MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 plasmid pDEVAL01

Total Repeats: 417

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017311	CCAT	2	8	208	215	25 %	25 %	0 %	50 %	387133887
2	NC_017311	GACG	2	8	385	392	25 %	0 %	50 %	25 %	387133887
3	NC_017311	CATG	2	8	1161	1168	25 %	25 %	25 %	25 %	387133888
4	NC_017311	CGGT	2	8	2598	2605	0 %	25 %	50 %	25 %	387133889
5	NC_017311	GTCC	2	8	3853	3860	0 %	25 %	25 %	50 %	387133890
6	NC_017311	GTGG	2	8	4321	4328	0 %	25 %	75 %	0 %	387133890
7	NC_017311	GCAC	2	8	6083	6090	25 %	0 %	25 %	50 %	387133891
8	NC_017311	GTCC	2	8	6640	6647	0 %	25 %	25 %	50 %	387133892
9	NC_017311	GTCC	2	8	6712	6719	0 %	25 %	25 %	50 %	387133892
10	NC_017311	GTCC	2	8	6739	6746	0 %	25 %	25 %	50 %	387133892
11	NC_017311	GTCC	2	8	6793	6800	0 %	25 %	25 %	50 %	387133892
12	NC_017311	GGTC	2	8	7903	7910	0 %	25 %	50 %	25 %	387133892
13	NC_017311	GCTG	2	8	8062	8069	0 %	25 %	50 %	25 %	387133892
14	NC_017311	CCCG	2	8	8121	8128	0 %	0 %	25 %	75 %	387133892
15	NC_017311	GGCG	2	8	8222	8229	0 %	0 %	75 %	25 %	387133892
16	NC_017311	CCGT	2	8	8343	8350	0 %	25 %	25 %	50 %	387133892
17	NC_017311	CTGT	2	8	8352	8359	0 %	50 %	25 %	25 %	387133892
18	NC_017311	TGCC	2	8	10482	10489	0 %	25 %	25 %	50 %	387133894
19	NC_017311	GGCA	2	8	10624	10631	25 %	0 %	50 %	25 %	387133894
20	NC_017311	GATG	2	8	11012	11019	25 %	25 %	50 %	0 %	387133895
21	NC_017311	GCGG	2	8	11150	11157	0 %	0 %	75 %	25 %	387133895
22	NC_017311	GGTC	2	8	12386	12393	0 %	25 %	50 %	25 %	387133895
23	NC_017311	GGGC	2	8	12628	12635	0 %	0 %	75 %	25 %	387133896
24	NC_017311	CTTC	2	8	12805	12812	0 %	50 %	0 %	50 %	387133896
25	NC_017311	CGTT	2	8	13689	13696	0 %	50 %	25 %	25 %	387133898
26	NC_017311	GCAC	2	8	15525	15532	25 %	0 %	25 %	50 %	387133899
27	NC_017311	GCTG	2	8	15692	15699	0 %	25 %	50 %	25 %	387133899
28	NC_017311	TATG	2	8	17833	17840	25 %	50 %	25 %	0 %	387133901
29	NC_017311	TGGT	2	8	18006	18013	0 %	50 %	50 %	0 %	387133901
30	NC_017311	ACGT	2	8	18183	18190	25 %	25 %	25 %	25 %	387133901
31	NC_017311	ATGG	2	8	19147	19154	25 %	25 %	50 %	0 %	387133902
32	NC_017311	GTTG	2	8	19458	19465	0 %	50 %	50 %	0 %	387133902
33	NC_017311	GCCA	2	8	20301	20308	25 %	0 %	25 %	50 %	387133903
34	NC_017311	GGCA	2	8	20394	20401	25 %	0 %	50 %	25 %	387133903
35	NC_017311	CCGG	2	8	20637	20644	0 %	0 %	50 %	50 %	387133903
36	NC_017311	CTGC	2	8	21794	21801	0 %	25 %	25 %	50 %	387133904
37	NC_017311	GCGG	2	8	21914	21921	0 %	0 %	75 %	25 %	387133904
38	NC_017311	GCCC	3	12	22349	22360	0 %	0 %	25 %	75 %	387133905
39	NC_017311	CCGC	2	8	23416	23423	0 %	0 %	25 %	75 %	387133906
40	NC_017311	GCCT	2	8	24315	24322	0 %	25 %	25 %	50 %	387133907
41	NC_017311	CGTG	2	8	24439	24446	0 %	25 %	50 %	25 %	387133907
42	NC_017311	GCCC	2	8	24563	24570	0 %	0 %	25 %	75 %	387133907
43	NC_017311	GTCG	2	8	24596	24603	0 %	25 %	50 %	25 %	387133907
44	NC_017311	CACG	2	8	24748	24755	25 %	0 %	25 %	50 %	387133907
45	NC_017311	GCCT	2	8	25131	25138	0 %	25 %	25 %	50 %	387133907
46	NC_017311	CTGA	2	8	26924	26931	25 %	25 %	25 %	25 %	387133909
47	NC_017311	CAGC	2	8	29418	29425	25 %	0 %	25 %	50 %	387133911
