MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 68115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017310	TGT	2	6	156203	156208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387151989
3002	NC_017310	GTC	2	6	156303	156308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151989
3003	NC_017310	CG	3	6	156320	156325	0 %	0 %	50 %	50 %	387151989
3004	NC_017310	GAC	2	6	156348	156353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151989
3005	NC_017310	AG	4	8	156355	156362	50 %	0 %	50 %	0 %	387151989
3006	NC_017310	GTA	2	6	156417	156422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151989
3007	NC_017310	G	7	7	156423	156429	0 %	0 %	100 %	0 %	387151989
3008	NC_017310	ATG	2	6	156430	156435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151989
3009	NC_017310	GCA	2	6	156461	156466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151989
3010	NC_017310	GTC	2	6	156597	156602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151989
3011	NC_017310	ACC	2	6	156613	156618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151989
3012	NC_017310	GCCA	2	8	156658	156665	25 %	0 %	25 %	50 %	387151989
3013	NC_017310	GAA	2	6	157274	157279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151990
3014	NC_017310	AGT	2	6	157374	157379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151990
3015	NC_017310	CTT	2	6	157418	157423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151990
3016	NC_017310	CGC	2	6	157424	157429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151990
3017	NC_017310	CGC	3	9	157454	157462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151990
3018	NC_017310	GTC	2	6	157589	157594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151990
3019	NC_017310	CGC	2	6	157615	157620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151990
3020	NC_017310	CCG	2	6	157721	157726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151990
3021	NC_017310	TGC	2	6	157810	157815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151990
3022	NC_017310	GTG	2	6	157869	157874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151990
3023	NC_017310	CGC	2	6	157888	157893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151990
3024	NC_017310	CGA	2	6	157913	157918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151990
3025	NC_017310	GGT	2	6	158030	158035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151990
3026	NC_017310	ATG	2	6	158059	158064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151990
3027	NC_017310	GCT	2	6	158093	158098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151990
3028	NC_017310	GGCG	2	8	158128	158135	0 %	0 %	75 %	25 %	387151990
3029	NC_017310	CGG	2	6	158192	158197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151990
3030	NC_017310	CTG	2	6	158206	158211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151990
3031	NC_017310	CGG	2	6	158228	158233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151990
3032	NC_017310	GC	3	6	158391	158396	0 %	0 %	50 %	50 %	387151991
3033	NC_017310	ACC	3	9	158410	158418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151991
3034	NC_017310	GAA	2	6	158433	158438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151991
3035	NC_017310	GCA	2	6	158469	158474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151991
3036	NC_017310	AC	3	6	158483	158488	50 %	0 %	0 %	50 %	387151991
3037	NC_017310	ATC	2	6	158518	158523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151991
3038	NC_017310	GAA	2	6	158649	158654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151991
3039	NC_017310	CGG	2	6	158762	158767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151991
3040	NC_017310	CAAG	2	8	158768	158775	50 %	0 %	25 %	25 %	387151991
3041	NC_017310	GAA	2	6	158925	158930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151991
3042	NC_017310	GAT	2	6	159087	159092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151992
3043	NC_017310	GCA	2	6	159128	159133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151992
3044	NC_017310	GTG	2	6	159208	159213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151992
3045	NC_017310	GACG	2	8	159236	159243	25 %	0 %	50 %	25 %	387151992
3046	NC_017310	GCG	2	6	159300	159305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151992
3047	NC_017310	TAC	2	6	159332	159337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151992
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3049	NC_017310	GTGCA	2	10	159354	159363	20 %	20 %	40 %	20 %	387151992
3050	NC_017310	GGC	2	6	159418	159423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151992
3051	NC_017310	GTC	2	6	159471	159476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151992
3052	NC_017310	GCA	2	6	159518	159523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151992
3053	NC_017310	GC	3	6	159594	159599	0 %	0 %	50 %	50 %	387151992
3054	NC_017310	CG	3	6	159600	159605	0 %	0 %	50 %	50 %	387151992
3055	NC_017310	AGA	2	6	159631	159636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151992
3056	NC_017310	AT	3	6	159658	159663	50 %	50 %	0 %	0 %	387151992
3057	NC_017310	TGC	2	6	159664	159669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151992
3058	NC_017310	CGG	2	6	159704	159709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151992
3059	NC_017310	GCA	2	6	159715	159720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151992
