MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfurococcus fermentans DSM 16532 chromosome

Total Repeats: 24393

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018001	CT	3	6	218363	218368	0 %	50 %	0 %	50 %	390937986
4002	NC_018001	TGC	2	6	218378	218383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390937986
4003	NC_018001	TATGC	2	10	218424	218433	20 %	40 %	20 %	20 %	390937986
4004	NC_018001	CCT	2	6	218485	218490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937986
4005	NC_018001	GAG	2	6	218624	218629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937986
4006	NC_018001	ATA	2	6	218642	218647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937986
4007	NC_018001	CCT	2	6	218716	218721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937986
4008	NC_018001	CT	3	6	218753	218758	0 %	50 %	0 %	50 %	390937986
4009	NC_018001	TATCT	2	10	218813	218822	20 %	60 %	0 %	20 %	390937986
4010	NC_018001	CTC	2	6	218840	218845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937986
4011	NC_018001	TA	3	6	218902	218907	50 %	50 %	0 %	0 %	390937986
4012	NC_018001	GTA	2	6	218909	218914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937986
4013	NC_018001	AGG	2	6	218932	218937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390937986
4014	NC_018001	CTTC	2	8	219001	219008	0 %	50 %	0 %	50 %	390937986
4015	NC_018001	TTC	2	6	219033	219038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937986
4016	NC_018001	GAA	2	6	219312	219317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937987
4017	NC_018001	CTC	2	6	219436	219441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	390937987
4018	NC_018001	TTC	2	6	219458	219463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937987
4019	NC_018001	TTA	2	6	219475	219480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937987
4020	NC_018001	TCCC	2	8	219490	219497	0 %	25 %	0 %	75 %	390937987
4021	NC_018001	CATA	2	8	219593	219600	50 %	25 %	0 %	25 %	390937987
4022	NC_018001	GA	3	6	219607	219612	50 %	0 %	50 %	0 %	390937987
4023	NC_018001	TAT	2	6	219627	219632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937987
4024	NC_018001	AGT	2	6	219643	219648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937987
4025	NC_018001	GCT	2	6	219730	219735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	390937987
4026	NC_018001	TA	3	6	219766	219771	50 %	50 %	0 %	0 %	390937987
4027	NC_018001	ATT	2	6	219859	219864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937987
4028	NC_018001	TGG	2	6	219876	219881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937987
4029	NC_018001	CTTA	2	8	219893	219900	25 %	50 %	0 %	25 %	390937987
4030	NC_018001	TTA	2	6	219910	219915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937987
4031	NC_018001	GTG	2	6	219967	219972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937987
4032	NC_018001	TTC	3	9	220000	220008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937987
4033	NC_018001	GCG	2	6	220034	220039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390937987
4034	NC_018001	ATA	2	6	220042	220047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390937987
4035	NC_018001	AT	3	6	220080	220085	50 %	50 %	0 %	0 %	390937987
4036	NC_018001	TTC	2	6	220108	220113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	390937987
4037	NC_018001	ATT	2	6	220146	220151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937987
4038	NC_018001	TAT	2	6	220157	220162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937987
4039	NC_018001	CCA	2	6	220177	220182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390937987
4040	NC_018001	GAA	2	6	220223	220228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937987
4041	NC_018001	TAT	2	6	220235	220240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937987
4042	NC_018001	CTA	2	6	220326	220331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937987
4043	NC_018001	AG	3	6	220345	220350	50 %	0 %	50 %	0 %	390937987
4044	NC_018001	GGT	2	6	220356	220361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937987
4045	NC_018001	GA	3	6	220423	220428	50 %	0 %	50 %	0 %	390937987
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4048	NC_018001	TAT	2	6	220574	220579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937987
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4050	NC_018001	AGA	2	6	220679	220684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390937987
4051	NC_018001	ATT	2	6	220896	220901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937987
4052	NC_018001	TAC	2	6	220910	220915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937987
4053	NC_018001	GGC	2	6	220932	220937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	390937987
4054	NC_018001	ATT	2	6	220953	220958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937987
4055	NC_018001	ATT	2	6	221024	221029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937988
4056	NC_018001	CAA	2	6	221132	221137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390937988