48	NC_017311	AGGT	2	8	29938	29945	25 %	25 %	50 %	0 %	387133911
49	NC_017311	TGGA	2	8	30686	30693	25 %	25 %	50 %	0 %	387133912
50	NC_017311	AGGC	2	8	31461	31468	25 %	0 %	50 %	25 %	387133913
51	NC_017311	GGCG	2	8	31476	31483	0 %	0 %	75 %	25 %	387133913
52	NC_017311	GGCA	2	8	31817	31824	25 %	0 %	50 %	25 %	387133914
53	NC_017311	CTGC	2	8	32341	32348	0 %	25 %	25 %	50 %	387133914
54	NC_017311	CATG	2	8	32425	32432	25 %	25 %	25 %	25 %	387133914
55	NC_017311	CGTC	2	8	32500	32507	0 %	25 %	25 %	50 %	387133914
56	NC_017311	GCCT	2	8	32826	32833	0 %	25 %	25 %	50 %	387133914
57	NC_017311	GATG	2	8	32839	32846	25 %	25 %	50 %	0 %	387133914
58	NC_017311	GATG	2	8	33739	33746	25 %	25 %	50 %	0 %	387133914
59	NC_017311	GATG	2	8	34596	34603	25 %	25 %	50 %	0 %	387133914
60	NC_017311	GACG	2	8	37116	37123	25 %	0 %	50 %	25 %	387133916
61	NC_017311	GCGG	2	8	38881	38888	0 %	0 %	75 %	25 %	387133917
62	NC_017311	TGGC	2	8	39392	39399	0 %	25 %	50 %	25 %	387133917
63	NC_017311	CGCC	2	8	39406	39413	0 %	0 %	25 %	75 %	387133917
64	NC_017311	GGCT	2	8	39575	39582	0 %	25 %	50 %	25 %	387133917
65	NC_017311	TCGG	2	8	40252	40259	0 %	25 %	50 %	25 %	387133918
66	NC_017311	GGTC	2	8	40745	40752	0 %	25 %	50 %	25 %	387133918
67	NC_017311	GACG	2	8	40888	40895	25 %	0 %	50 %	25 %	387133918
68	NC_017311	GTCG	2	8	41196	41203	0 %	25 %	50 %	25 %	387133919
69	NC_017311	GGCA	2	8	41341	41348	25 %	0 %	50 %	25 %	387133919
70	NC_017311	GGGT	2	8	42244	42251	0 %	25 %	75 %	0 %	387133919
71	NC_017311	CAGG	2	8	42375	42382	25 %	0 %	50 %	25 %	387133919
72	NC_017311	CGCC	2	8	44510	44517	0 %	0 %	25 %	75 %	387133921
73	NC_017311	GACC	2	8	45587	45594	25 %	0 %	25 %	50 %	387133922
74	NC_017311	CCTT	2	8	45721	45728	0 %	50 %	0 %	50 %	387133922
75	NC_017311	GGCA	2	8	46029	46036	25 %	0 %	50 %	25 %	387133922
76	NC_017311	AGCG	2	8	46053	46060	25 %	0 %	50 %	25 %	387133922
77	NC_017311	ACCA	2	8	46633	46640	50 %	0 %	0 %	50 %	387133923
78	NC_017311	TGCG	2	8	46670	46677	0 %	25 %	50 %	25 %	387133923
79	NC_017311	CAGC	2	8	46998	47005	25 %	0 %	25 %	50 %	387133923
80	NC_017311	GGCG	2	8	47106	47113	0 %	0 %	75 %	25 %	387133923
81	NC_017311	CACC	2	8	48106	48113	25 %	0 %	0 %	75 %	387133924
82	NC_017311	GCCC	2	8	48446	48453	0 %	0 %	25 %	75 %	387133925
83	NC_017311	GCGT	2	8	48540	48547	0 %	25 %	50 %	25 %	387133925
84	NC_017311	CGGG	2	8	48651	48658	0 %	0 %	75 %	25 %	387133925
85	NC_017311	TGGC	2	8	49789	49796	0 %	25 %	50 %	25 %	387133925
86	NC_017311	CCCA	2	8	49816	49823	25 %	0 %	0 %	75 %	387133925
87	NC_017311	GCCC	2	8	50172	50179	0 %	0 %	25 %	75 %	387133926
88	NC_017311	CGTC	4	16	50230	50245	0 %	25 %	25 %	50 %	387133926
89	NC_017311	TGCG	2	8	50595	50602	0 %	25 %	50 %	25 %	387133926
90	NC_017311	CCCG	2	8	51025	51032	0 %	0 %	25 %	75 %	387133926
91	NC_017311	CTGC	2	8	51119	51126	0 %	25 %	25 %	50 %	387133926
92	NC_017311	CGTG	2	8	51617	51624	0 %	25 %	50 %	25 %	387133927
93	NC_017311	TGCC	2	8	51707	51714	0 %	25 %	25 %	50 %	387133927
94	NC_017311	ACCG	2	8	52044	52051	25 %	0 %	25 %	50 %	387133927
95	NC_017311	GGGC	2	8	53024	53031	0 %	0 %	75 %	25 %	387133928
96	NC_017311	GGCG	2	8	53570	53577	0 %	0 %	75 %	25 %	387133928
