MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 68115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_017310	TGC	2	6	104089	104094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151956
2003	NC_017310	TTCGG	2	10	104163	104172	0 %	40 %	40 %	20 %	387151956
2004	NC_017310	GCG	2	6	104223	104228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151956
2005	NC_017310	GAC	2	6	104231	104236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151956
2006	NC_017310	ACGA	2	8	104278	104285	50 %	0 %	25 %	25 %	387151956
2007	NC_017310	GCA	2	6	104339	104344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151956
2008	NC_017310	TGG	4	12	104380	104391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151956
2009	NC_017310	GCC	2	6	104433	104438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151956
2010	NC_017310	GAAT	2	8	104468	104475	50 %	25 %	25 %	0 %	387151956
2011	NC_017310	CAT	2	6	104510	104515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151956
2012	NC_017310	CGG	2	6	104524	104529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151956
2013	NC_017310	TAT	2	6	104549	104554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387151956
2014	NC_017310	GACGC	2	10	104556	104565	20 %	0 %	40 %	40 %	387151956
2015	NC_017310	TCG	2	6	104678	104683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151957
2016	NC_017310	GCC	2	6	104701	104706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151957
2017	NC_017310	ACA	2	6	104808	104813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151957
2018	NC_017310	ATC	2	6	104851	104856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151957
2019	NC_017310	C	6	6	104911	104916	0 %	0 %	0 %	100 %	387151957
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2021	NC_017310	GAC	2	6	104946	104951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151957
2022	NC_017310	GGC	2	6	105027	105032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151957
2023	NC_017310	CAA	2	6	105039	105044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151957
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2025	NC_017310	CGA	2	6	105195	105200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151957
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2029	NC_017310	TCTCG	2	10	105357	105366	0 %	40 %	20 %	40 %	387151957
2030	NC_017310	GGAC	2	8	105387	105394	25 %	0 %	50 %	25 %	387151957
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2122	NC_017310	GGT	2	6	109262	109267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151960
2123	NC_017310	TGG	3	9	109270	109278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151960
2124	NC_017310	GCT	2	6	109316	109321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151960
2125	NC_017310	ATG	2	6	109365	109370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151960
2126	NC_017310	CTT	2	6	109374	109379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151960
2127	NC_017310	GCA	2	6	109391	109396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151960
2128	NC_017310	CT	3	6	109409	109414	0 %	50 %	0 %	50 %	387151960
2129	NC_017310	CTG	2	6	109431	109436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151960
2130	NC_017310	GAC	2	6	109440	109445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151960
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2132	NC_017310	GGCG	2	8	109454	109461	0 %	0 %	75 %	25 %	387151960
2133	NC_017310	GCG	2	6	109506	109511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151960
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2136	NC_017310	CTG	2	6	109587	109592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151960
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2140	NC_017310	GCT	2	6	109703	109708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151960
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2142	NC_017310	GC	3	6	109745	109750	0 %	0 %	50 %	50 %	387151960
2143	NC_017310	TGGGC	2	10	109754	109763	0 %	20 %	60 %	20 %	387151960
2144	NC_017310	TAC	2	6	109770	109775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151960
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2147	NC_017310	TGG	3	9	109834	109842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151960
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2155	NC_017310	G	6	6	110079	110084	0 %	0 %	100 %	0 %	387151960
2156	NC_017310	GCA	2	6	110192	110197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151960
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2160	NC_017310	CG	3	6	110365	110370	0 %	0 %	50 %	50 %	387151960
2161	NC_017310	GGC	2	6	110429	110434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151960
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2224	NC_017310	ACT	2	6	113240	113245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151962
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2239	NC_017310	GTGCTG	2	12	114034	114045	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	387151962
2240	NC_017310	GGC	2	6	114076	114081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151962
2241	NC_017310	CGCC	2	8	114164	114171	0 %	0 %	25 %	75 %	387151962
2242	NC_017310	TTC	2	6	114217	114222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151962
2243	NC_017310	CAA	2	6	114231	114236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151962
2244	NC_017310	CGG	2	6	114266	114271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151962
2245	NC_017310	CGG	2	6	114363	114368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151962
2246	NC_017310	CGA	2	6	114378	114383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151962
2247	NC_017310	CATGGC	2	12	114399	114410	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387151962
2248	NC_017310	ACCG	2	8	114454	114461	25 %	0 %	25 %	50 %	387151962
2249	NC_017310	GGC	2	6	114471	114476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151962
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2253	NC_017310	CGT	2	6	114666	114671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151962
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2255	NC_017310	CAC	2	6	114708	114713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151962
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2262	NC_017310	GCAG	2	8	114999	115006	25 %	0 %	50 %	25 %	387151962
2263	NC_017310	CGA	2	6	115029	115034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151962
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2265	NC_017310	TCA	2	6	115091	115096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151962
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2347	NC_017310	CGA	2	6	118589	118594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151965
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2349	NC_017310	GTC	2	6	118628	118633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151965
2350	NC_017310	GT	3	6	118645	118650	0 %	50 %	50 %	0 %	387151965
2351	NC_017310	TCACCG	2	12	118678	118689	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387151965
2352	NC_017310	ACG	2	6	118729	118734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151965
2353	NC_017310	CGA	2	6	118742	118747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151965
2354	NC_017310	TGC	2	6	118786	118791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151965
2355	NC_017310	GCT	2	6	119080	119085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151966
2356	NC_017310	CTT	2	6	119104	119109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151966
2357	NC_017310	GTTC	2	8	119110	119117	0 %	50 %	25 %	25 %	387151966
2358	NC_017310	CAT	2	6	119201	119206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151966
2359	NC_017310	CGGG	2	8	119316	119323	0 %	0 %	75 %	25 %	387151966
2360	NC_017310	ACG	2	6	119343	119348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151966
2361	NC_017310	GCCC	2	8	119398	119405	0 %	0 %	25 %	75 %	387151966
2362	NC_017310	GGC	2	6	119428	119433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151966
2363	NC_017310	CTG	2	6	119474	119479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151966
2364	NC_017310	TGC	2	6	119499	119504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151966
2365	NC_017310	GTTC	2	8	119565	119572	0 %	50 %	25 %	25 %	387151966
2366	NC_017310	CGC	2	6	119692	119697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151966
2367	NC_017310	GCT	3	9	119728	119736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151966
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2472	NC_017310	GCG	2	6	125143	125148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151970
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2482	NC_017310	CGG	2	6	125411	125416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151970
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2484	NC_017310	AGA	2	6	125431	125436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151970
2485	NC_017310	GGC	2	6	125457	125462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151970
2486	NC_017310	TTC	2	6	125529	125534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151970
2487	NC_017310	CGG	2	6	125570	125575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151970
2488	NC_017310	CG	3	6	125579	125584	0 %	0 %	50 %	50 %	387151970
2489	NC_017310	CGC	2	6	125590	125595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151970
2490	NC_017310	G	6	6	125630	125635	0 %	0 %	100 %	0 %	387151970
2491	NC_017310	GC	3	6	125656	125661	0 %	0 %	50 %	50 %	387151970
2492	NC_017310	CGTG	2	8	125747	125754	0 %	25 %	50 %	25 %	387151970
2493	NC_017310	TGA	2	6	125809	125814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151970
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2497	NC_017310	CAG	2	6	125988	125993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151970
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2500	NC_017310	GTG	2	6	126157	126162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151970

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