MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 chromosome

Total Repeats: 74800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018068	CTTTAA	2	12	410967	410978	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	392423815
6002	NC_018068	GAG	2	6	411015	411020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423815
6003	NC_018068	GACA	2	8	411085	411092	50 %	0 %	25 %	25 %	392423815
6004	NC_018068	GGA	2	6	411154	411159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392423815
6005	NC_018068	GTT	2	6	411189	411194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423815
6006	NC_018068	TCA	2	6	411225	411230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423815
6007	NC_018068	CAT	2	6	411232	411237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423815
6008	NC_018068	TCCA	2	8	411284	411291	25 %	25 %	0 %	50 %	392423815
6009	NC_018068	TGG	2	6	411298	411303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423815
6010	NC_018068	TTGGAA	2	12	411372	411383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423815
6011	NC_018068	TGTCAA	2	12	411430	411441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	392423815
6012	NC_018068	AAT	2	6	411656	411661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423815
6013	NC_018068	TGGA	2	8	411667	411674	25 %	25 %	50 %	0 %	392423815
6014	NC_018068	CGG	2	6	411682	411687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423815
6015	NC_018068	T	7	7	411759	411765	0 %	100 %	0 %	0 %	392423815
6016	NC_018068	ATA	2	6	411926	411931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423815
6017	NC_018068	TAT	2	6	411985	411990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423815
6018	NC_018068	CAAG	2	8	411997	412004	50 %	0 %	25 %	25 %	392423815
6019	NC_018068	GCA	2	6	412041	412046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423815
6020	NC_018068	CGA	2	6	412057	412062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423815
6021	NC_018068	TAT	2	6	412289	412294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423816
6022	NC_018068	CTT	2	6	412311	412316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423816
6023	NC_018068	CGG	2	6	412421	412426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423816
6024	NC_018068	ATA	2	6	412453	412458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423816
6025	NC_018068	GCT	2	6	412497	412502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423816
6026	NC_018068	GCA	2	6	412520	412525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423816
6027	NC_018068	TCA	2	6	412528	412533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423816
6028	NC_018068	GTC	2	6	412575	412580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423816
6029	NC_018068	AGT	2	6	412701	412706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423816
6030	NC_018068	GGT	2	6	412749	412754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392423816
6031	NC_018068	TAA	2	6	412760	412765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423816
6032	NC_018068	GAAATA	2	12	412770	412781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	392423816
6033	NC_018068	ATC	2	6	412782	412787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423816
6034	NC_018068	CGG	2	6	412897	412902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423816
6035	NC_018068	T	6	6	412907	412912	0 %	100 %	0 %	0 %	392423816
6036	NC_018068	GAT	2	6	412932	412937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423816
6037	NC_018068	TCC	2	6	412984	412989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423816
6038	NC_018068	AAAGC	2	10	412994	413003	60 %	0 %	20 %	20 %	392423816
6039	NC_018068	TCA	2	6	413045	413050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423816
6040	NC_018068	CAA	2	6	413103	413108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423816
6041	NC_018068	AGC	2	6	413204	413209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423816
6042	NC_018068	T	6	6	413242	413247	0 %	100 %	0 %	0 %	392423816
6043	NC_018068	TGT	2	6	413274	413279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392423816
6044	NC_018068	CT	3	6	413346	413351	0 %	50 %	0 %	50 %	392423816
6045	NC_018068	T	6	6	413430	413435	0 %	100 %	0 %	0 %	392423816
6046	NC_018068	AGCA	2	8	413466	413473	50 %	0 %	25 %	25 %	392423816
6047	NC_018068	T	7	7	413474	413480	0 %	100 %	0 %	0 %	392423816
6048	NC_018068	TCA	3	9	413504	413512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423816
6049	NC_018068	TTC	2	6	413612	413617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423817
6050	NC_018068	AGC	2	6	413648	413653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423817
6051	NC_018068	TGC	2	6	413683	413688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423817
6052	NC_018068	GCAG	2	8	413690	413697	25 %	0 %	50 %	25 %	392423817
6053	NC_018068	TTTCC	2	10	413761	413770	0 %	60 %	0 %	40 %	392423817
6054	NC_018068	TGAC	2	8	413820	413827	25 %	25 %	25 %	25 %	392423817
6055	NC_018068	CTT	2	6	413862	413867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423817
