626	NC_018068	GGTT	2	8	117918	117925	0 %	50 %	50 %	0 %	392423554
1627	NC_018068	CAA	2	6	117944	117949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423554
1628	NC_018068	TTCC	2	8	118025	118032	0 %	50 %	0 %	50 %	392423554
1629	NC_018068	CCGTT	2	10	118082	118091	0 %	40 %	20 %	40 %	392423554
1630	NC_018068	ACG	2	6	118096	118101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423554
1631	NC_018068	TGC	2	6	118256	118261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423554
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1633	NC_018068	TGTTAT	2	12	118494	118505	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	392423555
1634	NC_018068	CAGC	2	8	118511	118518	25 %	0 %	25 %	50 %	392423555
1635	NC_018068	TGTT	2	8	118665	118672	0 %	75 %	25 %	0 %	392423555
1636	NC_018068	CAG	2	6	118773	118778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423555
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1638	NC_018068	GCT	2	6	118975	118980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423555
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1641	NC_018068	CGT	2	6	119087	119092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423555
1642	NC_018068	T	7	7	119118	119124	0 %	100 %	0 %	0 %	392423555
1643	NC_018068	GGCTT	2	10	119191	119200	0 %	40 %	40 %	20 %	392423555
1644	NC_018068	ATTTT	2	10	119235	119244	20 %	80 %	0 %	0 %	392423555
1645	NC_018068	TAA	2	6	119277	119282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423556
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1649	NC_018068	CGT	2	6	119383	119388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423556
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1652	NC_018068	AGG	2	6	119562	119567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423556
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1656	NC_018068	AT	3	6	119781	119786	50 %	50 %	0 %	0 %	392423556
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1660	NC_018068	TTGA	2	8	120113	120120	25 %	50 %	25 %	0 %	392423556
1661	NC_018068	GAC	2	6	120122	120127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423556
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1682	NC_018068	CGG	2	6	122242	122247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423558
1683	NC_018068	TAT	2	6	122306	122311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423558
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1685	NC_018068	TTCT	2	8	122387	122394	0 %	75 %	0 %	25 %	392423558
1686	NC_018068	TCT	2	6	122559	122564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423558
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1732	NC_018068	AG	3	6	126264	126269	50 %	0 %	50 %	0 %	392423561
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1737	NC_018068	ATG	3	9	126556	126564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423561
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1740	NC_018068	TGA	2	6	126752	126757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423561
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1989	NC_018068	GA	3	6	143281	143286	50 %	0 %	50 %	0 %	392423575
1990	NC_018068	CTT	2	6	143346	143351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423575
1991	NC_018068	GCA	2	6	143352	143357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423575
1992	NC_018068	TGG	2	6	143409	143414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423576
1993	NC_018068	AGT	2	6	143509	143514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423576
1994	NC_018068	TC	3	6	143531	143536	0 %	50 %	0 %	50 %	392423576
1995	NC_018068	AGG	2	6	143628	143633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423576
1996	NC_018068	TGCTC	2	10	143727	143736	0 %	40 %	20 %	40 %	392423576
1997	NC_018068	GC	3	6	143774	143779	0 %	0 %	50 %	50 %	392423576
1998	NC_018068	AGG	2	6	143785	143790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423576
1999	NC_018068	CCT	2	6	143804	143809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423576
2000	NC_018068	GA	3	6	143823	143828	50 %	0 %	50 %	0 %	392423576

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