MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 plasmid pDEVAL01

Total Repeats: 4344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017311	CGCC	2	8	136291	136298	0 %	0 %	25 %	75 %	387133989
3002	NC_017311	TGC	2	6	136308	136313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387133989
3003	NC_017311	GCC	2	6	136331	136336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387133989
3004	NC_017311	CGA	2	6	136354	136359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133989
3005	NC_017311	CTGCG	2	10	136449	136458	0 %	20 %	40 %	40 %	387133989
3006	NC_017311	GC	3	6	136482	136487	0 %	0 %	50 %	50 %	387133989
3007	NC_017311	GC	3	6	136538	136543	0 %	0 %	50 %	50 %	387133989
3008	NC_017311	ACC	2	6	136614	136619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387133989
3009	NC_017311	CAC	2	6	136625	136630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387133989
3010	NC_017311	GCC	2	6	136637	136642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387133989
3011	NC_017311	CGAAGA	2	12	136657	136668	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	387133989
3012	NC_017311	CTGC	2	8	136684	136691	0 %	25 %	25 %	50 %	387133989
3013	NC_017311	GTG	3	9	136707	136715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387133989
3014	NC_017311	GTG	2	6	136740	136745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387133989
3015	NC_017311	AGC	2	6	136749	136754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133989
3016	NC_017311	TGG	2	6	136756	136761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387133989
3017	NC_017311	CAT	2	6	136802	136807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387133989
3018	NC_017311	ACGA	2	8	136815	136822	50 %	0 %	25 %	25 %	387133989
3019	NC_017311	GCG	2	6	136858	136863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133989
3020	NC_017311	ATC	2	6	136878	136883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387133989
3021	NC_017311	ACC	3	9	136893	136901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387133989
3022	NC_017311	AGC	3	9	136902	136910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133989
3023	NC_017311	CGG	2	6	136948	136953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133989
3024	NC_017311	TCG	2	6	137027	137032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387133990
3025	NC_017311	TGCC	2	8	137033	137040	0 %	25 %	25 %	50 %	387133990
3026	NC_017311	CTG	2	6	137041	137046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387133990
3027	NC_017311	GC	3	6	137060	137065	0 %	0 %	50 %	50 %	387133990
3028	NC_017311	AGG	2	6	137066	137071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387133990
3029	NC_017311	GCG	2	6	137078	137083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133990
3030	NC_017311	GGT	2	6	137124	137129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387133990
3031	NC_017311	GCG	2	6	137135	137140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133990
3032	NC_017311	CGG	2	6	137166	137171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133990
3033	NC_017311	CGT	2	6	137211	137216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387133990
3034	NC_017311	GCA	2	6	137220	137225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133990
3035	NC_017311	GCG	2	6	137228	137233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133990
3036	NC_017311	GGC	2	6	137236	137241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133990
3037	NC_017311	GCG	2	6	137248	137253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133990
3038	NC_017311	GGC	2	6	137265	137270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133990
3039	NC_017311	AGGTAG	2	12	137279	137290	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	387133990
3040	NC_017311	CGG	2	6	137309	137314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133990
3041	NC_017311	CCA	2	6	137345	137350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387133991
3042	NC_017311	GTC	2	6	137382	137387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387133991
3043	NC_017311	GCA	2	6	137495	137500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133991
3044	NC_017311	CGGG	2	8	137516	137523	0 %	0 %	75 %	25 %	387133991
3045	NC_017311	GC	3	6	137547	137552	0 %	0 %	50 %	50 %	387133991
3046	NC_017311	GCG	2	6	137558	137563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133991
3047	NC_017311	GCA	2	6	137591	137596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133991
3048	NC_017311	GGC	2	6	137601	137606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133991
3049	NC_017311	GGGCC	2	10	137610	137619	0 %	0 %	60 %	40 %	387133991
3050	NC_017311	TGG	2	6	137627	137632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387133991
3051	NC_017311	GAA	2	6	137682	137687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387133991
3052	NC_017311	AGC	2	6	137748	137753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133992
3053	NC_017311	CGG	2	6	137755	137760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133992
3054	NC_017311	TCCACG	2	12	137766	137777	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387133992