6056	NC_018068	ATA	2	6	413892	413897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423817
6057	NC_018068	CGG	2	6	413902	413907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423817
6058	NC_018068	GAAT	2	8	413928	413935	50 %	25 %	25 %	0 %	392423817
6059	NC_018068	TTC	2	6	413936	413941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423817
6060	NC_018068	ACA	2	6	413961	413966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423817
6061	NC_018068	GTACC	2	10	414058	414067	20 %	20 %	20 %	40 %	392423817
6062	NC_018068	CCG	2	6	414072	414077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392423817
6063	NC_018068	AGC	2	6	414153	414158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423818
6064	NC_018068	AG	3	6	414273	414278	50 %	0 %	50 %	0 %	392423818
6065	NC_018068	ATA	2	6	414317	414322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423818
6066	NC_018068	TTA	2	6	414335	414340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423818
6067	NC_018068	GAT	2	6	414341	414346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423818
6068	NC_018068	CTT	2	6	414348	414353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423818
6069	NC_018068	GCA	2	6	414359	414364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423818
6070	NC_018068	CAT	2	6	414463	414468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423818
6071	NC_018068	TTCCGG	2	12	414474	414485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423818
6072	NC_018068	TGA	2	6	414494	414499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423818
6073	NC_018068	GAT	2	6	414529	414534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423818
6074	NC_018068	AAC	2	6	414732	414737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423818
6075	NC_018068	CA	3	6	414819	414824	50 %	0 %	0 %	50 %	392423818
6076	NC_018068	AGC	2	6	414880	414885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392423818
6077	NC_018068	TTC	2	6	415051	415056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423818
6078	NC_018068	AGGGA	2	10	415108	415117	40 %	0 %	60 %	0 %	392423818
6079	NC_018068	TCC	2	6	415195	415200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392423818
6080	NC_018068	GGC	2	6	415201	415206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392423818
6081	NC_018068	CTTT	2	8	415212	415219	0 %	75 %	0 %	25 %	392423818
6082	NC_018068	GCTGA	2	10	415264	415273	20 %	20 %	40 %	20 %	392423818
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6085	NC_018068	TTC	2	6	415378	415383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423818
6086	NC_018068	AC	3	6	415408	415413	50 %	0 %	0 %	50 %	392423818
6087	NC_018068	GTA	2	6	415418	415423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423818
6088	NC_018068	TAT	2	6	415443	415448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423818
6089	NC_018068	ATC	2	6	415478	415483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423818
6090	NC_018068	CTT	2	6	415491	415496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392423818
6091	NC_018068	TCTG	2	8	415559	415566	0 %	50 %	25 %	25 %	392423818
6092	NC_018068	ATC	2	6	415585	415590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423818
6093	NC_018068	TCA	2	6	415638	415643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392423818
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6096	NC_018068	TGAC	2	8	415746	415753	25 %	25 %	25 %	25 %	392423818
6097	NC_018068	CGACTC	2	12	415833	415844	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	392423818
6098	NC_018068	TAA	2	6	415885	415890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	392423818
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6101	NC_018068	A	6	6	416504	416509	100 %	0 %	0 %	0 %	392423819
6102	NC_018068	TGC	2	6	416567	416572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392423819
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6104	NC_018068	TTA	2	6	416667	416672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423819
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6109	NC_018068	ATG	2	6	416905	416910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423819
6110	NC_018068	AGT	2	6	416997	417002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392423819
6111	NC_018068	AAAC	2	8	417051	417058	75 %	0 %	0 %	25 %	392423819
6112	NC_018068	ATT	2	6	417105	417110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392423819
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6115	NC_018068	GGTTAT	2	12	417369	417380	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	392423819
6116	NC_018068	TA	4	8	417484	417491	50 %	50 %	0 %	0 %	392423819
6117	NC_018068	AAC	2	6	417496	417501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423819
6118	NC_018068	AT	3	6	418058	418063	50 %	50 %	0 %	0 %	392423820
6119	NC_018068	CAA	2	6	418064	418069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392423820
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6121	NC_018068	T	6	6	418105	418110	0 %	100 %	0 %	0 %	392423820
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