97	NC_017311	CCCG	2	8	53927	53934	0 %	0 %	25 %	75 %	387133928
98	NC_017311	CCCG	2	8	53963	53970	0 %	0 %	25 %	75 %	387133928
99	NC_017311	CGCC	2	8	54172	54179	0 %	0 %	25 %	75 %	387133928
100	NC_017311	CAGG	2	8	54304	54311	25 %	0 %	50 %	25 %	387133928
101	NC_017311	CGCA	2	8	54338	54345	25 %	0 %	25 %	50 %	387133929
102	NC_017311	GCCT	2	8	54909	54916	0 %	25 %	25 %	50 %	387133929
103	NC_017311	GCGT	2	8	54946	54953	0 %	25 %	50 %	25 %	387133929
104	NC_017311	CGTC	2	8	56003	56010	0 %	25 %	25 %	50 %	387133930
105	NC_017311	ACGG	2	8	56844	56851	25 %	0 %	50 %	25 %	387133930
106	NC_017311	GGCG	2	8	57181	57188	0 %	0 %	75 %	25 %	387133931
107	NC_017311	GCCT	2	8	57362	57369	0 %	25 %	25 %	50 %	387133931
108	NC_017311	GTGG	2	8	57391	57398	0 %	25 %	75 %	0 %	387133931
109	NC_017311	GCCA	2	8	57598	57605	25 %	0 %	25 %	50 %	387133931
110	NC_017311	GCCA	2	8	57721	57728	25 %	0 %	25 %	50 %	387133931
111	NC_017311	CCTC	2	8	58113	58120	0 %	25 %	0 %	75 %	387133931
112	NC_017311	GCAC	2	8	59068	59075	25 %	0 %	25 %	50 %	387133932
113	NC_017311	GACA	2	8	59398	59405	50 %	0 %	25 %	25 %	387133933
114	NC_017311	TCGT	3	12	59530	59541	0 %	50 %	25 %	25 %	387133934
115	NC_017311	GCGG	2	8	59688	59695	0 %	0 %	75 %	25 %	387133934
116	NC_017311	GCCC	2	8	60075	60082	0 %	0 %	25 %	75 %	387133934
117	NC_017311	GAGG	2	8	60115	60122	25 %	0 %	75 %	0 %	387133934
118	NC_017311	GACC	2	8	60575	60582	25 %	0 %	25 %	50 %	387133935
119	NC_017311	CCCG	2	8	60940	60947	0 %	0 %	25 %	75 %	387133935
120	NC_017311	GCCC	2	8	61019	61026	0 %	0 %	25 %	75 %	387133935
121	NC_017311	CTTC	2	8	61348	61355	0 %	50 %	0 %	50 %	387133935
122	NC_017311	TCTG	2	8	61770	61777	0 %	50 %	25 %	25 %	387133936
123	NC_017311	CTGC	2	8	62759	62766	0 %	25 %	25 %	50 %	387133937
124	NC_017311	GGCG	2	8	62912	62919	0 %	0 %	75 %	25 %	387133937
125	NC_017311	TGCA	2	8	62959	62966	25 %	25 %	25 %	25 %	387133937
126	NC_017311	GTCC	2	8	63761	63768	0 %	25 %	25 %	50 %	387133938
127	NC_017311	GCGG	2	8	63771	63778	0 %	0 %	75 %	25 %	387133938
128	NC_017311	CAAC	2	8	64166	64173	50 %	0 %	0 %	50 %	387133938
129	NC_017311	GCGG	2	8	64199	64206	0 %	0 %	75 %	25 %	387133938
130	NC_017311	GCGG	2	8	64445	64452	0 %	0 %	75 %	25 %	387133938
131	NC_017311	GCAG	2	8	64779	64786	25 %	0 %	50 %	25 %	387133939
132	NC_017311	CCTT	2	8	65061	65068	0 %	50 %	0 %	50 %	387133939
133	NC_017311	GGCG	2	8	65116	65123	0 %	0 %	75 %	25 %	387133939
134	NC_017311	GGCA	2	8	65521	65528	25 %	0 %	50 %	25 %	387133939
135	NC_017311	GGGC	2	8	65812	65819	0 %	0 %	75 %	25 %	387133939
136	NC_017311	GGCG	2	8	65909	65916	0 %	0 %	75 %	25 %	387133939
137	NC_017311	GAAC	2	8	65947	65954	50 %	0 %	25 %	25 %	387133939
138	NC_017311	ACGG	2	8	66041	66048	25 %	0 %	50 %	25 %	387133939
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409	NC_017311	CAGC	2	8	198460	198467	25 %	0 %	25 %	50 %	387134039
410	NC_017311	CAGA	2	8	198671	198678	50 %	0 %	25 %	25 %	387134040
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417	NC_017311	GCAG	2	8	201369	201376	25 %	0 %	50 %	25 %	387134040

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.