3055	NC_017311	CAC	2	6	137810	137815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387133992
3056	NC_017311	CCG	2	6	137823	137828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387133992
3057	NC_017311	GCC	2	6	137834	137839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387133992
3058	NC_017311	GGCAC	2	10	137916	137925	20 %	0 %	40 %	40 %	387133992
3059	NC_017311	CAG	2	6	137939	137944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133992
3060	NC_017311	GTC	2	6	137948	137953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387133992
3061	NC_017311	GCC	2	6	137971	137976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387133992
3062	NC_017311	GCG	2	6	138054	138059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133992
3063	NC_017311	CCT	2	6	138084	138089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387133993
3064	NC_017311	AGC	2	6	138152	138157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133993
3065	NC_017311	CCGTC	2	10	138171	138180	0 %	20 %	20 %	60 %	387133993
3066	NC_017311	CCA	2	6	138321	138326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387133993
3067	NC_017311	AGC	2	6	138335	138340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133993
3068	NC_017311	TCA	2	6	138393	138398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387133993
3069	NC_017311	AGC	2	6	138428	138433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133993
3070	NC_017311	GTGC	2	8	138469	138476	0 %	25 %	50 %	25 %	387133993
3071	NC_017311	TCG	2	6	138554	138559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387133993
3072	NC_017311	CGTT	2	8	138566	138573	0 %	50 %	25 %	25 %	387133993
3073	NC_017311	TGG	2	6	138576	138581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387133993
3074	NC_017311	GGT	2	6	138598	138603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387133993
3075	NC_017311	GTC	3	9	138781	138789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387133993
3076	NC_017311	CGT	2	6	138804	138809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387133993
3077	NC_017311	GGC	2	6	138814	138819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133993
3078	NC_017311	CCT	2	6	138855	138860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387133993
3079	NC_017311	GC	3	6	138862	138867	0 %	0 %	50 %	50 %	387133993
3080	NC_017311	CCCTG	2	10	138873	138882	0 %	20 %	20 %	60 %	387133993
3081	NC_017311	GTC	2	6	139021	139026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387133993
3082	NC_017311	GGT	2	6	139027	139032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387133993
3083	NC_017311	CGG	2	6	139035	139040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133993
3084	NC_017311	CGG	2	6	139056	139061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133993
3085	NC_017311	AGC	2	6	139070	139075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133993
3086	NC_017311	GCG	2	6	139080	139085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133993
3087	NC_017311	CAG	2	6	139111	139116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133993
3088	NC_017311	TCGA	2	8	139193	139200	25 %	25 %	25 %	25 %	387133993
3089	NC_017311	GCC	2	6	140012	140017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387133994
3090	NC_017311	CGG	2	6	140040	140045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387133994
3091	NC_017311	GCC	2	6	140062	140067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387133994
3092	NC_017311	CGCAGG	2	12	140088	140099	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387133994
3093	NC_017311	GCGAGG	2	12	140112	140123	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	387133994
3094	NC_017311	CAC	2	6	140140	140145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387133994
3095	NC_017311	GCCACG	2	12	140150	140161	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387133994
3096	NC_017311	CGC	2	6	140189	140194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387133994
3097	NC_017311	CAT	2	6	140244	140249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387133995
3098	NC_017311	AAC	2	6	140260	140265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387133995
3099	NC_017311	ACA	2	6	140381	140386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387133995
3100	NC_017311	AAG	2	6	140389	140394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387133995
3101	NC_017311	AGG	2	6	140408	140413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387133995
3102	NC_017311	GCC	2	6	140428	140433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387133995
3103	NC_017311	GC	3	6	140446	140451	0 %	0 %	50 %	50 %	387133995
3104	NC_017311	AAC	2	6	140473	140478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387133995
3105	NC_017311	ACC	2	6	140485	140490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387133995
3106	NC_017311	CCG	2	6	140498	140503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387133995
3107	NC_017311	CTT	2	6	140514	140519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387133995