4057	NC_018001	AAC	2	6	221169	221174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390937988
4058	NC_018001	CTAT	2	8	221241	221248	25 %	50 %	0 %	25 %	390937988
4059	NC_018001	ACA	2	6	221269	221274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390937988
4060	NC_018001	TGT	2	6	221336	221341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390937988
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4062	NC_018001	AT	3	6	221469	221474	50 %	50 %	0 %	0 %	390937988
4063	NC_018001	AAC	2	6	221493	221498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390937988
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4070	NC_018001	AT	3	6	222130	222135	50 %	50 %	0 %	0 %	390937989
4071	NC_018001	GATA	2	8	222148	222155	50 %	25 %	25 %	0 %	390937989
4072	NC_018001	TA	3	6	222154	222159	50 %	50 %	0 %	0 %	390937989
4073	NC_018001	AGT	2	6	222167	222172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937989
4074	NC_018001	CATG	2	8	222195	222202	25 %	25 %	25 %	25 %	390937989
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4081	NC_018001	TGG	2	6	222502	222507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937989
4082	NC_018001	TAG	3	9	222636	222644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937989
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4089	NC_018001	AATA	2	8	222827	222834	75 %	25 %	0 %	0 %	390937990
4090	NC_018001	AATA	2	8	222863	222870	75 %	25 %	0 %	0 %	390937990
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4093	NC_018001	GTT	2	6	222996	223001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390937990
4094	NC_018001	AT	3	6	223023	223028	50 %	50 %	0 %	0 %	390937990
4095	NC_018001	GA	3	6	223176	223181	50 %	0 %	50 %	0 %	390937990
4096	NC_018001	TGA	2	6	223213	223218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937990
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4103	NC_018001	ACTA	2	8	223608	223615	50 %	25 %	0 %	25 %	390937990
4104	NC_018001	AT	3	6	223629	223634	50 %	50 %	0 %	0 %	390937990
4105	NC_018001	ACA	2	6	223661	223666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	390937990
4106	NC_018001	GGAT	2	8	223668	223675	25 %	25 %	50 %	0 %	390937990
4107	NC_018001	TAT	2	6	223826	223831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937990
4108	NC_018001	AAAT	2	8	223873	223880	75 %	25 %	0 %	0 %	390937990
4109	NC_018001	TATAT	2	10	223988	223997	40 %	60 %	0 %	0 %	390937990
4110	NC_018001	AT	4	8	224020	224027	50 %	50 %	0 %	0 %	390937990
4111	NC_018001	AATC	2	8	224058	224065	50 %	25 %	0 %	25 %	390937990
4112	NC_018001	ATT	2	6	224141	224146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	390937990
4113	NC_018001	GTG	2	6	224152	224157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	390937990
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4118	NC_018001	GTA	2	6	224301	224306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390937990
4119	NC_018001	TA	3	6	224305	224310	50 %	50 %	0 %	0 %	390937990
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4123	NC_018001	ACT	2	6	224555	224560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937990
4124	NC_018001	ACT	2	6	224633	224638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	390937990
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4247	NC_018001	TC	3	6	230473	230478	0 %	50 %	0 %	50 %	390937997
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4353	NC_018001	AAG	2	6	237054	237059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938006
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4356	NC_018001	CCA	3	9	237147	237155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	390938006
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4360	NC_018001	AAT	2	6	237306	237311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	390938006
4361	NC_018001	AGCAG	2	10	237361	237370	40 %	0 %	40 %	20 %	390938006
4362	NC_018001	AGA	2	6	237406	237411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	390938006
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4364	NC_018001	AATG	2	8	238551	238558	50 %	25 %	25 %	0 %	390938008
4365	NC_018001	CCTGT	2	10	238562	238571	0 %	40 %	20 %	40 %	390938008
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4492	NC_018001	GTTGGT	2	12	244641	244652	0 %	50 %	50 %	0 %	390938013
4493	NC_018001	GTT	2	6	244695	244700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	390938013
4494	NC_018001	TGA	2	6	244710	244715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938013
4495	NC_018001	TGA	2	6	244733	244738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	390938013
4496	NC_018001	GAG	2	6	244794	244799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938013
4497	NC_018001	GCAC	2	8	244848	244855	25 %	0 %	25 %	50 %	390938013
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4499	NC_018001	GAG	2	6	244876	244881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	390938013
4500	NC_018001	AT	3	6	244904	244909	50 %	50 %	0 %	0 %	390938013

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