3060	NC_017310	GTT	2	6	159780	159785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387151992
3061	NC_017310	TGCC	2	8	159800	159807	0 %	25 %	25 %	50 %	387151992
3062	NC_017310	C	6	6	159813	159818	0 %	0 %	0 %	100 %	387151992
3063	NC_017310	CTGT	2	8	159868	159875	0 %	50 %	25 %	25 %	387151992
3064	NC_017310	TCA	2	6	159880	159885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151992
3065	NC_017310	GAC	2	6	159939	159944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151992
3066	NC_017310	TCG	2	6	159949	159954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151992
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3069	NC_017310	CAG	2	6	160180	160185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151992
3070	NC_017310	GAT	2	6	160236	160241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151992
3071	NC_017310	GTC	2	6	160261	160266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151992
3072	NC_017310	GCC	2	6	160329	160334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151992
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3086	NC_017310	GCT	2	6	161121	161126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151992
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3101	NC_017310	GGC	2	6	161541	161546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151992
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3103	NC_017310	CGG	2	6	161584	161589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151992
3104	NC_017310	TGGCGT	2	12	161627	161638	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387151992
3105	NC_017310	GAC	2	6	161661	161666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151992
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3118	NC_017310	CGAC	2	8	162354	162361	25 %	0 %	25 %	50 %	387151992
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3120	NC_017310	GGC	2	6	162648	162653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151993
3121	NC_017310	CG	3	6	162717	162722	0 %	0 %	50 %	50 %	387151993
3122	NC_017310	TC	3	6	162842	162847	0 %	50 %	0 %	50 %	387151993
3123	NC_017310	CGGT	2	8	162859	162866	0 %	25 %	50 %	25 %	387151993
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3231	NC_017310	GCA	2	6	167839	167844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151995
3232	NC_017310	CCAC	2	8	167908	167915	25 %	0 %	0 %	75 %	387151995
3233	NC_017310	CCTT	2	8	167925	167932	0 %	50 %	0 %	50 %	387151995
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3239	NC_017310	GTC	2	6	168173	168178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151995
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3360	NC_017310	ACTGGC	2	12	173323	173334	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387152000
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3452	NC_017310	CGGG	2	8	177813	177820	0 %	0 %	75 %	25 %	387152002
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3468	NC_017310	TGG	2	6	178775	178780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152003
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3472	NC_017310	GGCGC	2	10	178878	178887	0 %	0 %	60 %	40 %	387152003
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3478	NC_017310	CGC	2	6	179093	179098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152004
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3480	NC_017310	CGC	2	6	179264	179269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152004
3481	NC_017310	TGG	2	6	179272	179277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152004
3482	NC_017310	CCG	2	6	179317	179322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152004
3483	NC_017310	TCT	2	6	179332	179337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152004
3484	NC_017310	GCT	2	6	179450	179455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152004
3485	NC_017310	GCG	2	6	179457	179462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152004
3486	NC_017310	CGT	2	6	179477	179482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152004
3487	NC_017310	TTC	2	6	179496	179501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152004
3488	NC_017310	CGG	2	6	179563	179568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152004
3489	NC_017310	CTG	2	6	179583	179588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152004
3490	NC_017310	TGCC	2	8	179613	179620	0 %	25 %	25 %	50 %	387152004
3491	NC_017310	CGCTGC	2	12	179663	179674	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387152004
3492	NC_017310	CTG	2	6	179709	179714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152004
3493	NC_017310	TTC	2	6	179721	179726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152004
3494	NC_017310	G	6	6	179744	179749	0 %	0 %	100 %	0 %	387152004
3495	NC_017310	TGG	2	6	179755	179760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152004
3496	NC_017310	GCG	2	6	179787	179792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152004
3497	NC_017310	GTG	2	6	179793	179798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152004
3498	NC_017310	CTCTT	2	10	179799	179808	0 %	60 %	0 %	40 %	387152004
3499	NC_017310	CTG	2	6	179820	179825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152004
3500	NC_017310	GTC	2	6	180124	180129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152005

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