3108	NC_017311	AAC	2	6	140527	140532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387133995
3109	NC_017311	ACG	2	6	140555	140560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133995
3110	NC_017311	CAA	2	6	140568	140573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387133995
3111	NC_017311	ACA	2	6	140588	140593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387133995
3112	NC_017311	CAG	2	6	140596	140601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133995
3113	NC_017311	GCA	2	6	140637	140642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133995
3114	NC_017311	CAG	2	6	140713	140718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133995
3115	NC_017311	GCA	2	6	140873	140878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133996
3116	NC_017311	CCG	2	6	140923	140928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387133996
3117	NC_017311	CG	3	6	140958	140963	0 %	0 %	50 %	50 %	387133996
3118	NC_017311	ACG	2	6	140983	140988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387133996
3119	NC_017311	GCAG	2	8	141016	141023	25 %	0 %	50 %	25 %	387133996
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3121	NC_017311	CG	3	6	141149	141154	0 %	0 %	50 %	50 %	387133996
3122	NC_017311	GCC	2	6	141207	141212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387133996
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3231	NC_017311	CCTCAT	2	12	145506	145517	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	387134000
3232	NC_017311	GGT	2	6	145527	145532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387134000
3233	NC_017311	CGA	2	6	145569	145574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387134000
3234	NC_017311	CGC	2	6	145628	145633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387134000
3235	NC_017311	CG	3	6	145660	145665	0 %	0 %	50 %	50 %	387134000
3236	NC_017311	GGA	2	6	145711	145716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387134000
3237	NC_017311	GGC	2	6	145741	145746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387134000
3238	NC_017311	GCG	2	6	145807	145812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387134001
3239	NC_017311	CAT	2	6	145814	145819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387134001
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3241	NC_017311	GGT	2	6	145856	145861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387134001
3242	NC_017311	CAT	2	6	145907	145912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387134001
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3349	NC_017311	GGC	2	6	150928	150933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387134007
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3354	NC_017311	AGGC	2	8	151183	151190	25 %	0 %	50 %	25 %	387134007
3355	NC_017311	CTC	2	6	151228	151233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387134007
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3479	NC_017311	CGGGCG	2	12	155925	155936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387134012
3480	NC_017311	TCG	2	6	155939	155944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387134012
3481	NC_017311	TGC	2	6	155972	155977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387134012
3482	NC_017311	CGG	3	9	156009	156017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387134012
3483	NC_017311	TGG	2	6	156072	156077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387134012
3484	NC_017311	GCA	2	6	156116	156121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387134012
3485	NC_017311	C	7	7	156142	156148	0 %	0 %	0 %	100 %	387134012
3486	NC_017311	GAC	2	6	156160	156165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387134012
3487	NC_017311	CTG	2	6	156210	156215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387134013
3488	NC_017311	TTC	2	6	156228	156233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387134013
3489	NC_017311	TGA	2	6	156235	156240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387134013
3490	NC_017311	GTC	2	6	156267	156272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387134013
3491	NC_017311	GCA	2	6	156302	156307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387134013
3492	NC_017311	GCC	2	6	156311	156316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387134013
3493	NC_017311	CAT	2	6	156341	156346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387134013
3494	NC_017311	TCA	2	6	156358	156363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387134013
3495	NC_017311	ATC	2	6	156438	156443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387134013
3496	NC_017311	CTG	2	6	156447	156452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387134013
3497	NC_017311	AACGC	2	10	156487	156496	40 %	0 %	20 %	40 %	387134013
3498	NC_017311	CGA	2	6	156497	156502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387134013
3499	NC_017311	CCG	2	6	156547	156552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387134013
3500	NC_017311	CG	3	6	156571	156576	0 %	0 %	50 %	50 %	387134013

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